35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_4341 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_4341  plasmid stabilization system protein  100 
 
 		 97 aa  196  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0257549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1466  plasmid stabilization system protein  47.78 
 
 		 92 aa  79.3  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.151492  normal  0.426868 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4130  plasmid stabilization system protein  43.33 
 
 		 101 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0606  plasmid stabilization system  39.77 
 
 		 104 aa  67  0.00000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.145182  normal  0.235133 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1265  plasmid stabilization system  35.71 
 
 		 98 aa  58.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.526414  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4586  addiction module antitoxin  37.5 
 
 		 94 aa  57  0.00000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4398  addiction module toxin, RelE/StbE family  35.48 
 
 		 94 aa  50.8  0.000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.559354  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1695  plasmid stabilization system  35.96 
 
 		 93 aa  50.4  0.000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1531  plasmid stabilization system protein  35.16 
 
 		 96 aa  48.9  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.705517 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0843  plasmid stabilization system protein  33.71 
 
 		 94 aa  46.6  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.340698 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2336  addiction module toxin, RelE/StbE family  31.46 
 
 		 109 aa  46.6  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1115  addiction module antitoxin  35.11 
 
 		 97 aa  45.4  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4779  plasmid stabilization system protein  33.33 
 
 		 79 aa  45.1  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00246534  hitchhiker  0.00750512 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3526  addiction module antitoxin  35.16 
 
 		 89 aa  44.7  0.0004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0820981  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0195  plasmid stabilization system protein  29.21 
 
 		 91 aa  44.7  0.0005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.189135  n/a   
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3590  plasmid stabilization system protein  32.58 
 
 		 92 aa  44.7  0.0005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.221708  normal  0.630587 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2718  addiction module antitoxin  30.68 
 
 		 94 aa  43.9  0.0008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0444  plasmid stabilization system protein  37.8 
 
 		 91 aa  43.9  0.0008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000448662  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4865  hypothetical protein  37.14 
 
 		 103 aa  43.5  0.0009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.732793 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3300  addiction module toxin, RelE/StbE family  30 
 
 		 107 aa  43.1  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000161062  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3172  plasmid stabilization system  33.71 
 
 		 102 aa  42.7  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2089  addiction module toxin, RelE/StbE  29.03 
 
 		 100 aa  42.7  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.36704  normal  0.733737 
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0057  hypothetical protein  29.07 
 
 		 91 aa  41.6  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.8901  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1299  plasmid stabilization system  36.59 
 
 		 99 aa  42  0.003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1024  plasmid stabilization system  33.33 
 
 		 97 aa  41.2  0.004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1409  plasmid stabilization system protein  28.42 
 
 		 97 aa  41.2  0.004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0264  plasmid stabilization system  28.72 
 
 		 98 aa  41.2  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.685992  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0496  hypothetical protein  25.53 
 
 		 95 aa  41.2  0.005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000135473  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4998  addiction module antitoxin  30.34 
 
 		 96 aa  41.2  0.005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3831  plasmid stabilization system protein  29.67 
 
 		 99 aa  40.8  0.006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.338775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0056  plasmid stabilization system protein  26.04 
 
 		 95 aa  40.8  0.007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.834491  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0699  plasmid stabilization system protein  31.52 
 
 		 97 aa  40.4  0.008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.00627414  normal  0.782254 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02600  hypothetical protein  30.68 
 
 		 100 aa  40.4  0.009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2606  plasmid stabilization system protein  35.29 
 
 		 95 aa  40  0.009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.483194 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2783  plasmid stabilization system  28.09 
 
 		 94 aa  40  0.01  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.0000000825631  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>