210 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_3784 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_1124  flagellar motor switch protein FliM  86.15 
 
 		 401 aa  702    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.571971 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3784  flagellar motor switch protein FliM  100 
 
 		 401 aa  814    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1509  flagellar motor switch protein FliM  86.88 
 
 		 404 aa  708    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.645408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1686  flagellar motor switch protein FliM  97.51 
 
 		 400 aa  761    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.157036  normal  0.0866038 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1386  flagellar motor switch protein FliM  86.18 
 
 		 401 aa  694    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.449583  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4420  flagellar motor switch protein FliM  96.76 
 
 		 400 aa  773    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5507  flagellar motor switch protein FliM  83.79 
 
 		 400 aa  674    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.485441  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4200  flagellar motor switch protein FliM  54.41 
 
 		 403 aa  451  1e-125  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.592562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4715  flagellar motor switch protein FliM  55.45 
 
 		 403 aa  448  1e-125  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.179233  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2840  flagellar motor switch protein FliM  59.67 
 
 		 384 aa  442  1e-123  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1944  flagellar motor switch protein FliM  62.18 
 
 		 376 aa  442  1e-123  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.829502  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0820  flagellar motor switch protein FliM  55.09 
 
 		 404 aa  438  9.999999999999999e-123  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.223563  normal  0.0356889 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3248  flagellar motor switch protein FliM  52.79 
 
 		 405 aa  435  1e-121  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3050  flagellar motor switch protein FliM  53.95 
 
 		 406 aa  432  1e-120  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.722378 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3274  flagellar motor switch protein FliM  53.95 
 
 		 406 aa  432  1e-120  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1434  flagellar motor switch protein FliM  62.03 
 
 		 377 aa  431  1e-119  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2564  flagellar motor switch protein FliM  65.4 
 
 		 374 aa  414  1e-114  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.525902 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3482  flagellar motor switch protein FliM  45.68 
 
 		 395 aa  320  1.9999999999999998e-86  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.138981  normal  0.137747 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0973  flagellar motor switch protein FliM  43.03 
 
 		 337 aa  248  2e-64  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2074  flagellar motor switch protein FliM  32.92 
 
 		 326 aa  177  2e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0666183 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2734  flagellar motor switch protein FliM  31.35 
 
 		 325 aa  172  7.999999999999999e-42  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1836  flagellar motor switch protein FliM  30.09 
 
 		 326 aa  167  2.9999999999999998e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.270435  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1396  flagellar motor switch protein FliM  33.33 
 
 		 326 aa  166  1.0000000000000001e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2708  flagellar motor switch protein FliM  32.98 
 
 		 326 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.944931  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2301  flagellar motor switch protein FliM  29.54 
 
 		 343 aa  160  5e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0645  flagellar motor switch protein FliM  31.66 
 
 		 334 aa  159  9e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4388  flagellar motor switch protein FliM  30.86 
 
 		 334 aa  159  1e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1873  flagellar motor switch protein FliM  31.11 
 
 		 334 aa  157  2e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.424816  normal  0.31491 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1165  flagellar motor switch protein FliM  31.78 
 
 		 324 aa  157  3e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.383583  normal  0.0400809 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06192  flagellar motor switch protein FliM  31.15 
 
 		 337 aa  155  1e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.148716  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0027  flagellar motor switch protein FliM  30.5 
 
 		 332 aa  155  1e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0979661  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00974  flagellar motor switch protein FliM  31.15 
 
 		 337 aa  155  1e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0848002  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0378  flagellar motor switch protein FliM  28.75 
 
 		 335 aa  154  2e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0557  flagellar motor switch protein FliM  30.12 
 
 		 329 aa  154  2e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0208748  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1120  flagellar motor switch protein FliM  30.58 
 
 		 334 aa  154  2e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.629082 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1709  flagellar motor switch protein FliM  29.6 
 
 		 349 aa  154  2e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4754  flagellar motor switch protein FliM  29.06 
 
 		 335 aa  154  4e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.767087 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3677  flagellar motor switch protein FliM  29.06 
 
 		 335 aa  154  4e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0043  flagellar motor switch protein FliM  30.19 
 
 		 332 aa  153  5e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0572  flagellar motor switch protein  29.91 
 
 		 333 aa  153  5e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1509  flagellar motor switch protein FliM  28.13 
 
 		 354 aa  152  7e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.361496  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0240  flagellar motor switch protein FliM  29.87 
 
 		 332 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.840494  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0029  flagellar motor switch protein FliM  29.87 
 
 		 332 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0029  flagellar motor switch protein FliM  29.87 
 
 		 332 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2764  flagellar motor switch protein FliM  29.87 
 
 		 332 aa  151  2e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02880  flagellar motor switch protein FliM  27.88 
 
 		 352 aa  151  2e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0059  flagellar motor switch protein FliM  28.93 
 
 		 332 aa  151  2e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0030  flagellar motor switch protein FliM  28.93 
 
 		 332 aa  151  2e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0040  flagellar motor switch protein FliM  28.93 
 
 		 332 aa  151  2e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0041  flagellar motor switch protein FliM  29.56 
 
 		 332 aa  151  2e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.215724  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3497  flagellar motor switch protein FliM  29.87 
 
