148 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_3388 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007958  RPD_3388  cell division protein FtsQ  100 
 
 
330 aa  657    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00437684 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2002  cell division protein FtsQ  87.35 
 
 
332 aa  546  1e-154  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.684454 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4042  Polypeptide-transport-associated domain protein FtsQ-type  79.76 
 
 
329 aa  494  1e-139  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.544933  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3300  cell division protein FtsQ  73.57 
 
 
302 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6168  cell division protein FtsQ  72.66 
 
 
349 aa  391  1e-108  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0734462 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1056  cell division protein FtsQ  59.59 
 
 
340 aa  382  1e-105  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1284  cell division protein FtsQ  58.29 
 
 
346 aa  376  1e-103  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0326  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  42.26 
 
 
291 aa  215  9e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.256258  normal  0.674957 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2003  cell division protein FtsQ  36.51 
 
 
291 aa  177  2e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.470134  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3174  cell division protein FtsQ  37.34 
 
 
312 aa  177  2e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0135629  normal  0.583908 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2947  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  37.01 
 
 
312 aa  177  3e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.351672  normal  0.0843498 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2885  cell division protein  35.77 
 
 
309 aa  176  5e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.299972  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1427  cell division protein FtsQ, putative  38.08 
 
 
288 aa  175  9e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.387977  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1748  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  38.85 
 
 
295 aa  175  9e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1384  putative cell division protein FtsQ  37.69 
 
 
295 aa  174  1.9999999999999998e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2076  cell division protein FtsQ  36.36 
 
 
309 aa  172  5e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000439977 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3131  Polypeptide-transport-associated domain protein FtsQ-type  36.74 
 
 
312 aa  172  5.999999999999999e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.239632 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3493  cell division protein FtsQ  37.8 
 
 
326 aa  172  6.999999999999999e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.951015 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0696  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  36.9 
 
 
327 aa  171  1e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.362007  normal  0.309668 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0943  cell division protein FtsQ  37.6 
 
 
308 aa  168  1e-40  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000000489115  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6699  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  39.11 
 
 
324 aa  167  2e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2352  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  38.11 
 
 
317 aa  166  4e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.439239 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7438  cell division protein FtsQ  39.85 
 
 
327 aa  162  1e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.236131  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2588  cell division protein FtsQ  34.96 
 
 
310 aa  160  3e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2847  cell division protein FtsQ  36.33 
 
 
310 aa  159  5e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00692899 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2425  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  33.21 
 
 
334 aa  153  4e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00120327  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0946  cell division protein FtsQ  39.09 
 
 
331 aa  144  2e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0427417  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1137  cell division protein FtsQ  33.78 
 
 
320 aa  117  1.9999999999999998e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3942  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  33 
 
 
304 aa  107  2e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1877  cell division protein FtsQ  31.85 
 
 
312 aa  103  3e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.566658  normal  0.206127 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3166  Polypeptide-transport-associated domain protein FtsQ-type  32.86 
 
 
382 aa  103  4e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2073  cell division protein FtsQ  32.22 
 
 
299 aa  103  4e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.313808 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3659  cell division protein FtsQ  29.6 
 
 
303 aa  102  7e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.203733 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0067  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  34.5 
 
 
292 aa  98.6  1e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2418  putative cell division protein FtsQ  33.63 
 
 
297 aa  96.3  7e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.000895115  normal  0.230977 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2752  cell division protein FtsQ  30.13 
 
 
311 aa  94  3e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.417111  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0687  cell division protein FtsQ  28.69 
 
 
299 aa  86.7  4e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0983299  decreased coverage  0.000241 
 
 
-
 
NC_002978  WD0096  cell division protein FtsQ, putative  26.14 
 
 
252 aa  80.5  0.00000000000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0337  putative cell division protein FtsQ  24.9 
 
 
271 aa  72.8  0.000000000007  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.448058  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0744  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  34.76 
 
 
278 aa  72  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0312415  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2857  cell division protein FtsQ  26.64 
 
 
265 aa  69.7  0.00000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000000516173  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0666  Polypeptide-transport-associated domain protein FtsQ-type  29.57 
 
 
275 aa  66.6  0.0000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00317197  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3970  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  27.05 
 
 
275 aa  64.7  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.035895  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0788  cell division protein FtsQ  23.6 
 
 
308 aa  63.9  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.290421  normal  0.28339 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0669  cell division protein FtsQ  27.86 
 
 
275 aa  63.9  0.000000004  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.809619  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3285  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  29.08 
 
 
274 aa  62.8  0.000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.098326  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2112  cell division septal protein FtsQ  23.6 
 
 
308 aa  62.4  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0698  cell division protein FtsQ  24.26 
 
 
304 aa  62  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.68062  normal  0.40239 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1633  cell division protein FtsQ  34.13 
 
 
249 aa  60.5  0.00000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.317189 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0415  D-alanine--D-alanine ligase  28.33 
 
 
627 aa  59.3  0.00000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0512  Polypeptide-transport-associated domain protein FtsQ-type  28.23 
 
 
274 aa  58.9  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0639  cell division protein FtsQ  26.77 
 
 
280 aa  58.9  0.0000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000184858  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4489  cell division protein FtsQ  26.34 
 
