More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_1015 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007204  Psyc_1232  protein kinase  78.37 
 
 
451 aa  705    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.963703 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1159  hypothetical protein  78.37 
 
 
453 aa  701    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0152108 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1015  hypothetical protein  100 
 
 
432 aa  897    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000662027  hitchhiker  0.000135792 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0003  hypothetical protein  44.55 
 
 
423 aa  398  9.999999999999999e-111  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00161336  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_21207  predicted protein  42.47 
 
 
517 aa  322  6e-87  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_2153  predicted protein  40.2 
 
 
397 aa  304  2.0000000000000002e-81  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.104794 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2723  ABC-1 domain protein  32.93 
 
 
464 aa  229  7e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.232174  normal  0.409257 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4556  ABC-1 domain protein  31.83 
 
 
456 aa  195  1e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1092  ABC-1 domain protein  31.41 
 
 
559 aa  191  2e-47  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.444876  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2852  hypothetical protein  30 
 
 
537 aa  189  1e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2537  hypothetical protein  30.5 
 
 
537 aa  188  1e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15860  predicted unusual protein kinase  31.03 
 
 
550 aa  187  5e-46  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0295  ABC-1 domain protein  28.72 
 
 
558 aa  186  1.0000000000000001e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0954  hypothetical protein  31.88 
 
 
452 aa  185  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1464  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  29.97 
 
 
555 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00546242  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0972  hypothetical protein  31.88 
 
 
452 aa  185  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0247745 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0975  hypothetical protein  31.06 
 
 
455 aa  183  6e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.127437  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2578  2-octaprenylphenol hydroxylase  27.34 
 
 
559 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.152488  normal  0.0679255 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10660  hypothetical protein  30.87 
 
 
488 aa  179  7e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0203819  normal  0.0597798 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5111  hypothetical protein  30.87 
 
 
455 aa  179  1e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.448603 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1241  hypothetical protein  30.36 
 
 
451 aa  175  9.999999999999999e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.279292 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1612  ABC-1 domain protein  28.64 
 
 
557 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.504596  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1733  hypothetical protein  29.42 
 
 
557 aa  174  1.9999999999999998e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00187554  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1207  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  27.57 
 
 
553 aa  174  2.9999999999999996e-42  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.842555  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2106  hypothetical protein  29.05 
 
 
559 aa  174  2.9999999999999996e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00766182 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2561  ABC-1 domain protein  28.5 
 
 
558 aa  172  1e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1172  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  27 
 
 
558 aa  171  2e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1693  ABC-1 domain protein  29.93 
 
 
565 aa  171  2e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.12515  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1648  2-octaprenylphenol hydroxylase  26.44 
 
 
559 aa  171  2e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3956  ABC-1 domain protein  28.31 
 
 
552 aa  172  2e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.186201 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5305  ABC-1 domain protein  29.93 
 
 
565 aa  171  2e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1760  ABC-1 domain-containing protein  26.82 
 
 
547 aa  170  5e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.794373  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2681  hypothetical protein  28.14 
 
 
547 aa  169  1e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.259023 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2586  ABC-1 domain protein  28.79 
 
 
562 aa  168  2e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4898  ABC1 family protein  27.23 
 
 
558 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12230  2-octaprenylphenol hydroxylase  27.55 
 
 
559 aa  167  2.9999999999999998e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0168037  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0342  ABC1 family protein  28.28 
 
 
551 aa  167  4e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0400  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  27.2 
 
 
546 aa  167  5e-40  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1088  ubiquinone biosynthesis protein AarF, putative  28.91 
 
 
561 aa  165  1.0000000000000001e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0289446  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2342  ubiquinone biosynthesis protein AarF, putative  26.28 
 
 
563 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000602733  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1333  ABC-1 domain protein  28.89 
 
 
543 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.333757 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2950  ABC-1 domain protein  25.25 
 
 
549 aa  166  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0769  ABC-1 domain protein  28.89 
 
 
543 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.477502 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0071  2-octaprenylphenol hydroxylase  27.82 
 
 
553 aa  165  2.0000000000000002e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1021  hypothetical protein  28.89 
 
 
556 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.396117  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0760  2-octaprenylphenol hydroxylase  28.44 
 
 
561 aa  164  3e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0240  ABC-1 domain protein  29.56 
 
 
544 aa  163  7e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0061  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  26.73 
 
 
558 aa  162  1e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1474  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  28.02 
 
 
561 aa  162  1e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.604813 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0856  hypothetical protein  27.65 
 
