229 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_3905 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_3905  polysaccharide export protein  100 
 
 		 354 aa  710    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.132595 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2609  polysaccharide export protein  52.99 
 
 		 376 aa  373  1e-102  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1559  polysaccharide export protein  29.3 
 
 		 392 aa  129  9.000000000000001e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.053083  normal  0.0507525 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0619  polysaccharide export protein  30.9 
 
 		 376 aa  119  6e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.112684  normal  0.159669 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0578  polysaccharide biosynthesis/export protein  28.45 
 
 		 375 aa  118  1.9999999999999998e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.809222  n/a   
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4086  polysaccharide export protein  31.39 
 
 		 360 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.194923  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1296  polysaccharide export protein  27.2 
 
 		 378 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.660258  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2714  polysaccharide export protein  28.13 
 
 		 393 aa  117  3e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2133  polysaccharide export protein  31.52 
 
 		 375 aa  117  3e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2754  polysaccharide export protein  29.79 
 
 		 391 aa  116  5e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.982682  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4093  hypothetical protein  31.1 
 
 		 356 aa  116  6.9999999999999995e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.818341  normal  0.104815 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0416  polysaccharide export protein  33.1 
 
 		 377 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.482624  normal  0.901304 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6038  polysaccharide export protein  28.57 
 
 		 380 aa  115  1.0000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3701  polysaccharide export protein  26.77 
 
 		 392 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4540  polysaccharide export protein  26.77 
 
 		 387 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0169971  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2717  polysaccharide export protein  29.27 
 
 		 379 aa  115  1.0000000000000001e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.335454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3823  polysaccharide export protein  26.77 
 
 		 387 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.87104  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0759  putative capsule polysaccharide exporter  28.33 
 
 		 378 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3782  polysaccharide export protein  28.73 
 
 		 402 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2273  polysaccharide export protein  27.3 
 
 		 392 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.534811  normal  0.26202 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3419  polysaccharide export protein  27.72 
 
 		 384 aa  115  2.0000000000000002e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0961152  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0740  polysaccharide export protein  27.91 
 
 		 379 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2418  polysaccharide export protein  28.33 
 
 		 378 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.160125 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3036  polysaccharide export protein  26.8 
 
 		 378 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1533  polysaccharide export protein  28.38 
 
 		 397 aa  114  3e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06665  hypothetical protein  30.14 
 
 		 373 aa  113  5e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5549  polysaccharide export protein  26.25 
 
 		 392 aa  113  5e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2984  polysaccharide export protein  27.38 
 
 		 403 aa  112  7.000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.182191  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3726  polysaccharide export protein  26.25 
 
 		 392 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.489348  normal  0.448229 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4916  polysaccharide export protein  29.72 
 
 		 397 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.713407  hitchhiker  0.000554375 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001119  polysaccharide export lipoprotein wza  31.21 
 
 		 317 aa  112  1.0000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000135082  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5370  polysaccharide export protein  31.51 
 
 		 391 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2347  polysaccharide export protein  26.72 
 
 		 363 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2613  polysaccharide export protein  29.16 
 
 		 379 aa  110  3e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.139508 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1028  putative capsule polysaccharide export outer membrane protein  28.8 
 
 		 440 aa  110  3e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.220124  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00986  predicted exopolysaccharide export protein  29.16 
 
 		 379 aa  110  5e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2660  polysaccharide export protein  29.16 
 
 		 379 aa  110  5e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00993  hypothetical protein  29.16 
 
 		 379 aa  110  5e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1099  outer membrane lipoprotein, group 4 capsule (G4C) polysaccharide  29.16 
 
 		 386 aa  110  5e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0031657  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1060  polysaccharide export protein  32.08 
 
 		 393 aa  110  5e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1219  outer membrane lipoprotein, group 4 capsule (G4C) polysaccharide  29.16 
 
 		 379 aa  110  5e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1092  outer membrane lipoprotein, group 4 capsule (G4C) polysaccharide  28.88 
 
 		 386 aa  109  6e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2332  outer membrane lipoprotein, group 4 capsule (G4C) polysaccharide  28.88 
 
 		 386 aa  109  7.000000000000001e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.132677  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0915  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  30.25 
 
 		 396 aa  108  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.138032  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3232  polysaccharide export protein  26.63 
 
 		 422 aa  108  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2620  capsular polysaccharide biosynthesis/export protein  30.25 
 
 		 391 aa  108  1e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2482  capsular polysaccharide biosynthesis/export protein  30.25 
 
 		 391 aa  108  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.153813  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3057  polysaccharide export protein  27.59 
 
 		 440 aa  108  2e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.521526  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3859  polysaccharide export protein  27.67 
 
 		 398 aa  107  3e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.329436 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3820  polysaccharide export protein  29.11 
 
 		 404 aa  107  3e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.388057  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2589  polysaccharide export protein  27.95 
 
