More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_0322 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_2262  adenylosuccinate synthetase  81.88 
 
 		 429 aa  736    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0914846 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0213  adenylosuccinate synthetase  84.33 
 
 		 434 aa  772    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.816026  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1816  adenylosuccinate synthetase  86.18 
 
 		 434 aa  790    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0322  adenylosuccinate synthetase  100 
 
 		 434 aa  896    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2196  adenylosuccinate synthetase  87.33 
 
 		 434 aa  802    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2031  adenylosuccinate synthetase  81.31 
 
 		 435 aa  738    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0290835 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2390  adenylosuccinate synthetase  88.94 
 
 		 434 aa  813    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1452  adenylosuccinate synthetase  60.24 
 
 		 433 aa  534  1e-150  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.719728  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4927  Adenylosuccinate synthase  50.59 
 
 		 427 aa  453  1.0000000000000001e-126  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000089661  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0492  adenylosuccinate synthetase  53.65 
 
 		 428 aa  449  1e-125  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3251  adenylosuccinate synthetase  50.71 
 
 		 430 aa  447  1.0000000000000001e-124  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.220385  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0735  adenylosuccinate synthetase  50.84 
 
 		 447 aa  446  1.0000000000000001e-124  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.772152 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3012  adenylosuccinate synthetase  51.9 
 
 		 427 aa  447  1.0000000000000001e-124  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0951897  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0706  adenylosuccinate synthetase  50.84 
 
 		 447 aa  446  1.0000000000000001e-124  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3308  adenylosuccinate synthetase  49.65 
 
 		 433 aa  444  1e-123  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00120298  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1818  adenylosuccinate synthetase  50.48 
 
 		 430 aa  443  1e-123  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0200825  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3260  adenylosuccinate synthetase  49.29 
 
 		 430 aa  443  1e-123  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0574684  hitchhiker  0.00000000000114461 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1913  adenylosuccinate synthetase  49.76 
 
 		 430 aa  444  1e-123  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2409  adenylosuccinate synthetase  48.21 
 
 		 444 aa  439  9.999999999999999e-123  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0382051  normal  0.0691331 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10362  adenylosuccinate synthetase  51.29 
 
 		 432 aa  438  9.999999999999999e-123  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.698825  normal  0.94506 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4368  adenylosuccinate synthetase  51.19 
 
 		 427 aa  439  9.999999999999999e-123  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.335736  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2354  adenylosuccinate synthetase  51.07 
 
 		 426 aa  441  9.999999999999999e-123  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0316685  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2691  adenylosuccinate synthetase  50 
 
 		 432 aa  436  1e-121  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.321196  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2598  adenylosuccinate synthetase  50 
 
 		 432 aa  437  1e-121  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.0051551  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07421  adenylosuccinate synthetase  48.7 
 
 		 439 aa  435  1e-121  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0203  adenylosuccinate synthetase  50.84 
 
 		 431 aa  436  1e-121  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  8.773480000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1265  adenylosuccinate synthetase  50.24 
 
 		 432 aa  437  1e-121  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0163864  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0203  adenylosuccinate synthetase  51.19 
 
 		 427 aa  436  1e-121  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0271  adenylosuccinate synthetase  50.48 
 
 		 427 aa  434  1e-120  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0133  adenylosuccinate synthase  49.77 
 
 		 807 aa  432  1e-120  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.279104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0211  adenylosuccinate synthetase  50 
 
 		 427 aa  432  1e-120  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.398163 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3282  adenylosuccinate synthetase  48.8 
 
 		 437 aa  433  1e-120  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00809393  normal  0.019729 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05071  adenylosuccinate synthetase  47.97 
 
 		 437 aa  433  1e-120  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.22054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0139  adenylosuccinate synthetase  51.31 
 
 		 429 aa  434  1e-120  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000561019 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0518  adenylosuccinate synthetase  49.88 
 
 		 430 aa  434  1e-120  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.289891  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0389  Adenylosuccinate synthase  50.95 
 
 		 427 aa  432  1e-120  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.899335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0504  adenylosuccinate synthetase  50.82 
 
 		 431 aa  430  1e-119  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0517  adenylosuccinate synthetase  50.59 
 
 		 428 aa  430  1e-119  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2053  adenylosuccinate synthetase  48.69 
 
 		 447 aa  430  1e-119  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4740  adenylosuccinate synthetase  48.69 
 
 		 449 aa  431  1e-119  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.947935 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11510  Adenylosuccinate synthetase  50.12 
 
 		 434 aa  430  1e-119  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.616964  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0515  adenylosuccinate synthetase  50.82 
 
 		 431 aa  431  1e-119  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0662  adenylosuccinate synthetase  49.17 
 
 		 431 aa  429  1e-119  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.681047  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3524  adenylosuccinate synthetase  48.45 
 
 		 444 aa  431  1e-119  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0367  adenylosuccinate synthetase  50.59 
 
 		 428 aa  431  1e-119  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0526  adenylosuccinate synthetase  50.82 
 
 		 431 aa  431  1e-119  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0677  adenylosuccinate synthetase  50.35 
 
 		 431 aa  429  1e-119  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3410  adenylosuccinate synthetase  48.57 
 
 		 428 aa  425  1e-118  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1049  adenylosuccinate synthetase  48.33 
 
 		 435 aa  426  1e-118  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0228  adenylosuccinate synthetase  50.35 
 
 		 431 aa  427  1e-118  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.043517  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1839  adenylosuccinate synthetase  47.51 
 
