More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_0726 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_3489  argininosuccinate lyase  71.62 
 
 		 463 aa  654    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.169097 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4504  argininosuccinate lyase  71.62 
 
 		 459 aa  647    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.961173  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3062  argininosuccinate lyase  83.48 
 
 		 463 aa  748    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2536  argininosuccinate lyase  67.46 
 
 		 467 aa  638    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.696712 
 
 
-
 
NC_004310  BR1981  argininosuccinate lyase  67.53 
 
 		 466 aa  638    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0726  argininosuccinate lyase  100 
 
 		 471 aa  953    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3858  argininosuccinate lyase  66.81 
 
 		 467 aa  635    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.129189 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2381  argininosuccinate lyase  99.58 
 
 		 471 aa  949    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.746379 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0497  argininosuccinate lyase  79.61 
 
 		 476 aa  753    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3289  argininosuccinate lyase  71.4 
 
 		 463 aa  648    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.52202  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3732  argininosuccinate lyase  79.91 
 
 		 463 aa  753    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.663919 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3565  argininosuccinate lyase  67.24 
 
 		 466 aa  635    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.754251  normal  0.282214 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3211  argininosuccinate lyase  69.01 
 
 		 455 aa  640    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.575771 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3038  argininosuccinate lyase  69.25 
 
 		 473 aa  657    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2445  argininosuccinate lyase  96.6 
 
 		 471 aa  922    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.10802  normal  0.34117 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4017  argininosuccinate lyase  67.03 
 
 		 467 aa  636    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3612  argininosuccinate lyase  71.18 
 
 		 463 aa  644    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0999  argininosuccinate lyase  68.18 
 
 		 466 aa  644    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1906  argininosuccinate lyase  67.68 
 
 		 493 aa  639    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2022  argininosuccinate lyase  80.3 
 
 		 469 aa  770    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.61578  normal  0.73657 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1602  argininosuccinate lyase  67.9 
 
 		 460 aa  629  1e-179  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.715259  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3381  argininosuccinate lyase  68.75 
 
 		 476 aa  625  1e-178  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.407242 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7298  argininosuccinate lyase  71.68 
 
 		 462 aa  623  1e-177  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.341749  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0397  argininosuccinate lyase  67.04 
 
 		 478 aa  612  9.999999999999999e-175  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0817462  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5988  argininosuccinate lyase  72.98 
 
 		 462 aa  613  9.999999999999999e-175  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.156903 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0054  argininosuccinate lyase  65.43 
 
 		 466 aa  611  9.999999999999999e-175  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1738  argininosuccinate lyase  67.47 
 
 		 462 aa  608  1e-173  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.44445  normal  0.823311 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0936  argininosuccinate lyase  66.08 
 
 		 465 aa  608  1e-173  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1188  argininosuccinate lyase  69.32 
 
 		 466 aa  608  1e-173  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0735426 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5225  argininosuccinate lyase  66.08 
 
 		 465 aa  604  1.0000000000000001e-171  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3477  argininosuccinate lyase  65.21 
 
 		 465 aa  598  1e-170  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0715  argininosuccinate lyase  65.34 
 
 		 465 aa  595  1e-169  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.73431 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1145  argininosuccinate lyase  64.55 
 
 		 463 aa  595  1e-169  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0827  argininosuccinate lyase  65.86 
 
 		 465 aa  594  1e-169  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.332857  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4875  argininosuccinate lyase  64.33 
 
 		 488 aa  596  1e-169  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0745  argininosuccinate lyase  66.67 
 
 		 471 aa  594  1e-168  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.470577  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2371  argininosuccinate lyase  64.27 
 
 		 472 aa  588  1e-167  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.219426 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2677  argininosuccinate lyase  61.39 
 
 		 469 aa  560  1e-158  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2864  argininosuccinate lyase  62.42 
 
 		 458 aa  557  1e-157  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.15683  normal  0.0573198 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0937  argininosuccinate lyase  55.9 
 
 		 470 aa  556  1e-157  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.941991  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0201  argininosuccinate lyase  64.04 
 
 		 468 aa  545  1e-154  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0180  argininosuccinate lyase  54.37 
 
 		 471 aa  542  1e-153  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0125  argininosuccinate lyase  56.74 
 
 		 464 aa  520  1e-146  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0277  argininosuccinate lyase  57.17 
 
 		 464 aa  514  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0209  argininosuccinate lyase  56.54 
 
 		 458 aa  516  1.0000000000000001e-145  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000346068 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3641  argininosuccinate lyase  56.14 
 
 		 458 aa  512  1e-144  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0065  argininosuccinate lyase  56.3 
 
 		 464 aa  514  1e-144  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5489  argininosuccinate lyase  56.09 
 
 		 464 aa  508  1e-143  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0156  argininosuccinate lyase  56.48 
 
 		 458 aa  507  9.999999999999999e-143  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3145  argininosuccinate lyase  55.92 
 
 		 458 aa  506  9.999999999999999e-143  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.339392  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6009  argininosuccinate lyase  56.36 
 
 		 464 aa  505  9.999999999999999e-143  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.80635  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3748  argininosuccinate lyase  55.7 
 
