51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_4679 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_4679  hypothetical protein  100 
 
 		 185 aa  384  1e-106  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1390  hypothetical protein  49.17 
 
 		 185 aa  181  6e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.174418  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48950  Fe-only nitrogenase accessory protein AnfR  39.67 
 
 		 183 aa  154  6e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.281704  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1618  hypothetical protein  38.29 
 
 		 196 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4235  AIG2 family protein  32.43 
 
 		 152 aa  77.8  0.00000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.729154  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3818  AIG2 family protein  31.76 
 
 		 151 aa  69.7  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.165251 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2848  AIG2 family protein  36.3 
 
 		 159 aa  68.9  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3184  AIG2 family protein  29.17 
 
 		 143 aa  59.3  0.00000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.594418  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3222  AIG2 family protein  31.03 
 
 		 143 aa  58.2  0.00000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.310927  normal  0.865494 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0695  hypothetical protein  30.92 
 
 		 146 aa  57  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0384  AIG2 family protein  28.08 
 
 		 138 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.59285 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2997  AIG2 family protein  28.47 
 
 		 143 aa  57  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0781  AIG2 family protein  29.61 
 
 		 151 aa  55.1  0.0000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00347473 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1879  AIG2 family protein  28 
 
 		 140 aa  54.7  0.0000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.355393  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13333  hypothetical protein  30.2 
 
 		 159 aa  54.3  0.0000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1248  hypothetical protein  29.11 
 
 		 159 aa  51.2  0.000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1265  hypothetical protein  29.11 
 
 		 159 aa  51.2  0.000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.963668 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1275  hypothetical protein  29.11 
 
 		 159 aa  51.2  0.000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.764782  normal  0.492102 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2712  hypothetical protein  26.2 
 
 		 180 aa  50.4  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.572174  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5929  AIG2 family protein  28 
 
 		 146 aa  50.8  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0854183  normal  0.0117669 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4823  hypothetical protein  29.53 
 
 		 157 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.127421 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0836  hypothetical protein  28.67 
 
 		 151 aa  49.7  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0694288  normal  0.0239506 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1618  hypothetical protein  29.53 
 
 		 157 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.012818 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6403  AIG2 family protein  31.08 
 
 		 153 aa  49.3  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2748  AIG2 family protein  29.37 
 
 		 143 aa  49.3  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.197201  normal  0.222089 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3919  hypothetical protein  26.62 
 
 		 150 aa  48.9  0.00004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.101501  normal  0.0594638 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0424  hypothetical protein  25.64 
 
 		 149 aa  48.1  0.00008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.196987  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2771  AIG2 family protein  27.63 
 
 		 494 aa  47.8  0.00008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3911  AIG2 family protein  27.69 
 
 		 152 aa  47.4  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.195524  normal  0.21706 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2442  hypothetical protein  22.82 
 
 		 163 aa  46.6  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.170561  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1284  AIG2 family protein  26.75 
 
 		 153 aa  45.8  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4028  hypothetical protein  28.66 
 
 		 175 aa  44.7  0.0008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0119928  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05740  AIG2-like family protein  30.67 
 
 		 170 aa  43.5  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2465  AIG2 family protein  27.89 
 
 		 187 aa  43.1  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.564633 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1791  AIG2 family protein  28.86 
 
 		 160 aa  43.5  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.646664  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0688  AIG2 family protein  28.48 
 
 		 169 aa  43.1  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.979058  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10218  hypothetical protein  30.61 
 
 		 478 aa  42.7  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.47441 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1254  hypothetical protein  32.43 
 
 		 133 aa  42.7  0.003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00409915  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4748  hypothetical protein  27.59 
 
 		 353 aa  42.7  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4454  hypothetical protein  27.59 
 
 		 353 aa  42.7  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.159304  normal  0.0629243 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2566  hypothetical protein  27.81 
 
 		 191 aa  43.1  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0683138  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4367  hypothetical protein  27.59 
 
 		 353 aa  42.7  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10941  hypothetical protein  25.3 
 
 		 354 aa  42.4  0.004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1359  AIG2 family protein  28.95 
 
 		 149 aa  42.4  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.158824  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1634  hypothetical protein  32 
 
 		 155 aa  41.6  0.006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00186132  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4181  AIG2 family protein  31.17 
 
 		 156 aa  41.6  0.006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.381247  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1231  hypothetical protein  25.4 
 
 		 133 aa  41.6  0.006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0164276  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4226  AIG2 family protein  27.59 
 
 		 324 aa  41.6  0.006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.745683  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4144  hypothetical protein  27.39 
 
 		 175 aa  41.2  0.009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.446775  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1452  hypothetical protein  31.08 
 
 		 133 aa  41.2  0.009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.194252  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1505  AIG2 family protein  25.17 
 
 		 167 aa  41.2  0.01  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.524511  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>