More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_1144 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011060  Ppha_1144  glycosyl transferase family 2  100 
 
 
209 aa  437  9.999999999999999e-123  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1087  glycosyl transferase family 2  60.77 
 
 
209 aa  273  1.0000000000000001e-72  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.674225 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1106  glycosyl transferase  60.4 
 
 
215 aa  261  6e-69  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.648038  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1391  glycosyl transferase family 2  56.37 
 
 
209 aa  244  6e-64  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.961124  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0910  glycosyl transferase  53.96 
 
 
212 aa  242  3e-63  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1154  glycosyl transferase family 2  55.45 
 
 
217 aa  242  3e-63  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5156  family 2 glycosyl transferase  52 
 
 
216 aa  236  1e-61  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1450  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  59.81 
 
 
134 aa  142  4e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.069354  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3252  glycosyl transferase family 2  33.91 
 
 
300 aa  115  5e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1453  glycosyl transferase  57.78 
 
 
101 aa  112  3e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.243286  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1626  glycosyl transferase family protein  35.53 
 
 
299 aa  109  2.0000000000000002e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5782  glycosyl transferase family 2  37.06 
 
 
317 aa  108  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2014  glycosyl transferase family protein  43.75 
 
 
303 aa  107  2e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0488163 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0132  glycosyl transferase family protein  31.8 
 
 
597 aa  106  3e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2372  glycosyl transferase family 2  44.83 
 
 
379 aa  103  2e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0633  glycosyl transferase family 2  31.9 
 
 
345 aa  102  4e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.810954  normal  0.460894 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0894  glycosyl transferase family 2  32.67 
 
 
235 aa  102  5e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0841  glycosyl transferase family protein  30.19 
 
 
318 aa  101  7e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.817689  hitchhiker  0.00989101 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3355  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 
233 aa  98.6  6e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0849  glycosyl transferase family protein  28.77 
 
 
321 aa  97.8  9e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0730658 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2799  glycosyl transferase family 2  28.89 
 
 
335 aa  97.4  1e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0840  glycosyl transferase family protein  29.91 
 
 
318 aa  97.4  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0249486 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0232  glycosyl transferase family 2  32.87 
 
 
276 aa  97.8  1e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3066  glycosyl transferase family protein  46.67 
 
 
402 aa  97.1  2e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2340  glycosyl transferase family protein  29.59 
 
 
310 aa  95.9  4e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2582  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 
1038 aa  95.5  5e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.601969  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0985  glycosyl transferase family protein  31.07 
 
 
289 aa  95.1  6e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1670  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 
219 aa  94.7  8e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0575  glycosyl transferase family 2  30.88 
 
 
320 aa  94.4  1e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.910069  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2413  glycosyl transferase family polysaccharide deacetylase  28.51 
 
 
672 aa  93.6  2e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.944476  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1327  hypothetical protein  31.79 
 
 
338 aa  93.2  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0232591  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1529  glycosyl transferase family 2  29.95 
 
 
214 aa  93.2  2e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.322486  normal  0.0695414 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1851  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.95 
 
 
214 aa  93.2  2e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2524  glycosyl transferase family 2  29.17 
 
 
337 aa  94  2e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0357419 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2105  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.7 
 
 
254 aa  92.4  5e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0121105  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4914  family 2 glycosyl transferase  32.54 
 
 
306 aa  92.4  5e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2025  glycosyl transferase family 2  33.7 
 
 
301 aa  91.7  7e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.661278  hitchhiker  0.00838436 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2686  glycosyl transferase family 2  30.65 
 
 
327 aa  91.7  7e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.81891  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1728  glycosyl transferase family 2  38.84 
 
 
573 aa  91.7  7e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.230858 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3802  glucosyltransferase  41.51 
 
 
341 aa  91.3  9e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1497  glycosyl transferase, group 2 family protein  37.02 
 
 
266 aa  90.5  1e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.366034  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1469  glycosyl transferase, group 2 family protein  36.11 
 
 
266 aa  91.3  1e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000134346  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0209  glycosyltransferase  46.46 
 
 
102 aa  90.9  1e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000668914  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0309  glycosyltransferase  32.63 
 
 
318 aa  90.9  1e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.544372 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1615  group 2 family glycosyl transferase  37.02 
 
 
266 aa  90.5  1e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.653601  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1683  glycosyl transferase, group 2 family protein  37.02 
 
 
266 aa  90.5  1e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2856  glycosyl transferase family protein  29.35 
 
 
333 aa  90.9  1e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3338  glycosyl transferase family protein  43.64 
 
 
1250 aa  90.9  1e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2767  glycosyl transferase family protein  30.57 
 
 
303 aa  90.9  1e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.280211  normal  0.34813 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1651  glycosyl transferase, group 2 family protein  36.11 
 