 		 437 aa  427  1e-118  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0176  adenylosuccinate synthetase  51.67 
 
 		 427 aa  427  1e-118  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.386224  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2309  adenylosuccinate synthetase  49.88 
 
 		 427 aa  428  1e-118  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0139427  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05641  adenylosuccinate synthetase  47.51 
 
 		 437 aa  427  1e-118  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.622975 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3868  adenylosuccinate synthetase  47.14 
 
 		 442 aa  425  1e-118  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.838486  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2126  adenylosuccinate synthetase  50.59 
 
 		 428 aa  426  1e-118  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2209  adenylosuccinate synthase  50.47 
 
 		 430 aa  424  1e-117  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000023884  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0025  adenylosuccinate synthetase  47.63 
 
 		 426 aa  424  1e-117  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.993316  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1667  adenylosuccinate synthetase  47.04 
 
 		 439 aa  422  1e-117  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0507  adenylosuccinate synthetase  48.22 
 
 		 436 aa  422  1e-117  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05331  adenylosuccinate synthetase  48.8 
 
 		 436 aa  423  1e-117  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4007  adenylosuccinate synthetase  48.1 
 
 		 429 aa  424  1e-117  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000037837  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2909  Adenylosuccinate synthetase  46.57 
 
 		 429 aa  422  1e-117  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000270112  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4635  adenylosuccinate synthetase  51.9 
 
 		 427 aa  424  1e-117  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.595604  normal  0.413258 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1347  adenylosuccinate synthetase  50 
 
 		 428 aa  424  1e-117  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2180  adenylosuccinate synthetase  49.41 
 
 		 432 aa  424  1e-117  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000134883  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0941  adenylosuccinate synthetase  48.1 
 
 		 435 aa  424  1e-117  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0010  adenylosuccinate synthetase  48.34 
 
 		 427 aa  422  1e-117  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000465701  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1523  adenylosuccinate synthetase  50.71 
 
 		 442 aa  422  1e-117  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000140547  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0183  adenylosuccinate synthetase  48.47 
 
 		 451 aa  422  1e-117  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05631  adenylosuccinate synthetase  49.04 
 
 		 436 aa  424  1e-117  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0691  adenylosuccinate synthetase  46.89 
 
 		 439 aa  419  1e-116  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0176  adenylosuccinate synthetase  47.76 
 
 		 427 aa  420  1e-116  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2626  adenylosuccinate synthase  50.84 
 
 		 437 aa  419  1e-116  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000000737689 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05701  adenylosuccinate synthetase  48.46 
 
 		 436 aa  421  1e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0641  adenylosuccinate synthetase  50.36 
 
 		 431 aa  419  1e-116  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00143682 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3539  adenylosuccinate synthetase  47.86 
 
 		 428 aa  419  1e-116  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0565  adenylosuccinate synthetase  48.93 
 
 		 432 aa  420  1e-116  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.22549e-25 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2207  adenylosuccinate synthetase  49.05 
 
 		 430 aa  421  1e-116  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1271  adenylosuccinate synthetase  48.1 
 
 		 429 aa  421  1e-116  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.231459  normal  0.288086 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5638  adenylosuccinate synthase  48.57 
 
 		 430 aa  419  1e-116  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.171619  normal  0.25149 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1007  Adenylosuccinate synthase  49.88 
 
 		 431 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0196756 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002264  adenylosuccinate synthetase  48.71 
 
 		 438 aa  416  9.999999999999999e-116  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.151372  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0552  adenylosuccinate synthetase  48.69 
 
 		 432 aa  417  9.999999999999999e-116  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000130749  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2144  adenylosuccinate synthase  48.69 
 
 		 430 aa  416  9.999999999999999e-116  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2504  adenylosuccinate synthetase  48.22 
 
 		 431 aa  418  9.999999999999999e-116  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000458788 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23100  Adenylosuccinate synthase  50.71 
 
 		 428 aa  415  9.999999999999999e-116  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1282  adenylosuccinate synthetase  49.52 
 
 		 431 aa  416  9.999999999999999e-116  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.705282  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2029  adenylosuccinate synthetase  47.73 
 
 		 429 aa  416  9.999999999999999e-116  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00381049  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2958  adenylosuccinate synthetase  48.82 
 
 		 428 aa  416  9.999999999999999e-116  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3300  adenylosuccinate synthetase  45.97 
 
 		 428 aa  416  9.999999999999999e-116  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000123723  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0607  adenylosuccinate synthetase  48.57 
 
 		 432 aa  413  1e-114  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.272974 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2965  adenylosuccinate synthetase  47.86 
 
 		 430 aa  414  1e-114  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.125391  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3346  adenylosuccinate synthetase  48.58 
 
 		 432 aa  412  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.474516  hitchhiker  0.00582802 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0528  adenylosuccinate synthetase  49.28 
 
 		 429 aa  413  1e-114  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.650318  normal  0.308275 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5667  adenylosuccinate synthetase  48.69 
 
 		 430 aa  413  1e-114  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2661  adenylosuccinate synthetase  48.56 
 
 		 431 aa  412  1e-114  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4086  adenylosuccinate synthetase  47.86 
 
 		 430 aa  411  1e-114  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0852587 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1627  adenylosuccinate synthetase  48.94 
 
 		 533 aa  413  1e-114  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3234  adenylosuccinate synthase  48.95 
 
 		 437 aa  413  1e-114  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.000199193  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>