More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_0344 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_0344  enoyl-CoA hydratase  100 
 
 		 267 aa  530  1e-150  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0151  enoyl-CoA hydratase  79.84 
 
 		 260 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0701  enoyl-CoA hydratase  77.01 
 
 		 261 aa  400  1e-111  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0387  enoyl-CoA hydratase  75.47 
 
 		 266 aa  402  1e-111  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19740  enoyl-CoA hydratase  61.87 
 
 		 256 aa  290  1e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1700  enoyl-CoA hydratase  61.87 
 
 		 256 aa  290  2e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.183828  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1403  enoyl-CoA hydratase  58.62 
 
 		 267 aa  285  7e-76  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.930333  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0491  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  60.47 
 
 		 260 aa  280  2e-74  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0978  enoyl-CoA hydratase  63.32 
 
 		 254 aa  274  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0996  enoyl-CoA hydratase  63.32 
 
 		 254 aa  274  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3941  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  61.24 
 
 		 255 aa  273  2.0000000000000002e-72  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1006  enoyl-CoA hydratase  62.88 
 
 		 254 aa  272  5.000000000000001e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.451958 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32890  enoyl-CoA hydratase  58.46 
 
 		 258 aa  270  2e-71  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0620133  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0941  enoyl-CoA hydratase  55.47 
 
 		 257 aa  269  2.9999999999999997e-71  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3276  enoyl-CoA hydratase  61.89 
 
 		 245 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1272  enoyl-CoA hydratase  57.09 
 
 		 265 aa  264  1e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0499602  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5084  enoyl-CoA hydratase  59.45 
 
 		 252 aa  262  4.999999999999999e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.965441 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10689  enoyl-CoA hydratase  59.92 
 
 		 263 aa  259  3e-68  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0289  enoyl-CoA hydratase  57.48 
 
 		 257 aa  253  2.0000000000000002e-66  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0727939  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1456  enoyl-CoA hydratase  59.69 
 
 		 257 aa  253  3e-66  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.423076  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0473  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  59.45 
 
 		 264 aa  251  6e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01778  enoyl-CoA hydratase  55.21 
 
 		 259 aa  250  1e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4961  enoyl-CoA hydratase  58.37 
 
 		 253 aa  246  2e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.313807  normal  0.100535 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0288  enoyl-CoA hydratase  59.77 
 
 		 255 aa  244  9.999999999999999e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.977294  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3498  enoyl-CoA hydratase  54.78 
 
 		 271 aa  239  2.9999999999999997e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4465  enoyl-CoA hydratase  56.08 
 
 		 252 aa  236  3e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0779435  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4094  enoyl-CoA hydratase  54.74 
 
 		 265 aa  236  3e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4447  enoyl-CoA hydratase  62.56 
 
 		 253 aa  232  6e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.175913 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1778  enoyl-CoA hydratase  52.24 
 
 		 259 aa  228  1e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6226  enoyl-CoA hydratase  54.94 
 
 		 248 aa  225  6e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2337  enoyl-CoA hydratase  60.61 
 
 		 258 aa  222  4e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.072463  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6186  enoyl-CoA hydratase  58.1 
 
 		 262 aa  218  7e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4725  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  58.37 
 
 		 254 aa  218  1e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0948054  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0785  enoyl-CoA hydratase  52.12 
 
 		 274 aa  207  2e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.460617 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00180  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein (AFU_orthologue; AFUA_3G07560)  48.91 
 
 		 296 aa  206  3e-52  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2431  enoyl-CoA hydratase  52.16 
 
 		 292 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.197627  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3896  enoyl-CoA hydratase  52.12 
 
 		 274 aa  198  9e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3453  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.53 
 
 		 234 aa  185  8e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0188268  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0500  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.78 
 
 		 289 aa  166  4e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.217153  normal  0.956057 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5303  enoyl-CoA hydratase  38.11 
 
 		 264 aa  150  2e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3853  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.52 
 
 		 256 aa  144  1e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.307462  normal  0.645815 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3985  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.65 
 
 		 269 aa  143  2e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.213719  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3960  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.82 
 
 		 273 aa  143  3e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1990  enoyl-CoA hydratase  38.31 
 
 		 253 aa  138  7.999999999999999e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1480  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.16 
 
 		 271 aa  137  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13549  enoyl-CoA hydratase  36.5 
 
 		 263 aa  133  3e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000434368  hitchhiker  0.00000386498 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10710  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.96 
 
 		 258 aa  131  1.0000000000000001e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4479  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.13 
 
 		 259 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.275348 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1771  enoyl-CoA hydratase  35.25 
 
 		 247 aa  131  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.32618  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1752  enoyl-CoA hydratase  35.25 
 
 		 247 aa  131  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1818  enoyl-CoA hydratase  35.25 
 
