More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_3620 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_3620  heavy metal translocating P-type ATPase  100 
 
 		 731 aa  1439    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0570735 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2796  heavy metal translocatin P-type ATPase  50.73 
 
 		 718 aa  625  1e-177  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2905  heavy metal translocating P-type ATPase  46.32 
 
 		 712 aa  571  1e-161  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.850846 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0495  heavy metal translocating P-type ATPase  43.84 
 
 		 716 aa  484  1e-135  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3193  heavy metal translocating P-type ATPase  39.14 
 
 		 701 aa  479  1e-133  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1389  tetrapyrrole methylase family protein  38.58 
 
 		 691 aa  461  9.999999999999999e-129  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.512552  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0831  metal transporting atpase Mta72  36.17 
 
 		 691 aa  458  1e-127  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0130757  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1377  heavy metal translocating P-type ATPase subfamily protein  37.33 
 
 		 691 aa  447  1.0000000000000001e-124  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2577  heavy metal translocating P-type ATPase  41.91 
 
 		 698 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0984175  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22710  heavy metal translocating P-type ATPase protein  39.45 
 
 		 719 aa  436  1e-121  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0353  metal transporting atpase Mta72  36.12 
 
 		 696 aa  421  1e-116  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.699181  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1346  heavy metal translocating P-type ATPase  36.89 
 
 		 693 aa  382  1e-104  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000243263 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0473  heavy metal translocating P-type ATPase  34.69 
 
 		 699 aa  368  1e-100  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1752  heavy metal translocating P-type ATPase  35.54 
 
 		 718 aa  365  2e-99  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00181407  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0060  heavy metal translocating P-type ATPase  39.93 
 
 		 752 aa  361  3e-98  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06700  heavy metal translocating P-type ATPase  34.3 
 
 		 702 aa  348  3e-94  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.0000434785  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1417  heavy metal translocating P-type ATPase  37.13 
 
 		 971 aa  347  6e-94  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0034  heavy metal translocating P-type ATPase  31.86 
 
 		 691 aa  342  2e-92  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.205705  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0498  heavy metal translocating P-type ATPase  36.48 
 
 		 700 aa  338  2.9999999999999997e-91  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1083  heavy metal translocating P-type ATPase  32.58 
 
 		 698 aa  332  1e-89  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0265246  hitchhiker  0.000000000000296825 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0714  heavy metal translocating P-type ATPase  29.89 
 
 		 698 aa  322  1.9999999999999998e-86  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.673424  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12940  heavy metal translocating P-type ATPase  32.75 
 
 		 710 aa  320  5e-86  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.793876  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1098  heavy metal translocating P-type ATPase  34.21 
 
 		 693 aa  308  2.0000000000000002e-82  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000158544  hitchhiker  0.0000000000000761512 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1944  heavy metal translocating P-type ATPase  33.45 
 
 		 695 aa  305  2.0000000000000002e-81  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000136781  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5064  Cd/Co/Hg/Pb/Zn-translocating P-type ATPase  34.32 
 
 		 770 aa  304  4.0000000000000003e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00217431  normal  0.549682 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3361  heavy metal translocating P-type ATPase  34.98 
 
 		 755 aa  303  9e-81  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1568  putative cation transport ATPase  33.73 
 
 		 703 aa  301  2e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.349001  normal  0.0140586 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2999  heavy metal translocating P-type ATPase  32.56 
 
 		 805 aa  300  6e-80  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.000764735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13299  metal cation transporter P-type ATPase C ctpC  35.78 
 
 		 718 aa  300  8e-80  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.685827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3854  heavy metal translocating P-type ATPase  37.2 
 
 		 747 aa  298  2e-79  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000610178  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0966  heavy metal translocating P-type ATPase  29.9 
 
 		 722 aa  298  3e-79  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000592542  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1344  heavy metal translocating P-type ATPase  33.1 
 
 		 702 aa  289  1e-76  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1689  copper-translocating P-type ATPase  33.58 
 
 		 798 aa  289  1e-76  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0290  heavy metal translocating P-type ATPase  36.71 
 
 		 734 aa  288  2e-76  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.106474  normal  0.0243366 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0546  heavy metal translocating P-type ATPase  32.19 
 
 		 766 aa  284  5.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3584  heavy metal translocating P-type ATPase  30.92 
 
 		 723 aa  283  1e-74  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.278523 
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6437  heavy metal translocating P-type ATPase  31.73 
 
 		 817 aa  278  3e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2553  heavy metal translocating P-type ATPase  34.07 
 
 		 838 aa  277  5e-73  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0871604  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2982  heavy metal translocating P-type ATPase  32.3 
 
 		 821 aa  274  4.0000000000000004e-72  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000528062  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0296  heavy metal translocating P-type ATPase  34.77 
 
 		 826 aa  274  5.000000000000001e-72  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0182  copper-translocating P-type ATPase  33.52 
 
 		 798 aa  272  2e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.365943  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0280  copper-translocating P-type ATPase  33.52 
 
 		 798 aa  272  2e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1801  copper-translocating P-type ATPase  32.29 
 
 		 797 aa  269  1e-70  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0220  heavy metal translocating P-type ATPase  31.3 
 
 		 743 aa  268  2e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.639111 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0992  Cd/Co/Hg/Pb/Zn-translocating P-type ATPase  30.57 
 
 		 737 aa  266  8e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0519582  normal  0.180719 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2592  heavy metal translocating P-type ATPase  32.46 
 
 		 836 aa  266  8e-70  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0301903  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3677  heavy metal translocating P-type ATPase  30.85 
 
 		 894 aa  263  1e-68  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0953  copper-translocating P-type ATPase  31.41 
 
 		 828 aa  262  2e-68  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_824  cation transport ATPase  30.92 
 