 
555 aa  161  2e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1941  ABC-1 domain protein  25.75 
 
 
549 aa  160  3e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0101  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  26.51 
 
 
561 aa  160  3e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.207696  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0243  hypothetical protein  28.16 
 
 
565 aa  160  3e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.469557  normal  0.547936 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2235  hypothetical protein  26.42 
 
 
666 aa  160  5e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00408279  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1207  ABC transporter  26.94 
 
 
556 aa  160  5e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.694462  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2664  2-octaprenylphenol hydroxylase  26 
 
 
573 aa  160  6e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.948881  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2205  hypothetical protein  27.78 
 
 
552 aa  159  7e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4010  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  28.03 
 
 
522 aa  159  8e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000133652 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0647  hypothetical protein  27.75 
 
 
565 aa  159  9e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000186884  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0918  serine/threonine protein kinase  25.92 
 
 
526 aa  159  1e-37  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2415  hypothetical protein  29.58 
 
 
545 aa  158  1e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0766121  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2019  ubiquinone biosynthesis protein AarF  26.86 
 
 
542 aa  157  3e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1228  unusual protein kinase  27.06 
 
 
606 aa  157  3e-37  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.99408  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2150  ABC-1 domain protein  26.85 
 
 
557 aa  157  4e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.181383  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03381  ABC transporter substrate binding protein  26.98 
 
 
574 aa  157  4e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0825  ABC-1 domain protein  24.81 
 
 
558 aa  157  4e-37  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2240  ABC-1 domain protein  27.23 
 
 
557 aa  157  5.0000000000000005e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.319336  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3377  ABC-1 domain protein  29.59 
 
 
557 aa  157  5.0000000000000005e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.118171 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1388  hypothetical protein  27.76 
 
 
561 aa  157  5.0000000000000005e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000298772  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1699  2-octaprenylphenol hydroxylase  27.23 
 
 
557 aa  156  6e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1047  protein kinase  26.3 
 
 
525 aa  156  8e-37  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1817  hypothetical protein  26.79 
 
 
571 aa  156  8e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.457399  normal  0.0626146 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3335  ABC-1 domain protein  25.93 
 
 
549 aa  155  1e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0521538  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2767  ABC-1 domain protein  25.93 
 
 
549 aa  155  1e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2905  ABC-1 domain-containing protein  24.94 
 
 
574 aa  155  1e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3415  hypothetical protein  27.68 
 
 
560 aa  155  2e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00362763 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3756  ABC-1 domain protein  26.91 
 
 
563 aa  155  2e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1536  ABC-1 domain protein  29.84 
 
 
556 aa  155  2e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3885  2-octaprenylphenol hydroxylase  27.72 
 
 
532 aa  154  2.9999999999999998e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3494  2-octaprenylphenol hydroxylase  27.92 
 
 
530 aa  154  4e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2972  hypothetical protein  25.42 
 
 
549 aa  153  7e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45430  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  26.43 
 
 
537 aa  153  7e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4100  ABC-1 domain-containing protein  25 
 
 
659 aa  152  8.999999999999999e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1871  ubiquinone biosynthesis protein AarF, putative  26.48 
 
 
568 aa  152  1e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1843  hypothetical protein  30.93 
 
 
549 aa  152  1e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.295975  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4049  hypothetical protein  25.73 
 
 
556 aa  152  2e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.240057  normal  0.746059 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5397  2-octaprenylphenol hydroxylase  28.33 
 
 
501 aa  152  2e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.567178  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3267  ABC-1 domain protein  25.45 
 
 
567 aa  151  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5555  2-octaprenylphenol hydroxylase  27.38 
 
 
584 aa  151  2e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1709  hypothetical protein  27.62 
 
 
514 aa  151  2e-35  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0661252 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2820  hypothetical protein  25.18 
 
 
549 aa  150  3e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0719  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  26.55 
 
 
509 aa  151  3e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0994  2-octaprenylphenol hydroxylase  26.88 
 
 
559 aa  150  4e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.380493  normal  0.425074 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2345  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  26.26 
 
 
557 aa  150  4e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.391466  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3020  hypothetical protein  27.18 
 
 
544 aa  150  5e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.087256 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5113  ABC-1 domain protein  26.93 
 
 
544 aa  150  5e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2816  hypothetical protein  33.44 
 
 
434 aa  150  6e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0902  ABC-1 domain protein  28.17 
 
 
560 aa  149  7e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3247  ABC-1 domain protein  25.83 
 
 
558 aa  149  7e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000474003  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00151  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  26.15 
 
 
558 aa  149  8e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>