 		 247 aa  131  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10224  enoyl-CoA hydratase  40.49 
 
 		 262 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5216  enoyl-CoA hydratase  35.04 
 
 		 266 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.281677 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1542  enoyl-CoA hydratase  37.3 
 
 		 287 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6741  short chain enoyl-CoA hydratase  42.73 
 
 		 255 aa  129  3e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00146659  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4354  enoyl-CoA hydratase  37.75 
 
 		 253 aa  130  3e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0648  short chain enoyl-CoA hydratase  34.25 
 
 		 257 aa  127  1.0000000000000001e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0972113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1773  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.69 
 
 		 256 aa  128  1.0000000000000001e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.287429  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4640  enoyl-CoA hydratase  34.24 
 
 		 257 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.774216  normal  0.012557 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1803  short chain enoyl-CoA hydratase  34.25 
 
 		 257 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3114  enoyl-CoA hydratase  34.65 
 
 		 258 aa  126  4.0000000000000003e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00000516225  normal  0.042562 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2672  carnitinyl-CoA dehydratase  36.86 
 
 		 261 aa  125  5e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.539378  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2872  enoyl-CoA hydratase  35.32 
 
 		 258 aa  126  5e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  unclonable  0.000000338858  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2726  enoyl-CoA hydratase  36.95 
 
 		 266 aa  125  6e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.407003  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3355  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.37 
 
 		 797 aa  125  9e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0866397  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0074  carnitinyl-CoA dehydratase  34.9 
 
 		 261 aa  124  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2793  carnitinyl-CoA dehydratase  42.03 
 
 		 262 aa  124  1e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.282235 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0998  crotonobetainyl-CoA hydratase  37.2 
 
 		 254 aa  124  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4716  enoyl-CoA hydratase  34.87 
 
 		 269 aa  124  2e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.530028  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0040  carnitinyl-CoA dehydratase  34.12 
 
 		 297 aa  124  2e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3225  carnitinyl-CoA dehydratase  39.8 
 
 		 261 aa  124  2e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0077  carnitinyl-CoA dehydratase  34.9 
 
 		 261 aa  124  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0078  carnitinyl-CoA dehydratase  34.9 
 
 		 261 aa  124  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0074  carnitinyl-CoA dehydratase  34.9 
 
 		 261 aa  124  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0076  carnitinyl-CoA dehydratase  34.9 
 
 		 261 aa  124  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5010  enoyl-CoA hydratase  34.87 
 
 		 269 aa  124  2e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.625165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1558  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.02 
 
 		 258 aa  124  2e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4628  enoyl-CoA hydratase  34.87 
 
 		 269 aa  124  2e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00040  carnitinyl-CoA dehydratase  34.51 
 
 		 297 aa  123  3e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3563  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.51 
 
 		 261 aa  123  3e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00039  hypothetical protein  34.51 
 
 		 297 aa  123  3e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1280  enoyl-CoA hydratase  40.31 
 
 		 260 aa  123  3e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0590301  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0037  carnitinyl-CoA dehydratase  34.25 
 
 		 261 aa  123  3e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3619  carnitinyl-CoA dehydratase  34.51 
 
 		 261 aa  123  3e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.291673 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4369  enoyl-CoA hydratase  34.24 
 
 		 257 aa  123  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0156166 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4034  carnitinyl-CoA dehydratase  39.3 
 
 		 261 aa  123  3e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3369  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.35 
 
 		 262 aa  123  4e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.186723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0040  carnitinyl-CoA dehydratase  34.51 
 
 		 261 aa  122  4e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0860  short chain enoyl-CoA hydratase  34.12 
 
 		 261 aa  122  4e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3574  enoyl-CoA hydratase  40.38 
 
 		 257 aa  122  4e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000415637 
 
 
-
 
NC_004310  BR2184  enoyl-CoA hydratase  32.28 
 
 		 257 aa  122  5e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.182901  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2097  enoyl-CoA hydratase  32.28 
 
 		 257 aa  122  5e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00356109  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0038  carnitinyl-CoA dehydratase  34.51 
 
 		 261 aa  122  7e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0633  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.68 
 
 		 258 aa  122  9e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6902  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.55 
 
 		 258 aa  122  9e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.174698  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3322  enoyl-CoA hydratase  31.46 
 
 		 263 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0882  short chain enoyl-CoA hydratase  35.59 
 
 		 259 aa  121  9.999999999999999e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.533532 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3162  enoyl-CoA hydratase  32.68 
 
 		 258 aa  121  9.999999999999999e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000276465  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0423  short chain enoyl-CoA hydratase  33.59 
 
 		 259 aa  121  9.999999999999999e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3537  enoyl-CoA hydratase  31.46 
 
 		 263 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.50917e-16 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>