More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnec_0968 on replicon NC_010531
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010531  Pnec_0968  Adenine phosphoribosyltransferase  100 
 
 
172 aa  344  4e-94  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0881  adenine phosphoribosyltransferase  81.4 
 
 
172 aa  286  1e-76  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000402314  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1432  adenine phosphoribosyltransferase  45.33 
 
 
185 aa  144  4.0000000000000006e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.068464  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1842  adenine phosphoribosyltransferase  43.9 
 
 
175 aa  140  9.999999999999999e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.530485  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1065  adenine phosphoribosyltransferase  41.25 
 
 
173 aa  139  1.9999999999999998e-32  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2775  adenine phosphoribosyltransferase  43.23 
 
 
181 aa  138  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.781756  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3039  adenine phosphoribosyltransferase  43.23 
 
 
180 aa  138  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.350672  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3653  adenine phosphoribosyltransferase  45.18 
 
 
174 aa  137  4.999999999999999e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13598  Adenine phosphoribosyl transferase  43.9 
 
 
173 aa  135  2e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.910884  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1134  adenine phosphoribosyltransferase  42.77 
 
 
198 aa  133  9.999999999999999e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.397131  unclonable  0.0000000192445 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0788  adenine phosphoribosyltransferase  44 
 
 
177 aa  133  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.607381  normal  0.0139712 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0607  adenine phosphoribosyltransferase  43.95 
 
 
171 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.760951  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1399  adenine phosphoribosyltransferase  40 
 
 
170 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.953702  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1445  adenine phosphoribosyltransferase  40.61 
 
 
170 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.909366  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13991  adenine phosphoribosyltransferase  46.67 
 
 
193 aa  132  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.18608 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3060  adenine phosphoribosyltransferase  42.17 
 
 
187 aa  132  3e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1018  adenine phosphoribosyltransferase  42.86 
 
 
182 aa  132  3e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.14395  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3199  adenine phosphoribosyltransferase  42.17 
 
 
187 aa  132  3e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.954761  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2888  adenine phosphoribosyltransferase  42.17 
 
 
187 aa  131  3.9999999999999996e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.716655  normal  0.100922 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2270  adenine phosphoribosyltransferase  39.41 
 
 
180 aa  131  3.9999999999999996e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.739798  normal  0.613668 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0873  adenine phosphoribosyltransferase  40.62 
 
 
170 aa  131  5e-30  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.369684  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2091  adenine phosphoribosyltransferase  43.03 
 
 
176 aa  131  5e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1628  adenine phosphoribosyltransferase  44.44 
 
 
187 aa  130  9e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.50283  normal  0.279113 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01096  adenine phosphoribosyltransferase  44.44 
 
 
178 aa  130  1.0000000000000001e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0381093  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2246  adenine phosphoribosyltransferase  42.5 
 
 
175 aa  129  2.0000000000000002e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.111495  normal  0.31564 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0497  adenine phosphoribosyltransferase  40.96 
 
 
170 aa  129  2.0000000000000002e-29  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.742896  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3628  adenine phosphoribosyltransferase  42.33 
 
 
173 aa  129  2.0000000000000002e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000134172  normal  0.616678 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3608  adenine phosphoribosyltransferase  39.62 
 
 
182 aa  128  3e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.778085  normal  0.093345 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0732  adenine phosphoribosyltransferase  45.33 
 
 
172 aa  128  3e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000171863  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0741  adenine phosphoribosyltransferase  43.75 
 
 
172 aa  128  3e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000500572  hitchhiker  0.00412029 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2059  adenine phosphoribosyltransferase  41.25 
 
 
168 aa  128  4.0000000000000003e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.178681  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0108  adenine phosphoribosyltransferase  42.35 
 
 
182 aa  128  4.0000000000000003e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1952  adenine phosphoribosyltransferase  43.02 
 
 
171 aa  128  5.0000000000000004e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.233786  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2050  adenine phosphoribosyltransferase  41.88 
 
 
180 aa  127  6e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15120  adenine phosphoribosyltransferase  41.4 
 
 
175 aa  127  6e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.512789  normal  0.587198 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04860  adenine phosphoribosyltransferase  41.36 
 
 
177 aa  127  7.000000000000001e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.289931  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0949  adenine phosphoribosyltransferase  42.26 
 
 
183 aa  127  7.000000000000001e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.431291  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2323  adenine phosphoribosyltransferase  42.86 
 
 
172 aa  127  7.000000000000001e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12200  adenine phosphoribosyltransferase  43.12 
 
 
170 aa  127  8.000000000000001e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000836015  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1364  adenine phosphoribosyltransferase  44.65 
 
 
178 aa  127  9.000000000000001e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.647458  normal  0.747385 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2616  adenine phosphoribosyltransferase  39.49 
 
 
171 aa  127  9.000000000000001e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00797468  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1596  adenine phosphoribosyltransferase  41.4 
 
 
170 aa  127  9.000000000000001e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000374583  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1118  adenine phosphoribosyltransferase  44.52 
 
 
182 aa  126  1.0000000000000001e-28  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00971568  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2454  adenine phosphoribosyltransferase  41.04 
 
 
424 aa  127  1.0000000000000001e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0252819  hitchhiker  0.000000021435 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2163  adenine phosphoribosyltransferase  40.49 
 
 
181 aa  126  1.0000000000000001e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3040  adenine phosphoribosyltransferase  42.24 
 
 
182 aa  126  1.0000000000000001e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0558  adenine phosphoribosyltransferase  39.38 
 
 
173 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.176929  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0332  adenine phosphoribosyltransferase  42.77 
 
