More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_2079 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_2079  OmpA/MotB  100 
 
 		 273 aa  557  1e-158  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.299736  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3363  OmpA/MotB  89.74 
 
 		 273 aa  514  1.0000000000000001e-145  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0104995 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2221  OmpA/MotB domain protein  87.96 
 
 		 274 aa  503  1e-141  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.172808  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2101  OmpA/MotB  80 
 
 		 275 aa  458  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.61631 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1496  OmpA/MotB  72.83 
 
 		 276 aa  421  1e-117  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.166046  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1237  OmpA/MotB  71.38 
 
 		 276 aa  416  9.999999999999999e-116  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.258144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3511  putative chemotaxis protein MotB  74.06 
 
 		 276 aa  410  1e-113  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2459  OmpA/MotB  69.09 
 
 		 283 aa  377  1e-104  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.141596  normal  0.174872 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2834  OmpA/MotB  63.24 
 
 		 286 aa  357  9.999999999999999e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.155442  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2804  OmpA/MotB  62.64 
 
 		 274 aa  347  1e-94  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.218866 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3243  OmpA/MotB domain protein  62.87 
 
 		 285 aa  344  7e-94  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.612152  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3057  OmpA/MotB domain-containing protein  55.11 
 
 		 277 aa  293  2e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.102068  normal  0.0344609 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4558  OmpA/MotB domain protein  54.01 
 
 		 277 aa  289  4e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5298  OmpA/MotB domain protein  51.65 
 
 		 277 aa  284  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4831  OmpA/MotB domain-containing protein  51.65 
 
 		 277 aa  284  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.540375 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5376  OmpA/MotB domain protein  50.92 
 
 		 277 aa  281  6.000000000000001e-75  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.590786  normal  0.352041 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2886  OmpA/MotB domain-containing protein  36.77 
 
 		 298 aa  189  4e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00198086 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3061  OmpA/MotB domain-containing protein  35.59 
 
 		 299 aa  182  4.0000000000000006e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1978  OmpA/MotB domain-containing protein  38.18 
 
 		 286 aa  180  2e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0364656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1555  OmpA/MotB domain-containing protein  32.5 
 
 		 307 aa  161  1e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00240809  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1843  OmpA/MotB  38.85 
 
 		 360 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0226  OmpA/MotB domain-containing protein  32.56 
 
 		 346 aa  110  3e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.174216  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1434  OmpA/MotB  28.63 
 
 		 296 aa  109  5e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3816  OmpA/MotB domain-containing protein  29.37 
 
 		 313 aa  108  7.000000000000001e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.983249 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3089  OmpA/MotB domain protein  29.37 
 
 		 313 aa  108  1e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4952  chemotaxis motB protein  30.27 
 
 		 341 aa  105  1e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.457077  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0603  OmpA/MotB domain-containing protein  27.21 
 
 		 345 aa  105  1e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0513  flagellar motor protein MotB  32.57 
 
 		 355 aa  103  3e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.787426  normal  0.766488 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2778  OmpA/MotB domain-containing protein  27.24 
 
 		 319 aa  102  6e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4409  OmpA/MotB domain-containing protein  27.27 
 
 		 312 aa  101  1e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1901  OmpA/MotB domain-containing protein  40.24 
 
 		 371 aa  100  2e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.686994  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0562  flagellar motor protein MotB  30.27 
 
 		 349 aa  100  3e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0723  flagellar motor protein MotB  28.83 
 
 		 316 aa  100  3e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.413121 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1504  OmpA/MotB domain-containing protein  30.98 
 
 		 285 aa  100  3e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.962914  normal  0.610699 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2919  OmpA/MotB  27.38 
 
 		 287 aa  99.8  4e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4422  OmpA/MotB domain-containing protein  26.81 
 
 		 327 aa  99.4  6e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.66197 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1000  OmpA/MotB domain-containing protein  28.68 
 
 		 320 aa  99.4  6e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0625  flagellar motor protein MotB  29.77 
 
 		 329 aa  99  7e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.749766 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24330  Flagellar motor protein  28.46 
 
 		 306 aa  99  7e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4904  flagellar motor protein MotB  29.34 
 
 		 346 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3688  flagellar motor protein MotB  29.06 
 
 		 325 aa  97.4  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0125108 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65430  flagellar motor protein MotB  29.41 
 
 		 347 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4780  flagellar motor protein MotB  28.96 
 
 		 346 aa  96.7  4e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5682  flagellar motor protein MotB  29.04 
 
 		 342 aa  96.3  5e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3703  OmpA/MotB  28.26 
 
 		 314 aa  96.3  5e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.618004  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5607  flagellar motor protein MotB  25.65 
 
 		 325 aa  95.9  6e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.707499  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3453  OmpA/MotB domain protein  26.81 
 
 		 368 aa  94  2e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.47019 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4696  flagellar motor protein MotB  29.06 
 
 		 339 aa  93.2  4e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0117  flagellar motor protein MotB  26.39 
 
 		 335 aa  92.8  5e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0416  flagellar motor protein MotB  29.45 
 
 		 318 aa  92.8  6e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0032919  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2138  flagellar motor protein MotB  27.72 
 
 		 309 aa  92.4  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.171106  hitchhiker  1.07849e-26 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2078  flagellar motor protein MotB  27.72 
 
