53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_2218 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_2218  hypothetical protein  100 
 
 		 347 aa  718    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0675  hypothetical protein  77.58 
 
 		 343 aa  564  1e-160  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.575182  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0548  hypothetical protein  75.81 
 
 		 343 aa  550  1e-155  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0454  hypothetical protein  72.81 
 
 		 343 aa  538  9.999999999999999e-153  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1414  hypothetical protein  75.51 
 
 		 343 aa  538  9.999999999999999e-153  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0795  hypothetical protein  70.97 
 
 		 345 aa  525  1e-148  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0695397  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1681  hypothetical protein  68.04 
 
 		 347 aa  516  1.0000000000000001e-145  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2984  hypothetical protein  44.71 
 
 		 354 aa  289  4e-77  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1656  hypothetical protein  42.4 
 
 		 360 aa  282  7.000000000000001e-75  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00119867  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0466  hypothetical protein  39.59 
 
 		 351 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.297273  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3720  hypothetical protein  40.52 
 
 		 346 aa  269  5.9999999999999995e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.588173  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3546  hypothetical protein  40.52 
 
 		 346 aa  267  2e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.279975  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0410  hypothetical protein  40.52 
 
 		 346 aa  266  2.9999999999999995e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3289  hypothetical protein  39.53 
 
 		 366 aa  266  4e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.60491  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2062  hypothetical protein  40.88 
 
 		 362 aa  266  4e-70  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0480  hypothetical protein  39 
 
 		 349 aa  265  1e-69  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4072  hypothetical protein  38.6 
 
 		 358 aa  262  6e-69  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4194  hypothetical protein  39.71 
 
 		 346 aa  258  7e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3787  hypothetical protein  38.78 
 
 		 351 aa  258  1e-67  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0511  hypothetical protein  39.3 
 
 		 346 aa  257  2e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3367  hypothetical protein  40.06 
 
 		 350 aa  256  3e-67  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0533  hypothetical protein  39.71 
 
 		 350 aa  255  7e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3197  hypothetical protein  37.79 
 
 		 346 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0436  hypothetical protein  38.73 
 
 		 346 aa  253  3e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.574558  hitchhiker  0.00210413 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0450  hypothetical protein  38.44 
 
 		 346 aa  253  5.000000000000001e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00822  hypothetical protein  40 
 
 		 348 aa  252  6e-66  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3890  hypothetical protein  38.44 
 
 		 346 aa  252  7e-66  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.877982  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0424  hypothetical protein  38.44 
 
 		 346 aa  251  1e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1492  hypothetical protein  36.73 
 
 		 347 aa  248  9e-65  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.286308  normal  0.0796091 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001652  glycosyltransferase  40.35 
 
 		 348 aa  247  2e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00208  glycosyl transferase  36.8 
 
 		 349 aa  240  2.9999999999999997e-62  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4031  hypothetical protein  32.9 
 
 		 328 aa  158  1e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.510364  normal  0.913559 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3812  glycosyltransferase-distantly-related protein  31.23 
 
 		 346 aa  151  2e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.617912 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0336  teichoic acid biosynthesis related protein  31.56 
 
 		 355 aa  113  4.0000000000000004e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.244007  normal  0.581509 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2842  UDP-glucuronosyltransferase-like protein  27.96 
 
 		 371 aa  101  2e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0243  teichoic acid biosynthesis related protein  29 
 
 		 367 aa  99  1e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.256372  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0449  Glycosyltransferase 28 domain protein  28.98 
 
 		 377 aa  97.8  2e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0377577  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0254  teichoic acid biosynthesis related protein  28.7 
 
 		 367 aa  98.2  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0266168  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6653  putative UDP-glucuronosyltransferase  28.8 
 
 		 359 aa  97.8  3e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.873533  normal  0.109077 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0232  teichoic acid biosynthesis related protein  28.7 
 
 		 367 aa  97.4  3e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.422227  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1851  hypothetical protein  26.57 
 
 		 359 aa  90.9  3e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.316148  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0253  teichoic acid biosynthesis related protein  28.42 
 
 		 366 aa  90.9  3e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2254  teichoic acid biosynthesis related protein  26.58 
 
 		 381 aa  83.6  0.000000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.060696  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1235  teichoic acid biosynthesis related protein  26.63 
 
 		 360 aa  77.8  0.0000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2563  UDP- glucuronosyltransferase-like glycosyl transferase  26.63 
 
 		 371 aa  77  0.0000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.504516  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2719  teichoic acid biosynthesis related protein  27.33 
 
 		 388 aa  71.2  0.00000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.194172  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5685  Glycosyl transferase-like protein UDP- glucuronosyltransferase  24.85 
 
 		 382 aa  60.8  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.706833  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3660  putative glycosyltransferase  24.64 
 
 		 373 aa  60.5  0.00000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.359283  normal  0.0742075 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3193  hypothetical protein  22.5 
 
 		 337 aa  52.8  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.321046  normal  0.198699 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5656  hypothetical protein  20.41 
 
 		 364 aa  50.4  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.512867 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1442  Glycosyltransferase 28 domain protein  47.83 
 
 		 352 aa  44.3  0.003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1391  glycosyltransferase family 28 protein  23.84 
 
 		 361 aa  43.1  0.006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0759  hypothetical protein  32.82 
 
 		 359 aa  43.1  0.007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>