 
172 aa  127  1.0000000000000001e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00420  adenine phosphoribosyltransferase  42.26 
 
 
183 aa  126  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00707641  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3141  adenine phosphoribosyltransferase  42.26 
 
 
183 aa  126  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000274738  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3147  adenine phosphoribosyltransferase  42.26 
 
 
183 aa  126  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0333667  normal  0.241044 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0546  adenine phosphoribosyltransferase  42.26 
 
 
183 aa  126  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0506  adenine phosphoribosyltransferase  42.26 
 
 
183 aa  126  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00345089  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0401  adenine phosphoribosyltransferase  42.26 
 
 
183 aa  126  2.0000000000000002e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0547967  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1422  adenine phosphoribosyltransferase  42.76 
 
 
171 aa  126  2.0000000000000002e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000550543  normal  0.533063 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0401  adenine phosphoribosyltransferase  43.12 
 
 
171 aa  126  2.0000000000000002e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0512  adenine phosphoribosyltransferase  42.26 
 
 
183 aa  126  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00096873  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00425  hypothetical protein  42.26 
 
 
183 aa  126  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00912156  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0813  adenine phosphoribosyltransferase  43.33 
 
 
177 aa  125  3e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4379  adenine phosphoribosyltransferase  43.4 
 
 
172 aa  125  3e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.401827  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0575  adenine phosphoribosyltransferase  38.46 
 
 
181 aa  125  3e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.641386  hitchhiker  0.00758657 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0600  adenine phosphoribosyltransferase  37.87 
 
 
181 aa  125  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.102638  normal  0.0226618 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1075  adenine phosphoribosyltransferase  40.99 
 
 
185 aa  124  4.0000000000000003e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00248791  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0611  adenine phosphoribosyltransferase  37.87 
 
 
181 aa  125  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.112864 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1952  adenine phosphoribosyltransferase  41.82 
 
 
175 aa  125  4.0000000000000003e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000331539  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13570  adenine phosphoribosyltransferase  41.25 
 
 
177 aa  124  6e-28  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0841  adenine phosphoribosyltransferase  44.59 
 
 
184 aa  124  6e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.194957  normal  0.106292 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3236  adenine phosphoribosyltransferase  40.99 
 
 
185 aa  124  6e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0483226  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1084  adenine phosphoribosyltransferase  41.36 
 
 
181 aa  124  7e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.954514  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0559  adenine phosphoribosyltransferase  41.67 
 
 
183 aa  124  7e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.100039  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00395  adenine phosphoribosyltransferase  43.84 
 
 
186 aa  124  8.000000000000001e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3506  adenine phosphoribosyltransferase  38.01 
 
 
181 aa  124  8.000000000000001e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.660561  normal  0.0396544 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2278  adenine phosphoribosyltransferase  40.72 
 
 
181 aa  124  9e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2470  adenine phosphoribosyltransferase  40.99 
 
 
172 aa  123  1e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002884  adenine phosphoribosyltransferase  40.99 
 
 
181 aa  123  1e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0439897  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0587  adenine phosphoribosyltransferase  41.07 
 
 
183 aa  123  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.852789  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1342  adenine phosphoribosyltransferase  35.88 
 
 
184 aa  123  1e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0382674  normal  0.180866 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2327  adenine phosphoribosyltransferase  43.59 
 
 
183 aa  123  1e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000891458  hitchhiker  0.00045964 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4396  adenine phosphoribosyltransferase  40.37 
 
 
172 aa  122  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.622454  hitchhiker  0.0000849403 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0821  adenine phosphoribosyltransferase  43.83 
 
 
175 aa  122  2e-27  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0533  adenine phosphoribosyltransferase  41.07 
 
 
183 aa  122  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0543  adenine phosphoribosyltransferase  41.07 
 
 
183 aa  122  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5140  adenine phosphoribosyltransferase  45.27 
 
 
184 aa  123  2e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0016274 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0527  adenine phosphoribosyltransferase  41.07 
 
 
183 aa  122  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.11259  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0527  adenine phosphoribosyltransferase  41.07 
 
 
183 aa  122  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4333  adenine phosphoribosyltransferase  40.37 
 
 
172 aa  122  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2613  adenine phosphoribosyltransferase  39.75 
 
 
172 aa  122  3e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03088  adenine phosphoribosyltransferase  40.12 
 
 
181 aa  122  3e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0571  adenine phosphoribosyltransferase  40.74 
 
 
181 aa  122  3e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000300234  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2236  adenine phosphoribosyltransferase  41.94 
 
 
197 aa  122  3e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000133357  hitchhiker  0.000161546 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0781  adenine phosphoribosyltransferase  44.24 
 
 
172 aa  122  3e-27  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1834  adenine phosphoribosyltransferase  44.03 
 
 
172 aa  122  4e-27  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1345  adenine phosphoribosyltransferase  40.99 
 
 
171 aa  121  4e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000290871  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0544  adenine phosphoribosyltransferase  45.95 
 
 
172 aa  121  4e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2303  adenine phosphoribosyltransferase  44.23 
 
 
184 aa  121  4e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000264279  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2898  adenine phosphoribosyltransferase  40.12 
 
 
178 aa  121  4e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2255  adenine phosphoribosyltransferase  43.59 
 
 
183 aa  121  4e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000237286  normal  0.265408 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0743  adenine phosphoribosyltransferase  37.06 
 
 
175 aa  121  4e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0465531 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2447  adenine phosphoribosyltransferase  43.59 
 
 
183 aa  121  4e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000745159  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2012  adenine phosphoribosyltransferase  43.59 
 
 
181 aa  121  5e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>