More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_3187 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_0634  ferredoxin  100 
 
 
468 aa  976    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1629  ferredoxin  100 
 
 
468 aa  976    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3187  ferredoxin  100 
 
 
468 aa  976    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1282  ferredoxin  36.69 
 
 
583 aa  280  5e-74  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1383  ferredoxin  36.69 
 
 
583 aa  279  6e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0368296  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2566  ferredoxin  37.32 
 
 
583 aa  279  7e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1294  ferredoxin  37.21 
 
 
603 aa  274  2.0000000000000002e-72  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4517  NADH:ubiquinone oxidoreductase, subunit G, iron- sulphur binding protein  34.33 
 
 
539 aa  244  1.9999999999999999e-63  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.594649  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0162  NADH-quinone oxidoreductase, g subunit  35.96 
 
 
464 aa  239  9e-62  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0967  NADH dehydrogenase subunit G  41.69 
 
 
791 aa  237  4e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0699273  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0933  NADH dehydrogenase subunit G  41.36 
 
 
790 aa  236  8e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3863  ferredoxin  30.84 
 
 
569 aa  232  1e-59  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0480  ferredoxin  30.66 
 
 
628 aa  231  2e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.257942 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2056  NADH dehydrogenase subunit G  41.67 
 
 
783 aa  228  1e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.81056  normal  0.0464837 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2208  NADH dehydrogenase subunit G  41.3 
 
 
783 aa  229  1e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.336643 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1885  NADH dehydrogenase subunit G  41.3 
 
 
783 aa  229  1e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.441319 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3504  NADH dehydrogenase subunit G  40.14 
 
 
720 aa  227  4e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5174  NADH dehydrogenase subunit G  40.54 
 
 
707 aa  226  5.0000000000000005e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3629  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  37.5 
 
 
797 aa  225  1e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.192772 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2624  NADH-quinone oxidoreductase, G subunit  37.85 
 
 
782 aa  224  2e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1409  putative NADH dehydrogenase I chain G  40.79 
 
 
771 aa  225  2e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0277288 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2251  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  37.85 
 
 
782 aa  224  2e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000992476 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2807  NADH dehydrogenase subunit G  40.27 
 
 
719 aa  224  4e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.434484  normal  0.352791 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0963  NADH dehydrogenase subunit G  39.19 
 
 
715 aa  223  6e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.409091  normal  0.052717 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1430  NADH dehydrogenase subunit G  39.86 
 
 
714 aa  223  7e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.718625 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3250  NADH dehydrogenase subunit G  38.38 
 
 
717 aa  222  9e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.521932  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1097  NADH dehydrogenase subunit G  39.73 
 
 
809 aa  222  9.999999999999999e-57  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1507  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  39.44 
 
 
770 aa  222  9.999999999999999e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00792374 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0878  NADH dehydrogenase subunit G  39.19 
 
 
710 aa  222  9.999999999999999e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1269  NADH dehydrogenase subunit G  39.08 
 
 
716 aa  220  3.9999999999999997e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.626778  normal  0.299354 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3389  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  31.03 
 
 
923 aa  220  3.9999999999999997e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2281  NADH dehydrogenase subunit G  34.53 
 
 
776 aa  220  5e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.936523  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2160  NADH dehydrogenase subunit G  34.53 
 
 
776 aa  219  6e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.26978  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1045  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  39.08 
 
 
771 aa  218  1e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0827  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  37.62 
 
 
771 aa  218  1e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.342284  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0955  NADH dehydrogenase subunit G  39.32 
 
 
777 aa  218  2e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.391451  normal  0.458803 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2267  NADH dehydrogenase subunit G  34.25 
 
 
776 aa  218  2e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.263925  normal  0.104437 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1631  NADH dehydrogenase subunit G  34.25 
 
 
776 aa  218  2e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.65954  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1034  NADH dehydrogenase subunit G  34.37 
 
 
776 aa  218  2e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.884498  normal  0.272009 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2243  NADH dehydrogenase subunit G  34.25 
 
 
776 aa  218  2e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5571  NADH dehydrogenase subunit G  34.25 
 
 
776 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.199302 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1748  NADH dehydrogenase subunit G  38.63 
 
 
779 aa  217  2.9999999999999998e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0731  NADH dehydrogenase subunit G  37.63 
 
 
776 aa  216  5e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1823  NADH dehydrogenase subunit G  37.63 
 
 
776 aa  216  5e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1305  NADH dehydrogenase subunit G  37.63 
 
 
776 aa  216  5e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1441  NADH dehydrogenase subunit G  37.63 
 
 
776 aa  216  5e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.147964  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1296  NADH dehydrogenase subunit G  37.63 
 
 
776 aa  216  5e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1136  NADH dehydrogenase subunit G  37.63 
 
 
776 aa  216  5e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.205487  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0419  NADH dehydrogenase subunit G  37.63 
 
 
776 aa  216  5e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.701161  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3208  NADH dehydrogenase subunit G  36.34 
 
 
777 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.453988  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2003  NADH dehydrogenase subunit G  35.49 
 