 
266 aa  90.1  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.590239  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1412  glycosyl transferase family protein  32.43 
 
 
255 aa  90.5  2e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2229  glycosyl transferase family protein  31.47 
 
 
274 aa  90.1  2e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1244  glycosyl transferase family protein  29.3 
 
 
390 aa  90.1  2e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2391  glycosyl transferase family 2  41.9 
 
 
244 aa  90.1  2e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1682  glycosyl transferase family protein  31.58 
 
 
365 aa  89.7  3e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0619  glycosyl transferase family 2  41.67 
 
 
310 aa  89.7  3e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3694  glycosyl transferase, group 2 family protein  36.11 
 
 
266 aa  89.7  3e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0843  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  28.43 
 
 
321 aa  89.7  3e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4771  glycosyl transferase family protein  33.9 
 
 
1035 aa  89.7  3e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.201139 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3636  glycosyl transferase family protein  33.7 
 
 
322 aa  89.7  3e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.281554  normal  0.0212445 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2003  glycosyl transferase family 2  29.14 
 
 
230 aa  89  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0117  glycosyl transferase family 2  29.73 
 
 
777 aa  89.4  4e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.389637  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2980  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  43.52 
 
 
317 aa  89  5e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.815971 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0398  glycosyl transferase family 2  30.39 
 
 
352 aa  89  5e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3163  glycosyl transferase family 2  31.12 
 
 
1177 aa  88.6  5e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2933  glycosyl transferase family 2  31.12 
 
 
1177 aa  88.6  6e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0297  glycosyl transferase family protein  26.99 
 
 
313 aa  88.6  6e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0961  glycosyl transferase family protein  32.08 
 
 
302 aa  88.2  8e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.121689  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3243  glycosyl transferase family protein  40.74 
 
 
337 aa  87.4  1e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0174671  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5268  glycosyl transferase family 2  33.94 
 
 
386 aa  87.4  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3065  glycosyl transferase family protein  31.51 
 
 
289 aa  87.8  1e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.807338  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4073  glycosyl transferase family protein  32.58 
 
 
334 aa  87.8  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.162964  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1133  glycosyl transferase family 2  37.38 
 
 
380 aa  87.4  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.568095  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00155  putative fucosyl transferase  29.53 
 
 
311 aa  86.7  2e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.749849  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3275  glycosyl transferase family 2  37.88 
 
 
362 aa  87  2e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.355424  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22790  glycosyl transferase family 2  32.19 
 
 
250 aa  87  2e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1723  glycosyl transferase family 2  37.25 
 
 
398 aa  87  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.195684  normal  0.0245035 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1510  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.48 
 
 
310 aa  86.3  3e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.932376  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3951  putative glycosyl transferase  32.54 
 
 
344 aa  86.3  3e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.174357  normal  0.660654 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3250  glycosyl transferase family protein  30.05 
 
 
302 aa  85.9  4e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.253985  normal  0.48335 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1594  glycosyl transferase family protein  33.14 
 
 
389 aa  85.9  4e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6724  glycosyl transferase family protein  30.37 
 
 
316 aa  85.9  4e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3198  glycosyl transferase family 2  29.38 
 
 
1015 aa  85.9  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3987  putative glycosyl transferase  31.25 
 
 
344 aa  85.5  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.993989 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1355  glycosyl transferase family protein  31.9 
 
 
310 aa  85.5  5e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4032  putative glycosyl transferase  31.25 
 
 
344 aa  85.5  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0315657  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0844  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  31.53 
 
 
312 aa  85.5  5e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0746386  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2378  glycosyl transferase family protein  28.5 
 
 
331 aa  85.5  5e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2365  glycosyl transferase family protein  38.28 
 
 
344 aa  85.5  5e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5106  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  39.6 
 
 
326 aa  85.5  6e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1961  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.77 
 
 
295 aa  85.1  7e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.76952  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2885  glycosyl transferase family protein  32.2 
 
 
300 aa  84.7  8e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.418881  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07280  glycosyl transferase  36.09 
 
 
272 aa  84.7  9e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.131156  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4118  putative glycosyl transferase  31.75 
 
 
344 aa  84  0.000000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.910618  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3925  putative glycosyl transferase  36.79 
 
 
344 aa  84  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1267  putative glycosyl transferase  38.66 
 
 
300 aa  84.3  0.000000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0793  glycosyl transferase family 2  34.26 
 
 
390 aa  84.3  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.568999  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5610  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  35.85 
 
 
326 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3906  putative glycosyl transferase  36.79 
 
 
344 aa  84  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.66206  normal  0.305957 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0270  glycosyl transferase family protein  26.94 
 
 
333 aa  83.6  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>