 		 397 aa  107  4e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2243  polysaccharide (EPS I) exporter  27.8 
 
 		 407 aa  107  4e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0548899  normal  0.73055 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2975  capsule polysaccharide export protein, BexD/CtrA/VexA family  27.95 
 
 		 390 aa  107  4e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0546  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  29.83 
 
 		 396 aa  106  5e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2894  polysaccharide export protein  27 
 
 		 377 aa  106  5e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0993342  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2458  polysaccharide biosynthesis/export protein  27.07 
 
 		 379 aa  106  7e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0550214 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2344  polysaccharide biosynthesis/export protein  27.07 
 
 		 379 aa  106  7e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.675285  normal  0.855008 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1958  polysaccharide export protein  27.8 
 
 		 407 aa  104  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.676148  normal  0.565154 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5851  EPS I polysaccharide export outer membrane protein  29.07 
 
 		 362 aa  104  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.677542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3781  polysaccharide export protein  25.89 
 
 		 396 aa  104  2e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.543784  normal  0.42896 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7135  polysaccharide export protein  28.49 
 
 		 389 aa  105  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6357  polysaccharide export protein  27.9 
 
 		 389 aa  103  3e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.168651 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0324  polysaccharide export protein  27.88 
 
 		 410 aa  104  3e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1938  polysaccharide export protein  27.6 
 
 		 410 aa  103  4e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.231854  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1114  polysaccharide export protein  27.76 
 
 		 431 aa  103  5e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0366205  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2676  polysaccharide export protein  25.54 
 
 		 379 aa  103  6e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.259667 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0093  polysaccharide export protein  25.13 
 
 		 410 aa  102  7e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.249835 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1327  WcbC  29.45 
 
 		 422 aa  102  1e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3037  polysaccharide export protein  26.35 
 
 		 365 aa  101  2e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01968  lipoprotein required for capsular polysaccharide translocation through the outer membrane  25.82 
 
 		 379 aa  100  4e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1595  polysaccharide export protein  25.82 
 
 		 379 aa  100  4e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.249253  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2355  polysaccharide biosynthesis/export protein  25.82 
 
 		 379 aa  100  4e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3232  polysaccharide export protein  27.02 
 
 		 362 aa  100  4e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.549213  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1000  polysaccharide biosynthesis/export protein  25.82 
 
 		 379 aa  100  4e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2997  polysaccharide biosynthesis/export protein  25.82 
 
 		 379 aa  100  4e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0597184 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2351  polysaccharide biosynthesis/export protein  26.71 
 
 		 351 aa  100  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2243  polysaccharide biosynthesis/export protein  26.71 
 
 		 348 aa  100  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1170  polysaccharide biosynthesis/export protein  25.82 
 
 		 379 aa  100  4e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1579  polysaccharide export protein  25.82 
 
 		 379 aa  100  4e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.479279  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01957  hypothetical protein  25.82 
 
 		 379 aa  100  4e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2300  polysaccharide biosynthesis/export protein  26.71 
 
 		 348 aa  100  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.631767  normal  0.480899 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1161  polysaccharide export protein  30.61 
 
 		 388 aa  100  5e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0571636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2193  polysaccharide biosynthesis/export protein  27 
 
 		 378 aa  100  5e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000597973  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3494  polysaccharide export protein  28.72 
 
 		 387 aa  99.8  6e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.437041  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2867  polysaccharide export protein  25.97 
 
 		 378 aa  99.8  7e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1033  polysaccharide export protein  24.86 
 
 		 400 aa  99.4  8e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1712  polysaccharide export protein  26.65 
 
 		 386 aa  99.4  8e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.69321  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2463  polysaccharide export protein  27.42 
 
 		 390 aa  99.4  9e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.118558 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4429  polysaccharide export protein  26.98 
 
 		 374 aa  97.8  2e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.145769  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0287  polysaccharide export protein  29.9 
 
 		 409 aa  98.2  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0771  polysaccharide export protein  29.9 
 
 		 409 aa  98.2  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3767  polysaccharide export protein  26.27 
 
 		 419 aa  97.8  3e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.607345 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2307  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  27.49 
 
 		 387 aa  96.7  5e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3301  WcbC  27.49 
 
 		 387 aa  96.7  5e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0776528  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0253  polysaccharide export protein  26.79 
 
 		 367 aa  96.7  5e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.138137  decreased coverage  0.000559198 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3254  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  27.49 
 
 		 387 aa  96.7  5e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2185  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  27.49 
 
 		 387 aa  96.7  5e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1583  polysaccharide export protein  26.67 
 
 		 378 aa  96.7  6e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.323182  normal  0.546592 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0728  polysaccharide export protein  25.82 
 
 		 406 aa  96.7  6e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0592295  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1078  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  27.49 
 
 		 378 aa  96.7  6e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.273848  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>