More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_1249 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_1249  histidinol-phosphate aminotransferase  100 
 
 
367 aa  756    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.109002  normal  0.0431111 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1185  histidinol-phosphate aminotransferase  68.23 
 
 
380 aa  498  1e-140  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.318294 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1205  histidinol-phosphate aminotransferase  67.4 
 
 
380 aa  498  1e-140  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.67172  normal  0.780528 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1116  histidinol-phosphate aminotransferase  49.45 
 
 
370 aa  343  2e-93  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.177687 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3038  histidinol-phosphate aminotransferase  50.28 
 
 
365 aa  342  5e-93  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.141855  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0175  histidinol-phosphate aminotransferase  49.06 
 
 
370 aa  337  1.9999999999999998e-91  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.645733  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2193  histidinol-phosphate aminotransferase  46.7 
 
 
392 aa  335  7e-91  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0612  histidinol-phosphate aminotransferase  47.51 
 
 
369 aa  334  1e-90  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1024  histidinol-phosphate aminotransferase  48.21 
 
 
374 aa  331  1e-89  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1194  histidinol-phosphate aminotransferase  45.28 
 
 
373 aa  327  3e-88  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4075  histidinol-phosphate aminotransferase  48.09 
 
 
370 aa  323  3e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000427384  normal  0.244863 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0742  histidinol-phosphate aminotransferase  45.87 
 
 
371 aa  318  6e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3005  histidinol-phosphate aminotransferase  45.78 
 
 
370 aa  315  8e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.13886  normal  0.0347946 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0775  histidinol-phosphate aminotransferase  46.67 
 
 
374 aa  315  9e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00278497 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1684  histidinol-phosphate aminotransferase  46.13 
 
 
369 aa  315  9.999999999999999e-85  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23290  histidinol-phosphate aminotransferase  47.4 
 
 
369 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.113747 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0905  histidinol-phosphate aminotransferase  47.19 
 
 
374 aa  313  3.9999999999999997e-84  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15840  histidinol-phosphate aminotransferase  47.28 
 
 
370 aa  312  4.999999999999999e-84  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0978  histidinol-phosphate aminotransferase  44.29 
 
 
370 aa  311  1e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.811497  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0846  histidinol-phosphate aminotransferase  47.31 
 
 
374 aa  308  6.999999999999999e-83  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0562865 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1851  histidinol-phosphate aminotransferase  46.32 
 
 
369 aa  308  8e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.328665  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1964  histidinol-phosphate aminotransferase  46.58 
 
 
369 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0927  histidinol-phosphate aminotransferase  46.11 
 
 
379 aa  305  1.0000000000000001e-81  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0717  histidinol-phosphate aminotransferase  46.17 
 
 
374 aa  302  7.000000000000001e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2574  histidinol-phosphate aminotransferase  45.71 
 
 
376 aa  300  4e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.62978  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1233  histidinol-phosphate aminotransferase  46.3 
 
 
362 aa  298  7e-80  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1417  histidinol-phosphate aminotransferase  46.69 
 
 
371 aa  297  2e-79  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0496  histidinol-phosphate aminotransferase  45.86 
 
 
374 aa  296  6e-79  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.128785  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0952  histidinol-phosphate aminotransferase  46.37 
 
 
384 aa  295  8e-79  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.221365  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1312  histidinol-phosphate aminotransferase  46.83 
 
 
374 aa  292  7e-78  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000000790606 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1198  histidinol-phosphate aminotransferase  41.44 
 
 
370 aa  289  6e-77  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.107306  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1539  histidinol-phosphate aminotransferase  43.9 
 
 
373 aa  284  1.0000000000000001e-75  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1594  histidinol-phosphate aminotransferase  42.42 
 
 
365 aa  280  3e-74  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.121928 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2138  histidinol-phosphate aminotransferase  42.66 
 
 
363 aa  278  8e-74  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.302169  normal  0.180028 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2116  histidinol-phosphate aminotransferase  41.29 
 
 
388 aa  277  2e-73  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000848316  unclonable  0.00000966557 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0567  histidinol-phosphate aminotransferase  42.06 
 
 
381 aa  276  3e-73  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0846  histidinol-phosphate aminotransferase  40.56 
 
 
358 aa  272  5.000000000000001e-72  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1335  histidinol-phosphate aminotransferase  44.39 
 
 
394 aa  270  2.9999999999999997e-71  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.687157  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0898  histidinol-phosphate aminotransferase  43.98 
 
 
365 aa  268  1e-70  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.907335  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1020  histidinol-phosphate aminotransferase  43.98 
 
 
365 aa  268  1e-70  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.874382  unclonable  0.0000000000413694 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1983  histidinol-phosphate aminotransferase  39.04 
 
 
362 aa  268  2e-70  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000438985  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0515  histidinol phosphate aminotransferase  42.3 
 
 
386 aa  266  4e-70  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.839874  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2137  histidinol-phosphate aminotransferase  42.94 
 
 
365 aa  259  7e-68  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1208  histidinol-phosphate aminotransferase  42.06 
 
 
385 aa  254  1.0000000000000001e-66  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0342464  normal  0.0473532 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01910  Histidinol-phosphate transaminase  36.89 
 
 
372 aa  254  1.0000000000000001e-66  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0824  histidinol-phosphate aminotransferase  38.32 
 
 
383 aa  253  4.0000000000000004e-66  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0205035  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2310  histidinol-phosphate aminotransferase  43.06 
 
