25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_1364 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_1364  hypothetical protein  100 
 
 		 283 aa  550  1e-156  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0032  hypothetical protein  98.59 
 
 		 296 aa  541  1e-153  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0022  hypothetical protein  74.63 
 
 		 297 aa  411  1e-114  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2660  hypothetical protein  52.99 
 
 		 322 aa  263  2e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0986775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3339  hypothetical protein  48.07 
 
 		 293 aa  219  3.9999999999999997e-56  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2664  hypothetical protein  38.29 
 
 		 308 aa  158  1e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0541  hypothetical protein  35.32 
 
 		 332 aa  108  7.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.682132  normal  0.522386 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0544  hypothetical protein  32.12 
 
 		 384 aa  107  3e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.200606 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0285  hypothetical protein  34.2 
 
 		 359 aa  106  6e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.106647 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2558  putative signal peptide protein  33.92 
 
 		 330 aa  104  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.290858  normal  0.928742 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3882  hypothetical protein  31.62 
 
 		 345 aa  99.4  5e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0183166 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7563  hypothetical protein  31.43 
 
 		 358 aa  98.6  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0496  hypothetical protein  31.72 
 
 		 382 aa  96.3  5e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4044  hypothetical protein  31.18 
 
 		 339 aa  95.9  7e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.948145  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3072  hypothetical protein  31.6 
 
 		 339 aa  90.1  4e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3589  hypothetical protein  29.75 
 
 		 340 aa  88.2  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.340098 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1879  hypothetical protein  30.62 
 
 		 341 aa  84.7  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.237366  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0405  hypothetical protein  30.37 
 
 		 356 aa  79  0.00000000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.73431 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0500  hypothetical protein  30 
 
 		 359 aa  78.2  0.0000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2288  hypothetical protein  27.84 
 
 		 318 aa  71.6  0.00000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1708  hypothetical protein  31.32 
 
 		 385 aa  70.9  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.104403 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2327  hypothetical protein  30.08 
 
 		 352 aa  68.2  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.519854  normal  0.378191 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4143  hypothetical protein  26.87 
 
 		 353 aa  53.9  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.980511  normal  0.981417 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2766  hypothetical protein  25.08 
 
 		 384 aa  47.4  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.391487  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2751  hypothetical protein  29.68 
 
 		 332 aa  44.3  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.417793 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>