 
777 aa  216  7e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.643114  normal  0.247059 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1349  NADH dehydrogenase subunit G  37.67 
 
 
777 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0234349  normal  0.0108936 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1148  NADH dehydrogenase subunit G  40.07 
 
 
784 aa  215  1.9999999999999998e-54  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1067  NADH dehydrogenase subunit G  37.29 
 
 
776 aa  215  1.9999999999999998e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.149532  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2237  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  37.09 
 
 
918 aa  213  4.9999999999999996e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0823  NADH dehydrogenase subunit G  34.69 
 
 
700 aa  213  7e-54  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.477547  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1499  NADH dehydrogenase subunit G  35.61 
 
 
721 aa  212  1e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1611  ferredoxin  30.52 
 
 
560 aa  209  6e-53  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.972775 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1043  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  34.86 
 
 
903 aa  209  9e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2162  NADH dehydrogenase  32.73 
 
 
576 aa  209  1e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3087  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  34.49 
 
 
913 aa  208  2e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1561  NADH dehydrogenase subunit G  40.88 
 
 
689 aa  206  7e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1155  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  36.05 
 
 
823 aa  204  3e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39049  predicted protein  35.88 
 
 
685 aa  203  5e-51  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0489184  normal  0.0880451 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0369  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  37.32 
 
 
833 aa  201  1.9999999999999998e-50  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.55399  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2055  NADH dehydrogenase subunit G  34.94 
 
 
808 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1964  NADH dehydrogenase subunit G  35.59 
 
 
797 aa  201  3e-50  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0536465  normal  0.0616113 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2830  NADH dehydrogenase subunit G  37 
 
 
783 aa  199  7e-50  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0927  NADH dehydrogenase subunit G  39.02 
 
 
686 aa  199  7e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2699  NADH dehydrogenase subunit G  37 
 
 
783 aa  199  7.999999999999999e-50  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3334  NADH dehydrogenase subunit G  38.18 
 
 
689 aa  199  1.0000000000000001e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.318541 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1759  NADH dehydrogenase subunit G  37.5 
 
 
795 aa  198  2.0000000000000003e-49  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2825  NADH dehydrogenase subunit G  34.78 
 
 
744 aa  197  3e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.266066  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1544  NADH dehydrogenase subunit G  37.68 
 
 
801 aa  197  3e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.176892 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04288  NADH-ubiquinone oxidoreductase, subunit G, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G04370)  32.75 
 
 
738 aa  197  4.0000000000000005e-49  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.503379  normal  0.151595 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2559  NADH dehydrogenase subunit G  34.1 
 
 
797 aa  197  5.000000000000001e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.437488  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1611  NADH dehydrogenase subunit G  37.23 
 
 
787 aa  196  8.000000000000001e-49  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0552  NADH dehydrogenase subunit G  37.23 
 
 
787 aa  196  8.000000000000001e-49  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0714  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  36.63 
 
 
798 aa  194  4e-48  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3220  NADH dehydrogenase subunit G  37.59 
 
 
680 aa  193  7e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0246  NADH dehydrogenase subunit G  34.23 
 
 
744 aa  192  9e-48  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.527407  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2294  NADH dehydrogenase subunit G  34.9 
 
 
669 aa  192  9e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1598  NADH dehydrogenase subunit G  36.96 
 
 
801 aa  192  1e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1574  NADH dehydrogenase subunit G  36.96 
 
 
801 aa  192  1e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01293  NADH dehydrogenase subunit G  34.2 
 
 
739 aa  191  2.9999999999999997e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.245708  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4487  NADH dehydrogenase subunit G  36.23 
 
 
799 aa  191  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.293671  normal  0.0319104 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0275  NADH dehydrogenase subunit G  34.23 
 
 
744 aa  191  2.9999999999999997e-47  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB01310  NADH-ubiquinone oxidoreductase, putative  32.29 
 
 
775 aa  190  5e-47  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.754341  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0287  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  37.23 
 
 
801 aa  188  1e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2689  NADH dehydrogenase subunit G  37.23 
 
 
827 aa  188  1e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1958  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  35.27 
 
 
796 aa  189  1e-46  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.254325  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0053  NADH dehydrogenase subunit G  37.23 
 
 
679 aa  189  1e-46  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.292666  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1879  NADH dehydrogenase subunit G  36.59 
 
 
799 aa  188  2e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.780009  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0673  molybdopterin oxidoreductase  32.95 
 
 
822 aa  188  2e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.01358e-20 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4412  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  37.1 
 
 
815 aa  188  2e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1309  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  35.35 
 
 
788 aa  187  4e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0992  NADH dehydrogenase subunit G  33.73 
 
 
791 aa  186  5e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.529585  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0618  NADH dehydrogenase subunit G  34.49 
 
 
683 aa  186  6e-46  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0590  molybdopterin oxidoreductase  37.23 
 
 
807 aa  186  6e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.726223  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7685  NADH dehydrogenase subunit G  34.89 
 
 
839 aa  186  6e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>