 
340 aa  58.2  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.681161  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0953  Polypeptide-transport-associated domain protein FtsQ-type  31.16 
 
 
279 aa  57.8  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.358047 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0495  Polypeptide-transport-associated domain protein FtsQ-type  27.42 
 
 
274 aa  57.8  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.432001  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2449  cell division protein FtsQ  24.35 
 
 
279 aa  57  0.0000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0699952  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2092  Polypeptide-transport-associated domain protein FtsQ-type  27.97 
 
 
325 aa  55.1  0.000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.995763  hitchhiker  0.0000000659531 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0749  Polypeptide-transport-associated domain protein FtsQ-type  28.46 
 
 
273 aa  53.9  0.000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0143  cell division protein FtsQ  23.86 
 
 
276 aa  53.9  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00198063  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09470  cell division septal protein  32.86 
 
 
285 aa  53.9  0.000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000495605  normal  0.0238077 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0148  cell division protein FtsQ  23.86 
 
 
276 aa  53.9  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000728019  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0143  cell division protein FtsQ  23.86 
 
 
276 aa  53.9  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.216821  hitchhiker  0.00000339309 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0147  cell division protein FtsQ  23.86 
 
 
276 aa  53.9  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0183403  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3832  Polypeptide-transport-associated domain protein FtsQ-type  30.84 
 
 
294 aa  53.1  0.000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0140  cell division protein FtsQ  24.87 
 
 
276 aa  53.1  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.467459  normal  0.392627 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2198  cell division septal protein FtsQ  31.18 
 
 
282 aa  52.8  0.000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000214493  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2265  cell division protein FtsQ  24 
 
 
243 aa  52  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.245819  hitchhiker  0.00532421 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3916  Polypeptide-transport-associated domain protein FtsQ-type  29.91 
 
 
270 aa  51.6  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3776  cell division protein FtsQ  30.84 
 
 
293 aa  52  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.727696  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3568  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  24.49 
 
 
249 aa  51.2  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00488652  hitchhiker  0.0000000422237 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2087  cell division protein FtsQ  27.06 
 
 
263 aa  52  0.00002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.588433  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3892  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  28.7 
 
 
277 aa  51.2  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.880644  normal  0.345265 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1045  cell division protein FtsQ  28.26 
 
 
278 aa  50.8  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00015927  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3414  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  24.87 
 
 
263 aa  50.4  0.00004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0285361  normal  0.709755 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2611  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  28.12 
 
 
226 aa  50.4  0.00004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000621629  unclonable  0.00000000000366922 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0388  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  25.56 
 
 
249 aa  50.1  0.00005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.109832  hitchhiker  0.00233636 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3741  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  25.56 
 
 
249 aa  50.1  0.00005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0016419  hitchhiker  0.000000228967 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2784  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  28.97 
 
 
298 aa  50.1  0.00005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.397711  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2604  Polypeptide-transport-associated domain protein FtsQ-type  25.74 
 
 
276 aa  50.1  0.00006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0851  chaperonin Cpn60/TCP-1  20.37 
 
 
285 aa  49.7  0.00007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.127237  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1078  cell division protein FtsQ  25.42 
 
 
267 aa  49.7  0.00007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0136029  normal  0.503505 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0489  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  25.21 
 
 
249 aa  49.7  0.00008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000145309  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4217  cell division protein FtsQ  25.69 
 
 
262 aa  49.3  0.00009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1116  Polypeptide-transport-associated domain protein FtsQ-type  25.2 
 
 
295 aa  48.5  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00697393  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0847  cell division protein FtsQ  27.21 
 
 
261 aa  48.5  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0360907  normal  0.845904 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0412  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  26.29 
 
 
254 aa  48.9  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.466864  hitchhiker  0.00145589 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0488  Polypeptide-transport-associated domain protein FtsQ-type  28.99 
 
 
362 aa  48.1  0.0002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000268225  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3802  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  24.49 
 
 
256 aa  48.1  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0128831  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0403  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  25.45 
 
 
262 aa  48.1  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000561241  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3809  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  22.54 
 
 
262 aa  47.8  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000142789  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13280  Cell division protein FtsQ  31.25 
 
 
286 aa  48.1  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.021703  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3507  cell division protein FtsQ  23.74 
 
 
276 aa  47.8  0.0003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000541372  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4099  cell division protein FtsQ  32.91 
 
 
289 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.36601  normal  0.551196 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0829  cell division septal protein-like protein  20.95 
 
 
249 aa  47.4  0.0003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0862377  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0415  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  25 
 
 
262 aa  47.4  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.235658  hitchhiker  0.0000875019 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3564  cell division protein FtsQ  23.74 
 
 
276 aa  47.8  0.0003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0148979  normal  0.0119614 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0429  cell division protein FtsQ  25 
 
 
249 aa  47.4  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000800756  hitchhiker  0.0000000000534186 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00094  membrane anchored protein involved in growth of wall at septum  23.74 
 
 
276 aa  47  0.0004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0158467  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0404  cell division protein FtsQ  25 
 
 
262 aa  47  0.0004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00313866  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0098  cell division protein FtsQ  23.74 
 
 
276 aa  47  0.0004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000317726  normal  0.746071 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>