More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_2269 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_1176  glutamine synthetase catalytic region  91.79 
 
 		 486 aa  920    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8463  glutamine synthetase catalytic region  75.73 
 
 		 478 aa  759    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0878  L-glutamine synthetase  75.78 
 
 		 479 aa  768    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.270101  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2269  glutamate--ammonia ligase  100 
 
 		 476 aa  988    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0828356  normal  0.372535 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6981  glutamine synthetase catalytic region  64.02 
 
 		 478 aa  639    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5153  L-glutamine synthetase  61.22 
 
 		 479 aa  623  1e-177  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.159892  normal  0.283926 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3191  L-glutamine synthetase  50.1 
 
 		 500 aa  464  1e-129  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2132  L-glutamine synthetase  50 
 
 		 498 aa  454  1.0000000000000001e-126  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.171526  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0830  L-glutamine synthetase  46.03 
 
 		 497 aa  452  1.0000000000000001e-126  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1446  L-glutamine synthetase  43.97 
 
 		 456 aa  399  9.999999999999999e-111  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2204  glutamine synthetase, catalytic region  37.73 
 
 		 500 aa  276  5e-73  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0651857  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3850  Glutamate--ammonia ligase  33.62 
 
 		 453 aa  224  4e-57  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.274285  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1603  glutamate--ammonia ligase  32.84 
 
 		 468 aa  222  9.999999999999999e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0361504 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4547  glutamate--ammonia ligase  33.33 
 
 		 453 aa  211  3e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.294027  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1294  L-glutamine synthetase  33.54 
 
 		 444 aa  210  4e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0180309 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0512  glutamate--ammonia ligase  33.26 
 
 		 466 aa  209  8e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.521474  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0523  glutamate--ammonia ligase  33.26 
 
 		 466 aa  209  8e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.172344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0501  glutamate--ammonia ligase  33.26 
 
 		 466 aa  209  1e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4121  Glutamate--ammonia ligase  32.45 
 
 		 433 aa  206  6e-52  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2806  glutamine synthetase, type I  32.85 
 
 		 449 aa  205  1e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1297  L-glutamine synthetase  32.56 
 
 		 443 aa  205  1e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000250879  normal  0.0655165 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1389  glutamine synthetase, type I  30.47 
 
 		 450 aa  205  2e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0679  L-glutamine synthetase  32.24 
 
 		 453 aa  205  2e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.08688  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4065  glutamate--ammonia ligase  31.01 
 
 		 469 aa  202  9.999999999999999e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0161  L-glutamine synthetase  31.44 
 
 		 475 aa  201  3e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.636195  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1870  L-glutamine synthetase  32.44 
 
 		 455 aa  199  1.0000000000000001e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.156318  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2807  glutamine synthetase, type I  30.43 
 
 		 444 aa  198  2.0000000000000003e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0737852  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1007  glutamate--ammonia ligase  32.22 
 
 		 442 aa  197  4.0000000000000005e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000328264  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2023  glutamine synthetase, type I  31.87 
 
 		 443 aa  197  5.000000000000001e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0962  L-glutamine synthetase  30.75 
 
 		 445 aa  196  7e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0105368  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0732  glutamine synthetase family protein  30.11 
 
 		 455 aa  195  2e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.212286  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1610  glutamate--ammonia ligase  30.07 
 
 		 459 aa  194  2e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1764  L-glutamine synthetase  31.4 
 
 		 442 aa  195  2e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.705801  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3760  glutamine synthetase, type I  30.45 
 
 		 443 aa  194  2e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000185172  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0686  glutamine synthetase family protein  30.11 
 
 		 455 aa  194  3e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.22551  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3881  glutamate--ammonia ligase  30.82 
 
 		 456 aa  194  4e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.130901  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1435  glutamine synthetase, type I  31.25 
 
 		 437 aa  193  5e-48  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21290  glutamine synthetase, type I  31.71 
 
 		 441 aa  193  6e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0204015  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3759  glutamine synthetase, type I  31.94 
 
 		 444 aa  193  6e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000109487  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3196  L-glutamine synthetase  31.48 
 
 		 455 aa  192  9e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2057  glutamate--ammonia ligase  30.89 
 
 		 455 aa  192  1e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.454402  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2103  glutamate--ammonia ligase  30.89 
 
 		 455 aa  192  1e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.183312  normal  0.0293144 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4406  Glutamate--ammonia ligase  31.4 
 
 		 461 aa  191  2e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2711  glutamine synthetase, type I  33.84 
 
 		 442 aa  190  5e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0628  glutamine synthetase, type I  30.19 
 
 		 443 aa  190  5e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0694416  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2040  glutamate--ammonia ligase  30.67 
 
 		 455 aa  190  5.999999999999999e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.373617 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4032  glutamine synthetase, type I  30.66 
 
 		 444 aa  189  8e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0782216  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0715  glutamine synthetase family protein  29.91 
 
 		 476 aa  189  9e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2380  Glutamate--putrescine ligase  30.57 
 
 		 456 aa  189  1e-46  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.0068155  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2027  glutamine synthetase, type I  31.36 
 
 		 443 aa  188  2e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.123659  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2247  glutamine synthetase, type III  30.33 
 
