75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_0040 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_0040  putative flagellar protein FliS  100 
 
 		 126 aa  257  3e-68  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1675  putative flagellar protein FliS  98.41 
 
 		 126 aa  254  3e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00959221 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1628  flagellin-specific chaperone FliS-like protein  85.71 
 
 		 129 aa  219  9.999999999999999e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.161225  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0995  flagellar protein FliS  30.53 
 
 		 121 aa  61.2  0.000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0212  flagellin-specific chaperone FliS-like protein  36.44 
 
 		 133 aa  60.1  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.523673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1722  flagellar protein FliS  33.05 
 
 		 136 aa  56.6  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0270358  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001171  flagellar biosynthesis protein FliS  30.95 
 
 		 128 aa  54.7  0.0000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.329244  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002810  flagellar biosynthesis protein FliS  31.03 
 
 		 136 aa  52.4  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04955  flagellin-specific chaperone FliS  30.95 
 
 		 128 aa  52.4  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03167  flagellar protein FliS  31.03 
 
 		 136 aa  52.8  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1448  flagellar protein FliS  29.85 
 
 		 144 aa  52  0.000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00104689  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0086  flagellar protein FliS  35.87 
 
 		 173 aa  51.6  0.000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.639004 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2313  flagellar protein FliS  26.72 
 
 		 136 aa  51.6  0.000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0633  flagellar protein FliS  29.06 
 
 		 153 aa  50.4  0.000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1496  flagellar protein FliS  28.8 
 
 		 132 aa  50.1  0.000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0407266  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0055  flagellar protein FliS  29.17 
 
 		 126 aa  48.9  0.00003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2302  flagellar protein FliS  29.57 
 
 		 136 aa  47.8  0.00005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.149284  normal  0.359463 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2123  flagellar protein FliS  41.67 
 
 		 135 aa  47.8  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0665218  hitchhiker  0.000000706832 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2176  flagellar protein FliS  41.67 
 
 		 135 aa  47.8  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.011809 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2118  flagellar protein FliS  41.67 
 
 		 135 aa  47.8  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.116386  normal  0.194151 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1159  flagellar protein FliS  41.67 
 
 		 135 aa  47.8  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0677314  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1282  flagellar protein FliS  41.67 
 
 		 135 aa  47.8  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0299336  normal  0.268792 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2942  flagellar protein FliS  29.52 
 
 		 136 aa  47.4  0.00007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.668615  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0119  flagellar protein FliS  30 
 
 		 146 aa  46.2  0.0001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.759612  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0187  flagellar protein FliS  28.91 
 
 		 132 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.158957  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3082  flagellar protein FliS  27.45 
 
 		 143 aa  45.8  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.699542  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2364  flagellar protein FliS  30.77 
 
 		 148 aa  45.1  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2120  flagellar protein FliS  37.31 
 
 		 301 aa  45.4  0.0003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.472713  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1891  flagellar protein FliS  29.31 
 
 		 138 aa  45.1  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.19694 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2832  flagellar protein FliS  31.07 
 
 		 130 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.106649  normal  0.0132865 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0061  flagellar protein FliS  27.27 
 
 		 126 aa  44.3  0.0006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0206  flagellar protein FliS  23.58 
 
 		 126 aa  43.9  0.0007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.555591 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2937  flagellar protein FliS  27.83 
 
 		 154 aa  43.9  0.0008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.706252  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24260  flagellar protein FliS  26.67 
 
 		 129 aa  43.9  0.0008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06167  flagellar protein FliS  28.45 
 
 		 137 aa  43.1  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.539325  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00999  flagellar protein FliS  28.45 
 
 		 137 aa  43.1  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00828362  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4661  flagellar protein FliS  28.1 
 
 		 129 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.227103 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1613  flagellar protein FliS  25.64 
 
 		 136 aa  43.1  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3356  flagellar protein FliS  28.12 
 
 		 130 aa  43.1  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.385304  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1894  flagellar protein FliS  30.56 
 
 		 135 aa  43.1  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2383  flagellar protein FliS  31.82 
 
 		 132 aa  43.5  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1537  flagellar protein FliS  37.29 
 
 		 135 aa  43.5  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.69968  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0704  flagellar protein FliS  25.86 
 
 		 145 aa  42.7  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.109575  normal  0.204071 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1432  flagellar protein FliS  26.96 
 
 		 136 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2931  flagellar protein FliS  26.96 
 
 		 136 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.991604  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3071  flagellar protein FliS  25.64 
 
 		 136 aa  43.5  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2284  flagellar protein FliS  31.82 
 
 		 132 aa  43.5  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0656  flagellar protein FliS  25 
 
 		 127 aa  43.1  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0557  flagellar protein FliS  27.54 
 
 		 136 aa  43.1  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00232757  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1319  flagellar protein FliS  27.83 
 
 		 136 aa  43.1  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2581  flagellar protein FliS  26.09 
 
 		 136 aa  43.5  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3453  flagellar protein FliS  30.88 
 
 		 126 aa  43.1  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1356  flagellar protein FliS  26.96 
 
 		 133 aa  42.7  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.260151  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1291  hypothetical protein  26.39 
 
 		 136 aa  42.7  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3954  flagellar protein FliS  30.88 
 
 		 126 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0846761  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1361  flagellar protein FliS  30.25 
 
 		 136 aa  42.4  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.997473 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0278  lateral flagellar chaperone protein LafC  28.12 
 
 		 130 aa  42.7  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00844444  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2032  flagellar protein FliS  27.62 
 
 		 132 aa  42.7  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.294814  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1290  hypothetical protein  26.76 
 
 		 136 aa  42  0.003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3637  flagellar protein FliS  29.41 
 
 		 126 aa  42  0.003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1487  flagellar protein FliS  28.43 
 
 		 145 aa  41.6  0.003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3233  flagellar protein FliS  26.09 
 
 		 136 aa  41.6  0.004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0503  flagellar protein FliS  27.12 
 
 		 140 aa  41.2  0.004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1640  flagellar protein FliS  34.29 
 
 		 137 aa  41.2  0.005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1593  flagellar protein FliS  31.48 
 
 		 150 aa  41.2  0.005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2021  flagellar protein FliS  30 
 
 		 132 aa  41.2  0.005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1978  flagellar protein FliS  26.47 
 
 		 137 aa  41.2  0.005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2387  flagellar protein FliS  32.84 
 
 		 136 aa  41.2  0.005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0620  flagellar protein FliS  27.36 
 
 		 137 aa  40.8  0.006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3810  flagellar protein FliS  27.12 
 
 		 141 aa  40.8  0.006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1574  flagellar protein FliS  34.29 
 
 		 137 aa  40.8  0.006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2572  flagellar protein FliS  30.84 
 
 		 136 aa  40.8  0.007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.680491  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0869  flagellar protein FliS  24.62 
 
 		 143 aa  40.4  0.007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1344  flagellar protein FliS  27.83 
 
 		 133 aa  40.8  0.007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1110  flagellar protein FliS  31.93 
 
 		 146 aa  40.4  0.009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.218751 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>