 		 828 aa  262  2e-68  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1876  heavy metal translocating P-type ATPase  33.61 
 
 		 748 aa  261  4e-68  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.972303  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20140  heavy metal-translocating P-type ATPase, Cd/Co/Hg/Pb/Zn-transporting  35.04 
 
 		 628 aa  260  7e-68  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0159818  normal  0.023133 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1472  copper-translocating P-type ATPase  30.93 
 
 		 806 aa  259  9e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000228287  hitchhiker  0.0000337327 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0987  heavy metal translocating P-type ATPase  31.86 
 
 		 839 aa  259  9e-68  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000433891  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0343  cadmium efflux ATPase  32.21 
 
 		 645 aa  259  1e-67  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3829  copper-translocating P-type ATPase  30.74 
 
 		 806 aa  259  1e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0228727  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3758  heavy metal-transporting ATPase  30.74 
 
 		 805 aa  259  2e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000825532  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0518  copper-translocating P-type ATPase  32.07 
 
 		 796 aa  258  3e-67  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0837  heavy metal translocating P-type ATPase  30.51 
 
 		 828 aa  258  3e-67  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3487  heavy metal-transporting ATPase  30.56 
 
 		 805 aa  258  4e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000442964  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3741  heavy metal-transporting ATPase  30.56 
 
 		 805 aa  258  4e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000497644 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3779  heavy metal-transporting ATPase  30.56 
 
 		 805 aa  257  4e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000381926  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1535  copper-translocating P-type ATPase  32.32 
 
 		 643 aa  257  5e-67  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1876  cation transport ATPase  31.71 
 
 		 644 aa  256  7e-67  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000004202 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3575  heavy metal-transporting ATPase  30.56 
 
 		 805 aa  256  8e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0131319  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3859  heavy metal-transporting ATPase  30.56 
 
 		 805 aa  256  8e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000448263  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0422  heavy metal translocating P-type ATPase  27.16 
 
 		 723 aa  256  8e-67  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0089  ATPase, P type cation/copper-transporter  33.15 
 
 		 833 aa  256  1.0000000000000001e-66  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2532  heavy metal translocating P-type ATPase  32.34 
 
 		 762 aa  256  1.0000000000000001e-66  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0349499  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3496  heavy metal translocating P-type ATPase  30.56 
 
 		 806 aa  255  2.0000000000000002e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.170842  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1839  heavy metal translocating P-type ATPase  32.67 
 
 		 625 aa  255  2.0000000000000002e-66  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.207467  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0441  heavy metal translocating P-type ATPase  32.55 
 
 		 827 aa  255  2.0000000000000002e-66  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.135163  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3475  heavy metal-transporting ATPase  30.37 
 
 		 805 aa  254  3e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000616421  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1581  heavy metal translocating P-type ATPase  32.71 
 
 		 755 aa  254  3e-66  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0453  heavy metal translocating P-type ATPase  29.32 
 
 		 630 aa  254  3e-66  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.153075 
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A03  cation transport ATPase  28.52 
 
 		 616 aa  254  5.000000000000001e-66  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1730  heavy metal translocating P-type ATPase  32.4 
 
 		 839 aa  253  9.000000000000001e-66  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1994  copper-translocating P-type ATPase  31.95 
 
 		 752 aa  253  1e-65  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0774  copper-translocating P-type ATPase  30.86 
 
 		 797 aa  252  1e-65  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2633  copper-translocating P-type ATPase  32.05 
 
 		 802 aa  253  1e-65  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.881723  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2579  copper-translocating P-type ATPase  32.05 
 
 		 802 aa  253  1e-65  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2543  heavy metal translocating P-type ATPase  29.44 
 
 		 623 aa  252  2e-65  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.452122 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0129  copper-translocating P-type ATPase  32.56 
 
 		 837 aa  252  2e-65  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3727  heavy metal translocating P-type ATPase  33.64 
 
 		 711 aa  252  2e-65  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0514  heavy metal translocating P-type ATPase  33.81 
 
 		 633 aa  252  2e-65  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0187002 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1461  heavy metal translocating P-type ATPase  33.44 
 
 		 768 aa  251  3e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1698  cation transport ATPases  32.2 
 
 		 799 aa  251  3e-65  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.118388  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1481  heavy metal translocating P-type ATPase  33.44 
 
 		 768 aa  251  3e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0180195  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4416  copper-translocating P-type ATPase  28.49 
 
 		 759 aa  251  4e-65  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3295  heavy metal translocating P-type ATPase  32.8 
 
 		 639 aa  251  4e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.853609  normal  0.321257 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1879  heavy metal translocating P-type ATPase  32.18 
 
 		 836 aa  251  5e-65  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.753132  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1532  heavy metal translocating P-type ATPase  30.64 
 
 		 758 aa  251  5e-65  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.14474  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1690  heavy metal translocating P-type ATPase  31.4 
 
 		 767 aa  250  6e-65  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2140  copper-translocating P-type ATPase  28.55 
 
 		 803 aa  250  6e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9864  heavy-metal transporting P-type ATPase  32.89 
 
 		 826 aa  250  6e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1042  cation transport ATPase  29.82 
 
 		 620 aa  250  8e-65  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0059101  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1653  heavy metal translocating P-type ATPase  30.22 
 
 		 817 aa  249  1e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00461929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1848  copper-translocating P-type ATPase  29.93 
 
 		 743 aa  249  1e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.525064  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0612  copper-translocating P-type ATPase  32.9 
 
 		 942 aa  249  1e-64  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.764101  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5293  heavy metal translocating P-type ATPase  30.22 
 
 		 817 aa  249  1e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10987  metal cation transporter P-type ATPase ctpV  33.52 
 
 		 792 aa  248  2e-64  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0884747  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>