 		 458 aa  507  9.999999999999999e-143  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0209  argininosuccinate lyase  55.43 
 
 		 464 aa  505  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.822129  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69500  argininosuccinate lyase  56.58 
 
 		 464 aa  507  9.999999999999999e-143  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.764994 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0184  argininosuccinate lyase  55.43 
 
 		 468 aa  504  1e-141  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47620  argininosuccinate lyase  56.36 
 
 		 464 aa  504  1e-141  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0206  argininosuccinate lyase  55.43 
 
 		 499 aa  504  1e-141  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0254  argininosuccinate lyase  55.43 
 
 		 464 aa  501  1e-140  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3168  argininosuccinate lyase  54.61 
 
 		 458 aa  499  1e-140  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0231  argininosuccinate lyase  54.07 
 
 		 458 aa  495  1e-139  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0490  argininosuccinate lyase  55.56 
 
 		 469 aa  496  1e-139  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0033  argininosuccinate lyase  55.93 
 
 		 467 aa  493  9.999999999999999e-139  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0796  argininosuccinate lyase  53.32 
 
 		 461 aa  493  9.999999999999999e-139  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2151  argininosuccinate lyase  54.21 
 
 		 475 aa  494  9.999999999999999e-139  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000172098  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0038  argininosuccinate lyase  53.9 
 
 		 468 aa  494  9.999999999999999e-139  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0015  argininosuccinate lyase  54.96 
 
 		 478 aa  491  9.999999999999999e-139  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.243165 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3590  argininosuccinate lyase  53.16 
 
 		 466 aa  486  1e-136  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2264  argininosuccinate lyase  51.93 
 
 		 491 aa  487  1e-136  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3670  argininosuccinate lyase  53.86 
 
 		 469 aa  486  1e-136  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.122063  normal  0.27596 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0095  argininosuccinate lyase  53.3 
 
 		 457 aa  485  1e-136  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2673  argininosuccinate lyase  53.7 
 
 		 468 aa  487  1e-136  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.973964  hitchhiker  0.00000000000598016 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0501  argininosuccinate lyase  55.14 
 
 		 467 aa  483  1e-135  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0110  argininosuccinate lyase  54.89 
 
 		 462 aa  484  1e-135  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3741  argininosuccinate lyase  55.29 
 
 		 464 aa  482  1e-135  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000875067 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0088  argininosuccinate lyase  52.64 
 
 		 457 aa  480  1e-134  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1111  argininosuccinate lyase  53.08 
 
 		 467 aa  480  1e-134  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.552146 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0607  argininosuccinate lyase  52.24 
 
 		 463 aa  475  1e-133  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3110  argininosuccinate lyase  53.9 
 
 		 467 aa  476  1e-133  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2418  argininosuccinate lyase  52.55 
 
 		 461 aa  473  1e-132  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00024267  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1024  argininosuccinate lyase  55.29 
 
 		 465 aa  471  1e-132  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.350248  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1229  argininosuccinate lyase  54.42 
 
 		 459 aa  470  1.0000000000000001e-131  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2700  argininosuccinate lyase  53.98 
 
 		 478 aa  468  1.0000000000000001e-131  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.622562 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2183  argininosuccinate lyase  53.71 
 
 		 468 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.013453 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5316  argininosuccinate lyase  49.69 
 
 		 493 aa  465  9.999999999999999e-131  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.32969  normal  0.657667 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1248  argininosuccinate lyase  53.45 
 
 		 465 aa  468  9.999999999999999e-131  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1361  argininosuccinate lyase  50.67 
 
 		 465 aa  468  9.999999999999999e-131  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.138182  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1433  argininosuccinate lyase  52.06 
 
 		 485 aa  466  9.999999999999999e-131  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.857857  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1608  argininosuccinate lyase  53.71 
 
 		 469 aa  461  1e-129  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.465799  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1067  argininosuccinate lyase  53.71 
 
 		 469 aa  461  1e-129  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.447898  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1949  argininosuccinate lyase  49.79 
 
 		 485 aa  462  1e-129  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.789721  decreased coverage  0.00358351 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0718  argininosuccinate lyase  53.71 
 
 		 469 aa  461  1e-129  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.4835  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3681  argininosuccinate lyase  52.13 
 
 		 462 aa  463  1e-129  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0695  argininosuccinate lyase  52.68 
 
 		 470 aa  462  1e-129  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.712566  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1219  argininosuccinate lyase  53.71 
 
 		 490 aa  462  1e-129  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.935194  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1065  argininosuccinate lyase  53.93 
 
 		 468 aa  464  1e-129  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1061  argininosuccinate lyase  53.71 
 
 		 469 aa  461  1e-129  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3415  argininosuccinate lyase  53.17 
 
 		 468 aa  463  1e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2875  argininosuccinate lyase  52.74 
 
 		 462 aa  462  1e-129  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.717741  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1295  argininosuccinate lyase  50 
 
 		 504 aa  463  1e-129  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.220763  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2295  argininosuccinate lyase  53.71 
 
 		 469 aa  461  1e-129  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>