 		 332 aa  151  2e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1867  flagellar motor switch protein FliM  29.87 
 
 		 332 aa  151  2e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2685  flagellar motor switch protein FliM  29.87 
 
 		 332 aa  151  2e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3224  flagellar motor switch protein FliM  28.93 
 
 		 332 aa  150  3e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0816696 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1352  flagellar motor switch protein FliM  29.06 
 
 		 326 aa  150  3e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3221  flagellar motor switch protein FliM  29.04 
 
 		 343 aa  150  4e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1023  flagellar motor switch protein FliM  29.6 
 
 		 334 aa  150  4e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0032  flagellar motor switch protein FliM  28.62 
 
 		 332 aa  150  4e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2938  flagellar motor switch protein FliM  27.36 
 
 		 332 aa  150  5e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1368  flagellar motor switch protein FliM  27.93 
 
 		 342 aa  149  7e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3074  flagellar motor switch protein FliM  29.5 
 
 		 334 aa  149  8e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0244027  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3800  flagellar motor switch protein FliM  29.5 
 
 		 334 aa  149  8e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.506275  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03154  flagellar motor switch protein FliM  28.44 
 
 		 348 aa  149  8e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1971  flagellar motor switch protein FliM  28.06 
 
 		 335 aa  149  9e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.182445  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1189  flagellar motor switch protein FliM  29.37 
 
 		 342 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002822  flagellar motor switch protein FliM  28.27 
 
 		 348 aa  149  1.0000000000000001e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1328  flagellar motor switch protein FliM  29.5 
 
 		 326 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.112804  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0158  flagellar motor switch protein FliM  27.04 
 
 		 332 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.350257 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1607  flagellar motor switch protein FliM  28.61 
 
 		 334 aa  147  3e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.337396  normal  0.0569703 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1373  flagellar motor switch protein FliM  28.45 
 
 		 341 aa  147  3e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0494415  normal  0.271207 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1289  flagellar motor switch protein FliM  28.7 
 
 		 343 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.846811  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1356  flagellar motor switch protein FliM  28.7 
 
 		 343 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1349  flagellar motor switch protein FliM  28.7 
 
 		 343 aa  147  5e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0743857  normal  0.319073 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0487  flagellar motor switch protein FliM  30.18 
 
 		 381 aa  146  5e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.10052  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3777  flagellar motor switch protein FliM  27.36 
 
 		 332 aa  147  5e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.494544  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1625  flagellar motor switch protein FliM  27.72 
 
 		 342 aa  146  5e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3059  flagellar motor switch protein FliM  27.25 
 
 		 341 aa  146  7.0000000000000006e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0661453  normal  0.103892 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3447  flagellar motor switch protein FliM  27.5 
 
 		 322 aa  145  1e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3040  flagellar motor switch protein FliM  27.96 
 
 		 352 aa  145  1e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1444  flagellar motor switch protein FliM  27.85 
 
 		 342 aa  144  2e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.397318  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0766  flagellar motor switch protein FliM  28.3 
 
 		 338 aa  144  3e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.749684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3061  flagellar motor switch protein FliM  27.85 
 
 		 342 aa  144  3e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.438117  normal  0.957867 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0975  flagellar motor switch protein FliM  29.11 
 
 		 395 aa  144  3e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.331091  normal  0.0558363 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2290  flagellar motor switch protein FliM  27.66 
 
 		 342 aa  144  3e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2919  flagellar motor switch protein FliM  28.67 
 
 		 342 aa  144  3e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.786666  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2569  flagellar motor switch protein FliM  28.67 
 
 		 343 aa  144  3e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2929  flagellar motor switch protein FliM  28.67 
 
 		 342 aa  144  3e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5884  flagellar motor switch protein FliM  27.74 
 
 		 337 aa  143  5e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.579106  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1546  flagellar motor switch protein FliM  26.88 
 
 		 322 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0457141  normal  0.871415 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5298  flagellar motor switch protein FliM  26.45 
 
 		 336 aa  142  9.999999999999999e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0621  flagellar motor switch protein FliM  31.89 
 
 		 335 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.698548 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0707  flagellar motor switch protein FliM  28.35 
 
 		 347 aa  142  1.9999999999999998e-32  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1432  flagellar motor switch protein FliM  26.33 
 
 		 339 aa  140  3.9999999999999997e-32  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0642  flagellar motor switch protein FliM  30.65 
 
 		 344 aa  140  4.999999999999999e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.169011  normal  0.290424 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1969  flagellar motor switch protein FliM  27.19 
 
 		 322 aa  139  6e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.172319  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0653  surface presentation of antigens (SPOA) protein  30.65 
 
 		 340 aa  139  6e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.115934 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4358  flagellar motor switch protein FliM  26.56 
 
 		 322 aa  139  8.999999999999999e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.319653  normal  0.671935 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1508  flagellar motor switch protein FliM  26.56 
 
 		 322 aa  139  8.999999999999999e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0916886 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3920  flagellar motor switch protein FliM  26.56 
 
 		 322 aa  139  1e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.498992  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3293  flagellar motor switch protein FliM  30.35 
 
 		 331 aa  137  4e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>