 		 444 aa  188  2e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.238317 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0768  glutamine synthetase family protein  29.91 
 
 		 476 aa  187  3e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.150739  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2278  glutamate--ammonia ligase  30.19 
 
 		 459 aa  187  5e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.206165 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3549  glutamine synthetase, type I  30.11 
 
 		 444 aa  186  6e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3449  glutamine synthetase, type I  30.11 
 
 		 444 aa  186  6e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3462  glutamate--ammonia ligase (glutamine synthetase, type I)  30.11 
 
 		 444 aa  186  6e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3833  glutamine synthetase, type I  30.11 
 
 		 444 aa  186  6e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3713  glutamine synthetase, type I  30.11 
 
 		 444 aa  186  6e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.53476e-18 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3754  glutamine synthetase, type I  30.11 
 
 		 444 aa  186  6e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.149768  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1123  glutamine synthetase, type I  30.82 
 
 		 443 aa  186  7e-46  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.245157  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1573  glutamine synthetase, type I  32.02 
 
 		 445 aa  186  7e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0952  L-glutamine synthetase  30.31 
 
 		 443 aa  186  7e-46  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3731  glutamine synthetase, type I  30.11 
 
 		 444 aa  186  9e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2794  glutamate--ammonia ligase  29.09 
 
 		 455 aa  186  9e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0169506  normal  0.297978 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1667  glutamine synthetase, catalytic region  28.54 
 
 		 474 aa  186  1.0000000000000001e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3763  glutamine synthetase, type I  30.61 
 
 		 457 aa  185  1.0000000000000001e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000243827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1689  glutamine synthetase, type I  29.51 
 
 		 441 aa  185  1.0000000000000001e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.394056  normal  1 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5189  glutamine synthetase, type I  32.15 
 
 		 451 aa  185  1.0000000000000001e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0952  L-glutamine synthetase  27.92 
 
 		 445 aa  185  1.0000000000000001e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00098496  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0295  putative glutamine synthetase  30.7 
 
 		 475 aa  185  2.0000000000000003e-45  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0666  L-glutamine synthetase  29.42 
 
 		 447 aa  185  2.0000000000000003e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.57633 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1096  L-glutamine synthetase  30.64 
 
 		 449 aa  184  2.0000000000000003e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3996  glutamine synthetase, type I  30.19 
 
 		 443 aa  185  2.0000000000000003e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2178  glutamine synthetase, type I  29.75 
 
 		 444 aa  184  3e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.588108  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0422  glutamine synthetase, type I  33.9 
 
 		 444 aa  184  4.0000000000000006e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.897308  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3857  Glutamate--ammonia ligase  31.26 
 
 		 461 aa  184  4.0000000000000006e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.261815  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2270  L-glutamine synthetase  30.59 
 
 		 440 aa  184  4.0000000000000006e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.327087  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12876  glutamine synthetase glnA4  31.35 
 
 		 457 aa  184  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3936  glutamate--putrescine ligase  28.95 
 
 		 476 aa  183  5.0000000000000004e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0386  glutamine synthetase, type I  30.23 
 
 		 444 aa  183  5.0000000000000004e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3469  glutamine synthetase, type I  29.89 
 
 		 444 aa  183  5.0000000000000004e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00616587  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0643  glutamine synthetase, type I  29.62 
 
 		 445 aa  183  5.0000000000000004e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.61132  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2130  glutamine synthetase catalytic region  29.81 
 
 		 454 aa  183  6e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.357355 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2381  glutamine synthetase, type I  29.89 
 
 		 444 aa  183  7e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1202  L-glutamine synthetase  29.02 
 
 		 447 aa  183  7e-45  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000336656  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1537  glutamine synthetase, type I  29.73 
 
 		 456 aa  182  1e-44  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2319  L-glutamine synthetase  30.07 
 
 		 459 aa  182  1e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2783  L-glutamine synthetase  31.49 
 
 		 450 aa  182  1e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.503835  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0993  glutamate--ammonia ligase  30.07 
 
 		 459 aa  182  1e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7784  glutamine synthetase catalytic region  28.82 
 
 		 452 aa  181  2e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1502  glutamine synthetase, type I  29.75 
 
 		 444 aa  181  2e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0398754 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2374  glutamine synthetase, type I  29.06 
 
 		 456 aa  181  2e-44  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.943832  normal  0.417951 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3803  glutamine synthetase, type I  29.75 
 
 		 444 aa  181  2e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1260  L-glutamine synthetase  32 
 
 		 461 aa  181  2e-44  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_941  glutamine synthetase, type I  30.6 
 
 		 443 aa  181  2.9999999999999997e-44  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0994  glutamine synthetase, type I  28.97 
 
 		 442 aa  180  4.999999999999999e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000845982  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2389  glutamine synthetase, type I  31.13 
 
 		 448 aa  180  5.999999999999999e-44  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.000000000201555  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0634  glutamine synthetase, type I  33.57 
 
 		 444 aa  180  5.999999999999999e-44  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.144254  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5310  glutamine synthetase  29.45 
 
 		 458 aa  179  7e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1760  Glutamate--ammonia ligase  31.57 
 
 		 447 aa  179  7e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0148642 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>