 		 309 aa  92.4  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000517437  hitchhiker  0.0000035 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1199  flagellar motor protein MotB  27.72 
 
 		 309 aa  92.4  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00894206  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2083  flagellar motor protein MotB  27.72 
 
 		 309 aa  92.4  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.375305  hitchhiker  2.85081e-24 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1322  flagellar motor protein MotB  27.72 
 
 		 309 aa  92.4  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.300198  hitchhiker  5.1879400000000003e-23 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1410  flagellar motor protein MotB  26.47 
 
 		 314 aa  91.3  1e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.296374 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1036  OmpA/MotB domain protein  28.15 
 
 		 358 aa  91.7  1e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3817  flagellar motor protein MotB  25.65 
 
 		 335 aa  91.7  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0193  OmpA/MotB domain-containing protein  29.09 
 
 		 313 aa  90.1  4e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4957  flagellar motor protein MotB  27.8 
 
 		 350 aa  89.7  4e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.782956 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01860  flagellar motor protein MotB  27.34 
 
 		 308 aa  89.7  5e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0228996  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1751  OmpA/MotB domain protein  27.34 
 
 		 308 aa  89.7  5e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0290183  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1985  flagellar motor protein MotB  27.34 
 
 		 308 aa  89.7  5e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000595029  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2122  flagellar motor protein MotB  27.34 
 
 		 308 aa  89.7  5e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000245861  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01849  hypothetical protein  27.34 
 
 		 308 aa  89.7  5e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0472674  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1743  flagellar motor protein MotB  27.34 
 
 		 308 aa  89.7  5e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1295  flagellar motor protein MotB  27.34 
 
 		 308 aa  89.7  5e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00197011  hitchhiker  0.000000685167 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2628  flagellar motor protein MotB  27.34 
 
 		 308 aa  89.7  5e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00566133  hitchhiker  0.0000000000155511 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4046  flagellar motor protein MotB  28.09 
 
 		 315 aa  89.7  5e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.475556  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4158  flagellar motor protein MotB  28.09 
 
 		 315 aa  89.7  5e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.270622  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3226  OmpA/MotB domain protein  26.01 
 
 		 330 aa  89  8e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0410363  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1308  flagellar motor protein MotB  26.97 
 
 		 308 aa  89  8e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4204  OmpA/MotB domain-containing protein  26.62 
 
 		 327 aa  88.2  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1511  flagellar motor protein MotB  26.88 
 
 		 377 aa  88.2  1e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0155028  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2767  flagellar motor protein MotB  28.95 
 
 		 314 aa  87.8  2e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.400451 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0834  flagellar motor protein MotB  27.97 
 
 		 280 aa  87.4  2e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.252047  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01177  flagellar motor protein MotB  28.43 
 
 		 314 aa  87.8  2e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2976  flagellar motor protein MotB  24.72 
 
 		 369 aa  87.8  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000103067 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2986  OmpA/MotB domain-containing protein  26.89 
 
 		 321 aa  87.8  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.543248  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1323  flagellar motor protein MotB  29.14 
 
 		 305 aa  87.4  2e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2826  flagellar motor protein MotB  27.44 
 
 		 421 aa  86.7  4e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.156984 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3184  flagellar motor protein MotB  27.6 
 
 		 344 aa  86.7  4e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.12888  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004254  Flagellar motor rotation protein MotB  28.43 
 
 		 315 aa  86.7  4e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.145815  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3350  hypothetical protein  28.52 
 
 		 307 aa  86.7  4e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.935106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1637  flagellar motor protein MotB  27.44 
 
 		 433 aa  86.3  5e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2873  chemotaxis signal transduction protein CheY  25.37 
 
 		 320 aa  86.3  6e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1321  chemotaxis MotB protein  27.92 
 
 		 290 aa  85.9  6e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0163  flagellar motor protein MotB  27.31 
 
 		 338 aa  85.9  7e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.724048  normal  0.748844 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3938  flagellar motor protein MotB  27.02 
 
 		 340 aa  85.9  7e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.249786  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0079  flagellar motor protein MotB  27.02 
 
 		 340 aa  85.9  7e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3857  flagellar motor protein MotB  27.02 
 
 		 340 aa  85.9  7e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.347462  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0167  flagellar motor protein MotB  26.67 
 
 		 339 aa  85.9  7e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.850348  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1748  flagellar motor protein MotB  27.44 
 
 		 451 aa  85.5  8e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.540445  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0284  hypothetical protein  28.15 
 
 		 307 aa  85.5  8e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.179878  normal  0.584147 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2640  OmpA/MotB domain-containing protein  26.42 
 
 		 301 aa  85.5  9e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0239929  hitchhiker  0.00000281667 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16770  OmpA/MotB domain protein  26.69 
 
 		 245 aa  84.7  0.000000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000188615  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0180  flagellar motor protein MotB  26.3 
 
 		 339 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1244  flagellar motor protein MotB  25.75 
 
 		 319 aa  85.1  0.000000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3482  OmpA/MotB family outer membrane protein  26.72 
 
 		 264 aa  84.7  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.300073  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4157  OmpA/MotB domain protein  26.17 
 
 		 315 aa  84.7  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>