76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_0911 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_0911  hypothetical protein  100 
 
 		 314 aa  619  1e-176  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.565858  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1748  protein of unknown function DUF6 transmembrane  46.25 
 
 		 316 aa  265  7e-70  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0355136 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2508  protein of unknown function DUF6 transmembrane  47.04 
 
 		 320 aa  255  5e-67  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0727  hypothetical protein  46.51 
 
 		 325 aa  244  9.999999999999999e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.563319  normal  0.0319705 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0090  protein of unknown function DUF6 transmembrane  46 
 
 		 326 aa  224  2e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0082  protein of unknown function DUF6 transmembrane  46 
 
 		 326 aa  223  3e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0952  hypothetical protein  44.12 
 
 		 328 aa  218  1e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.330098  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1460  hypothetical protein  40.32 
 
 		 319 aa  211  2e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.424115 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1857  transmembrane protein  40.32 
 
 		 319 aa  209  5e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2052  hypothetical protein  41.69 
 
 		 322 aa  209  6e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0439765  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1315  hypothetical protein  41.25 
 
 		 324 aa  207  2e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.158959  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0233  putative integral membrane transmembrane protein  44 
 
 		 326 aa  206  3e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2029  hypothetical protein  41.04 
 
 		 322 aa  204  2e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.827093  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3283  hypothetical protein  40.72 
 
 		 322 aa  203  2e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.793801  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2463  integral membrane protein  41.04 
 
 		 322 aa  204  2e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.126131  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2556  integral membrane protein  41.04 
 
 		 322 aa  204  2e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1529  hypothetical protein  41.04 
 
 		 322 aa  204  2e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.326947  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1300  hypothetical protein  40.72 
 
 		 322 aa  203  2e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2409  integral membrane protein  40.72 
 
 		 322 aa  203  3e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.246175  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5306  hypothetical protein  40.26 
 
 		 327 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.146478 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1280  hypothetical protein  40.59 
 
 		 327 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.162856  normal  0.301034 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2432  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40.59 
 
 		 325 aa  199  3e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.532838  normal  0.11306 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1705  DMT family permease  41.91 
 
 		 325 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1996  hypothetical protein  39.6 
 
 		 321 aa  196  3e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.269533  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6081  hypothetical protein  39.6 
 
 		 321 aa  196  3e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1369  hypothetical protein  39.94 
 
 		 314 aa  196  4.0000000000000005e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2016  hypothetical protein  39.6 
 
 		 321 aa  196  6e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.558153  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1898  hypothetical protein  40.26 
 
 		 324 aa  192  4e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2029  hypothetical protein  40.26 
 
 		 323 aa  192  6e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0982031  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1305  putative transmembrane protein  39.55 
 
 		 314 aa  191  1e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.508017  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3880  hypothetical protein  38.83 
 
 		 313 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1428  hypothetical protein  42.76 
 
 		 313 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0113552  hitchhiker  0.00361312 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04617  integral membrane protein  39.79 
 
 		 400 aa  174  1.9999999999999998e-42  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.938571  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3783  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.14 
 
 		 321 aa  134  9.999999999999999e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.242799  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4689  hypothetical protein  31.82 
 
 		 321 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.16874  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1790  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.01 
 
 		 325 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4464  hypothetical protein  31.82 
 
 		 321 aa  134  3e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0577375  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04082  predicted inner membrane protein  31.82 
 
 		 324 aa  134  3e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0217591  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04045  hypothetical protein  31.82 
 
 		 324 aa  134  3e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0254567  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3796  hypothetical protein  31.82 
 
 		 321 aa  134  3e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0293258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4779  hypothetical protein  31.82 
 
 		 321 aa  134  3e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00613349  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5727  hypothetical protein  31.82 
 
 		 321 aa  133  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.229908  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4751  hypothetical protein  31.82 
 
 		 321 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.289249  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0381  hypothetical protein  32.25 
 
 		 321 aa  131  2.0000000000000002e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.822543  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0510  hypothetical protein  31.43 
 
 		 322 aa  130  2.0000000000000002e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00686238 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3644  hypothetical protein  30.99 
 
 		 347 aa  130  3e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.379203  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1271  hypothetical protein  33.14 
 
 		 327 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4798  inner membrane protein YtfF  30.67 
 
 		 321 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4668  inner membrane protein YtfF  30.35 
 
 		 321 aa  127  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4818  hypothetical protein  30.35 
 
 		 321 aa  127  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.451451  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4678  inner membrane protein YtfF  30.35 
 
 		 321 aa  127  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.121802  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4763  inner membrane protein YtfF  30.35 
 
 		 321 aa  126  5e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2538  hypothetical protein  28.57 
 
 		 321 aa  125  9e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.975656  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4210  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.23 
 
 		 329 aa  122  6e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.633325  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1392  hypothetical protein  29.81 
 
 		 323 aa  121  9.999999999999999e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1288  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.84 
 
 		 327 aa  112  6e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1941  hypothetical protein  28.06 
 
 		 315 aa  105  7e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.205515  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3016  putative transmembrane protein  29.68 
 
 		 303 aa  102  6e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1897  hypothetical protein  32.24 
 
 		 310 aa  94.7  2e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.325254 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2678  hypothetical protein  28.08 
 
 		 321 aa  88.2  2e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3714  putative transmembrane protein  26.51 
 
 		 322 aa  85.5  9e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.543491  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0303  hypothetical protein  23.53 
 
 		 341 aa  76.3  0.0000000000006  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.277394  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5570  putative transmembrane protein  26.48 
 
 		 317 aa  68.2  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0431678 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3565  hypothetical protein  24.84 
 
 		 324 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.28529  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3057  transporter, EamA family  25.65 
 
 		 303 aa  50.8  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2840  hypothetical protein  25.13 
 
 		 303 aa  50.4  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.269386  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3092  EamA family protein  25.13 
 
 		 303 aa  50.4  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00288744  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2848  EamA family protein  25 
 
 		 303 aa  50.4  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3073  transporter, EamA family  25 
 
 		 303 aa  50.4  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2821  drug/metabolite exporter family protein  25.13 
 
 		 303 aa  50.4  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3061  eama family protein  25 
 
 		 303 aa  50.4  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2780  drug/metabolite exporter family protein  25.13 
 
 		 303 aa  50.1  0.00005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2189  transporter, EamA family  24.61 
 
 		 303 aa  50.1  0.00006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000931242 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3090  transporter, EamA family  24.61 
 
 		 303 aa  49.7  0.00006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0880872  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2043  hypothetical protein  24.48 
 
 		 304 aa  48.1  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.234067  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2271  hypothetical protein  25.52 
 
 		 308 aa  45.1  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0233167  normal  0.0209827 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>