More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_0172 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_0172  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  100 
 
 		 268 aa  533  1e-150  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0661  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  88.06 
 
 		 268 aa  482  1e-135  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.171076 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0438  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  84.7 
 
 		 268 aa  462  1e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0045  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  86.05 
 
 		 268 aa  444  1e-123  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0184  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  79.1 
 
 		 268 aa  434  1e-120  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0223  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  78.36 
 
 		 268 aa  429  1e-119  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0165  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  77.61 
 
 		 268 aa  426  1e-118  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1339  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  60.46 
 
 		 268 aa  311  7.999999999999999e-84  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.500427  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1042  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  60.46 
 
 		 268 aa  307  1.0000000000000001e-82  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0981  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  60.46 
 
 		 268 aa  307  1.0000000000000001e-82  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3134  undecaprenol kinase  59.23 
 
 		 267 aa  295  4e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.112923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2664  undecaprenol kinase  54.71 
 
 		 283 aa  291  5e-78  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.763121  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2387  undecaprenol kinase  54.71 
 
 		 283 aa  291  6e-78  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.371551  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2344  undecaprenol kinase  55.07 
 
 		 283 aa  290  2e-77  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.373318  normal  0.511472 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0215  undecaprenol kinase  56.92 
 
 		 267 aa  288  8e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.086247  normal  0.101767 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1807  putative undecaprenol kinase  54.37 
 
 		 305 aa  286  2e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.181761 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0342  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  56.11 
 
 		 268 aa  286  4e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.359118  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5424  undecaprenol kinase  55.38 
 
 		 267 aa  285  5e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.196856  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0491  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  57.09 
 
 		 267 aa  278  7e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3600  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  55.77 
 
 		 268 aa  277  1e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.46457  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2777  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  53.64 
 
 		 268 aa  268  5e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3536  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  55.34 
 
 		 268 aa  256  2e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4952  undecaprenol kinase  48.28 
 
 		 269 aa  245  6.999999999999999e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.181278  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1150  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  53.26 
 
 		 268 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2811  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  53.26 
 
 		 268 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0660  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  49.43 
 
 		 266 aa  239  2.9999999999999997e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.484694  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1803  undecaprenyl-diphosphatase  43.3 
 
 		 274 aa  222  4e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3911  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  43.48 
 
 		 274 aa  221  9.999999999999999e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.971471  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28720  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  45.25 
 
 		 277 aa  221  9.999999999999999e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2175  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  45.28 
 
 		 276 aa  219  3e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0169688 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1120  putative undecaprenol kinase  44.4 
 
 		 268 aa  219  3e-56  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.8331  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4274  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  45.77 
 
 		 267 aa  219  3.9999999999999997e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2919  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  45.28 
 
 		 276 aa  218  1e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.151391  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3184  undecaprenyl-diphosphatase  44.03 
 
 		 270 aa  216  2.9999999999999998e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2602  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  44.14 
 
 		 276 aa  216  4e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.273889  normal  0.522739 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3826  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  43.8 
 
 		 277 aa  216  4e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.98827 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2137  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  46.24 
 
 		 266 aa  215  7e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3674  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  45.12 
 
 		 274 aa  215  7e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2862  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  44.05 
 
 		 277 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0666  undecaprenol kinase, putative  45.14 
 
 		 273 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3337  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  43.31 
 
 		 277 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.712485  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2756  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  44.88 
 
 		 276 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0481  undecaprenol kinase  40.61 
 
 		 267 aa  213  2.9999999999999995e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2827  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  44.05 
 
 		 276 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1864  undecaprenol kinase  42.47 
 
 		 266 aa  213  2.9999999999999995e-54  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.114213  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0701  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  40.94 
 
 		 293 aa  212  5.999999999999999e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0205173  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39190  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  42.91 
 
 		 277 aa  211  7.999999999999999e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0708152  normal  0.2464 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0887  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  45.14 
 
 		 276 aa  211  9e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.763797  normal  0.521518 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0438  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  45.14 
 
 		 276 aa  211  9e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0621374  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0917  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  45.14 
 
 		 276 aa  211  9e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.319747  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3008  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  43.08 
 
 		 276 aa  211  1e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.112856  normal  0.65432 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2286  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  44.88 
 