 
364 aa  252  6e-66  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.357051 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1184  histidinol-phosphate aminotransferase  39.89 
 
 
362 aa  249  6e-65  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00881865  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1681  histidinol-phosphate aminotransferase  38.48 
 
 
370 aa  248  1e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1645  histidinol-phosphate aminotransferase  38.76 
 
 
370 aa  246  6e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1442  histidinol-phosphate aminotransferase  37.15 
 
 
370 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1400  histidinol-phosphate aminotransferase  38.2 
 
 
370 aa  243  5e-63  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1428  histidinol-phosphate aminotransferase  38.2 
 
 
370 aa  242  6e-63  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1539  histidinol-phosphate aminotransferase  38.2 
 
 
370 aa  242  6e-63  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1612  histidinol-phosphate aminotransferase  38.76 
 
 
370 aa  242  6e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0219277 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1400  histidinol-phosphate aminotransferase  38.2 
 
 
370 aa  241  2e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.563984  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1241  histidinol-phosphate aminotransferase  37.71 
 
 
370 aa  241  2e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9607  histidinol-phosphate aminotransferase  39.53 
 
 
368 aa  239  4e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0482  histidinol-phosphate aminotransferase  40.78 
 
 
365 aa  238  1e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1974  histidinol-phosphate aminotransferase  38.63 
 
 
369 aa  234  2.0000000000000002e-60  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1155  histidinol-phosphate aminotransferase  37.36 
 
 
363 aa  233  4.0000000000000004e-60  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4299  aminotransferase  38.66 
 
 
373 aa  233  4.0000000000000004e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1679  histidinol-phosphate aminotransferase  39.76 
 
 
362 aa  233  5e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1979  histidinol-phosphate aminotransferase  38.63 
 
 
369 aa  233  6e-60  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0307  histidinol-phosphate aminotransferase  40.12 
 
 
378 aa  231  1e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.210737  normal  0.185476 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2379  histidinol phosphate aminotransferase  37.35 
 
 
362 aa  228  1e-58  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.279952 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1583  histidinol-phosphate aminotransferase  37.54 
 
 
373 aa  225  9e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.423386 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2282  histidinol-phosphate aminotransferase  36.84 
 
 
366 aa  224  2e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000137435 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1868  histidinol-phosphate aminotransferase  37.71 
 
 
386 aa  223  3e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0318031  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3771  histidinol-phosphate aminotransferase  37.92 
 
 
370 aa  223  3e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2049  histidinol-phosphate aminotransferase  35.9 
 
 
373 aa  223  4e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.679361  hitchhiker  0.000000000231729 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2996  histidinol-phosphate aminotransferase  37.67 
 
 
366 aa  223  4.9999999999999996e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.77849  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3864  aminotransferase  35.07 
 
 
374 aa  223  4.9999999999999996e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.502444  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1574  histidinol-phosphate aminotransferase  38.2 
 
 
370 aa  223  6e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1593  histidinol-phosphate aminotransferase  39.52 
 
 
372 aa  222  9.999999999999999e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.366496  normal  0.0868494 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2197  histidinol-phosphate aminotransferase  35.83 
 
 
366 aa  221  9.999999999999999e-57  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0959  histidinol-phosphate aminotransferase  37.42 
 
 
361 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00272091  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0695  histidinol-phosphate aminotransferase  38.99 
 
 
372 aa  221  1.9999999999999999e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.736115  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1646  histidinol-phosphate aminotransferase  39.64 
 
 
372 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3002  histidinol-phosphate aminotransferase  36.57 
 
 
366 aa  219  6e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0113319  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1874  histidinol-phosphate aminotransferase  39.22 
 
 
372 aa  219  7e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.292128  normal  0.0493927 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0387  histidinol-phosphate aminotransferase  37.82 
 
 
351 aa  218  1e-55  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2696  histidinol-phosphate aminotransferase  36.29 
 
 
366 aa  218  1e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1034  histidinol-phosphate aminotransferase  36.89 
 
 
360 aa  218  1e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.843558  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3084  histidinol-phosphate aminotransferase  38.05 
 
 
366 aa  218  1e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0394  histidinol-phosphate aminotransferase  39.47 
 
 
392 aa  218  2e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0567714  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2284  histidinol-phosphate aminotransferase  37.11 
 
 
361 aa  218  2e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3006  histidinol-phosphate aminotransferase  37.74 
 
 
368 aa  218  2e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2746  histidinol-phosphate aminotransferase  36.29 
 
 
366 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2955  histidinol-phosphate aminotransferase  36.29 
 
 
366 aa  217  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.24092e-22 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2955  histidinol-phosphate aminotransferase  36.29 
 
 
366 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0331892  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4927  histidinol-phosphate aminotransferase  36.04 
 
 
365 aa  216  4e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2213  histidinol-phosphate aminotransferase  37.11 
 
 
361 aa  216  4e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2958  histidinol-phosphate aminotransferase  36.57 
 
 
366 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2675  histidinol-phosphate aminotransferase  36.29 
 
 
366 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2749  histidinol-phosphate aminotransferase  36.19 
 
 
366 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5257  histidinol-phosphate aminotransferase  40.3 
 
 
370 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0312345  normal  0.0211103 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0471  histidinol-phosphate aminotransferase  34.37 
 
 
364 aa  213  4.9999999999999996e-54  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4283  histidinol-phosphate aminotransferase  35.44 
 
 
365 aa  211  2e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0212802 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3873  histidinol-phosphate aminotransferase  39.05 
 
 
369 aa  210  3e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0584274 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>