39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_4064 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_4368  lipoprotein, putative  96.05 
 
 		 354 aa  637    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4064  putative lipoprotein  100 
 
 		 354 aa  713    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.82498  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4490  putative lipoprotein  83.33 
 
 		 354 aa  604  9.999999999999999e-173  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.020416 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4477  lipoprotein  79.66 
 
 		 354 aa  574  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.24024  normal  0.364663 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0948  periplasmic lipoprotein-like protein  77.12 
 
 		 354 aa  561  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0909  hypothetical protein  77.4 
 
 		 354 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0977  lipoprotein  77.68 
 
 		 354 aa  559  1e-158  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00313194 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4941  putative lipoprotein  74.65 
 
 		 354 aa  538  9.999999999999999e-153  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56850  putative lipoprotein  74.37 
 
 		 354 aa  536  1e-151  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3297  periplasmic lipoprotein-like protein  62.57 
 
 		 353 aa  444  1e-123  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37860  hypothetical protein  61.3 
 
 		 354 aa  427  1e-118  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.214112  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0885  putative lipoprotein  31.19 
 
 		 335 aa  137  3.0000000000000003e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.584322  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2835  periplasmic lipoprotein  28.97 
 
 		 344 aa  137  3.0000000000000003e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.962002  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003125  iron-regulated protein A precursor  28.65 
 
 		 345 aa  126  5e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.392653  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3527  putative signal peptide protein  28.61 
 
 		 377 aa  125  1e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.793517  normal  0.789193 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02712  hypothetical protein  27.67 
 
 		 345 aa  124  2e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1784  putative lipoprotein  29.45 
 
 		 339 aa  116  5e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.327643  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4576  hypothetical protein  26.15 
 
 		 366 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0477994 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4313  hypothetical protein  26.22 
 
 		 366 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1370  hypothetical protein  27.73 
 
 		 338 aa  106  6e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.378457 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0333  hypothetical protein  24.62 
 
 		 374 aa  102  1e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2084  hypothetical protein  26.06 
 
 		 387 aa  99.4  9e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.868997 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0641  hypothetical protein  25.69 
 
 		 358 aa  98.6  2e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2203  hypothetical protein  27.88 
 
 		 342 aa  96.7  5e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.54755  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1802  hypothetical protein  26.95 
 
 		 389 aa  94.7  2e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2143  periplasmic lipoprotein-like protein  26.36 
 
 		 380 aa  90.1  6e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0403933 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0195  putative signal peptide protein  29.25 
 
 		 329 aa  89.4  9e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.533491  normal  0.303405 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0565  hypothetical protein  25.72 
 
 		 338 aa  89  1e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1544  signal peptide protein  28.66 
 
 		 329 aa  82  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2559  periplasmic lipoprotein-like protein  25.2 
 
 		 352 aa  80.9  0.00000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0351138  hitchhiker  0.00000000167803 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3024  periplasmic lipoprotein-like protein  26.89 
 
 		 332 aa  74.3  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00846426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3870  Peptidase M75, Imelysin  22.77 
 
 		 391 aa  68.2  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.755425  normal  0.516703 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3194  hypothetical protein  25.98 
 
 		 373 aa  66.2  0.0000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.967593  normal  0.475895 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0668  hypothetical protein  21.26 
 
 		 378 aa  62.8  0.000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0864322  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1330  periplasmic lipoprotein  23.58 
 
 		 372 aa  53.9  0.000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1527  periplasmic lipoprotein-like protein  24.84 
 
 		 361 aa  50.8  0.00004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0309667 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4530  Peptidase M75, Imelysin  21.94 
 
 		 384 aa  48.5  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.674322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0676  putative lipoprotein  21.39 
 
 		 382 aa  47.8  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0244175 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2563  periplasmic lipoprotein-like protein  24.6 
 
 		 369 aa  47.4  0.0004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.440484  hitchhiker  0.00108015 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>