 		 273 aa  211  1e-53  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0805  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  44.75 
 
 		 276 aa  210  2e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.838445  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0610  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  40.94 
 
 		 293 aa  208  7e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00505052  normal  0.427706 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2527  undecaprenyl-diphosphatase  42.86 
 
 		 269 aa  208  9e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3141  undecaprenol kinase, putative  42.29 
 
 		 276 aa  207  1e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0312713  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2474  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  45.35 
 
 		 276 aa  207  1e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0757  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  41.39 
 
 		 293 aa  206  2e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0651  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  41.09 
 
 		 293 aa  207  2e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0689284 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0794  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  45.56 
 
 		 276 aa  207  2e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4021  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  45.74 
 
 		 276 aa  205  5e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.597407 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3344  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  40.86 
 
 		 277 aa  205  6e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1829  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  41.63 
 
 		 277 aa  205  7e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1912  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  42.02 
 
 		 270 aa  204  1e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.148488 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2042  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  42.06 
 
 		 274 aa  204  2e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.493495  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0858  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  42.91 
 
 		 278 aa  203  3e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0605  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  42.8 
 
 		 278 aa  202  5e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2692  undecaprenyl-diphosphatase  43.41 
 
 		 276 aa  202  6e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2269  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  40.08 
 
 		 275 aa  200  1.9999999999999998e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.887716  normal  0.0632294 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1356  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  40.08 
 
 		 277 aa  200  1.9999999999999998e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0826661 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1072  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  41.31 
 
 		 274 aa  200  3e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.406664  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3591  putative undecaprenol kinase  44.36 
 
 		 286 aa  199  3.9999999999999996e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.115804 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1152  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  41.6 
 
 		 274 aa  199  3.9999999999999996e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2705  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  40.22 
 
 		 293 aa  198  7.999999999999999e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.965795 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4278  putative undecaprenol kinase  43.23 
 
 		 306 aa  197  1.0000000000000001e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000318908  normal  0.0359854 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2289  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  40.84 
 
 		 274 aa  197  1.0000000000000001e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00352871  normal  0.150685 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1983  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  40 
 
 		 280 aa  197  2.0000000000000003e-49  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0554985  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3618  undecaprenol kinase  41.73 
 
 		 266 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.359359 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3119  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  42.91 
 
 		 278 aa  194  1e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.592205  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3599  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.92 
 
 		 274 aa  193  2e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.59164  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1245  undecaprenol kinase  40.48 
 
 		 258 aa  192  4e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.123014 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0569  putative undecaprenol kinase  43.31 
 
 		 265 aa  192  5e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1705  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.62 
 
 		 280 aa  191  8e-48  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0252604  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0259  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  42.11 
 
 		 303 aa  191  1e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.560106  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0541  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  36.67 
 
 		 283 aa  188  8e-47  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0858873  unclonable  0.00000000134855 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0285  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  43.38 
 
 		 281 aa  187  2e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.782685  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1046  undecaprenyl-diphosphatase  39.34 
 
 		 285 aa  186  3e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.500366  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0949  undecaprenyl-diphosphatase  39.36 
 
 		 263 aa  185  6e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.497251  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1051  undecaprenol kinase, putative  41.57 
 
 		 274 aa  185  7e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.566548  normal  0.338834 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1407  undecaprenol kinase  37.8 
 
 		 268 aa  183  2.0000000000000003e-45  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1890  Undecaprenyl-diphosphatase  39.13 
 
 		 278 aa  184  2.0000000000000003e-45  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0452  undecaprenol kinase  41.25 
 
 		 258 aa  184  2.0000000000000003e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.825456  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1321  undecaprenol kinase  42.75 
 
 		 252 aa  182  3e-45  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1512  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  42.02 
 
 		 276 aa  181  1e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.13116  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3350  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  42.47 
 
 		 270 aa  180  2e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3488  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  42.47 
 
 		 273 aa  180  2e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0437  putative undecaprenol kinase  41.15 
 
 		 258 aa  180  2e-44  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.222159  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3520  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  42.47 
 
 		 273 aa  180  2e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.483237  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0643  undecaprenol kinase  42.08 
 
 		 273 aa  179  4.999999999999999e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0008288  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02877  hypothetical protein  42.08 
 
 		 273 aa  179  4.999999999999999e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00183865  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>