129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_3790 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_3790  SmpA/OmlA domain-containing protein  100 
 
 		 204 aa  419  1e-116  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4609  SmpA/OmlA  72.73 
 
 		 170 aa  257  1e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0754  SmpA/OmlA  52 
 
 		 170 aa  177  7e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1069  SmpA/OmlA domain-containing protein  50.27 
 
 		 199 aa  177  1e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6008  SmpA/OmlA domain-containing protein  60.45 
 
 		 193 aa  173  9.999999999999999e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.792796 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0407  SmpA/OmlA domain protein  56.93 
 
 		 186 aa  171  7.999999999999999e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4554  SmpA/OmlA domain-containing protein  56.86 
 
 		 185 aa  169  2e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3271  SmpA/OmlA domain protein  49.71 
 
 		 183 aa  166  2.9999999999999998e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3923  SmpA/OmlA domain-containing protein  48.57 
 
 		 183 aa  163  2.0000000000000002e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0222  small protein A (tmRNA-binding)-like protein  43.81 
 
 		 183 aa  158  5e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0475  SmpA/OmlA domain-containing protein  39.31 
 
 		 182 aa  137  1e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2836  SmpA/OmlA  52.21 
 
 		 207 aa  130  1.0000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1654  SmpA/OmlA  48.84 
 
 		 185 aa  125  4.0000000000000003e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2975  SmpA/OmlA  52.38 
 
 		 258 aa  123  2e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.977187  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2575  SmpA/OmlA domain protein  50.93 
 
 		 218 aa  121  6e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2985  SmpA/OmlA domain protein  50.93 
 
 		 218 aa  120  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2746  putative lipoprotein transmembrane  49.11 
 
 		 219 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0230  SmpA/OmlA domain-containing protein  44.85 
 
 		 249 aa  119  1.9999999999999998e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0252  SmpA/OmlA domain protein  42.86 
 
 		 228 aa  117  9e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3384  SmpA/OmlA domain protein  47.73 
 
 		 276 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000148479 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0572  putative outer membrane lipoprotein  46.21 
 
 		 288 aa  115  6e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3456  outer membrane lipoprotein, putatitve  47.93 
 
 		 251 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1207  outer membrane lipoprotein, putatitve  53 
 
 		 267 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.87413  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0374  SmpA/OmlA family lipoprotein  42.11 
 
 		 242 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0167  SmpA/OmlA  51.49 
 
 		 268 aa  112  3e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0650  SmpA/OmlA domain-containing protein  51.49 
 
 		 268 aa  112  3e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0617  SmpA/OmlA domain-containing protein  51.49 
 
 		 268 aa  112  3e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.381857  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3736  outer membrane lipoprotein, SmpA/OmlA  51.49 
 
 		 272 aa  111  6e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.214192 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2457  outer membrane lipoprotein, putatitve  52 
 
 		 276 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0571  SmpA/OmlA domain-containing protein  50.5 
 
 		 265 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.253801 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0545  SmpA/OmlA domain-containing protein  50.5 
 
 		 265 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0731757  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1233  SmpA/OmlA family lipoprotein  52 
 
 		 279 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3419  SmpA/OmlA family lipoprotein  52 
 
 		 263 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.458143  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3454  SmpA/OmlA family lipoprotein  52 
 
 		 263 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.146935  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2644  SmpA/OmlA family lipoprotein  52 
 
 		 263 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2592  SmpA/OmlA domain-containing protein  50.5 
 
 		 297 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000116933 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2736  SmpA/OmlA domain-containing protein  49 
 
 		 273 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.724762 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1728  SmpA/OmlA domain protein  41.28 
 
 		 135 aa  98.6  5e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4509  outer membrane lipoprotein OmlA  40.54 
 
 		 173 aa  93.2  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.292937  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0935  SmpA/OmlA  38.93 
 
 		 160 aa  93.2  2e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.970773 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4199  SmpA/OmlA  39.64 
 
 		 173 aa  92.4  5e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0759  SmpA/OmlA  39.64 
 
 		 175 aa  90.1  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.321771 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0701  SmpA/OmlA domain-containing protein  30.99 
 
 		 178 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.410018  hitchhiker  0.0000863527 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0476  SmpA/OmlA  32.94 
 
 		 233 aa  88.6  6e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4597  SmpA/OmlA domain-containing protein  32.86 
 
 		 178 aa  87.4  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0944638 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4731  SmpA/OmlA domain protein  32.86 
 
 		 178 aa  87  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00865323 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2737  small protein A (tmRNA-binding)-like  37.17 
 
 		 131 aa  86.7  2e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000974363  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63030  outer membrane lipoprotein OmlA precursor  42.86 
 
 		 176 aa  86.7  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5485  outer membrane lipoprotein OmlA  42.86 
 
 		 187 aa  87  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1124  hypothetical protein  39.29 
 
 		 342 aa  86.3  3e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.167997  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0776  SmpA/OmlA  33.33 
 
 		 281 aa  86.3  3e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.880566  hitchhiker  0.000137115 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3628  SmpA/OmlA domain-containing protein  42.86 
 
 		 172 aa  86.3  3e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4732  SmpA/OmlA domain-containing protein  32.14 
 
 		 178 aa  86.3  3e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.592236  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2622  small protein A  37.7 
 
 		 161 aa  82.8  0.000000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.627483  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43020  outer membrane lipoprotein OmlA  35.86 
 
 		 171 aa  81.6  0.000000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1517  outer membrane protein  42.53 
 
 		 130 aa  79.7  0.00000000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.718257  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1460  SmpA/OmlA domain-containing protein  42.53 
 
 		 130 aa  79.7  0.00000000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.708366  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01180  outer membrane protein  45.98 
 
 		 131 aa  78.2  0.00000000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0407548  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1195  SmpA/OmlA  32.69 
 
 		 196 aa  73.9  0.000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3098  SmpA/OmlA  29.91 
 
 		 143 aa  71.2  0.000000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3826  SmpA/OmlA family protein  30.97 
 
 		 144 aa  70.9  0.00000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.336392  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1906  SmpA/OmlA domain-containing protein  38.37 
 
 		 117 aa  71.2  0.00000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1482  SmpA/OmlA domain-containing protein  40.85 
 
 		 111 aa  70.1  0.00000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.813844  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3968  SmpA/OmlA domain-containing protein  44 
 
 		 105 aa  70.1  0.00000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.542266 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1593  SmpA/OmlA domain protein  37.62 
 
 		 130 aa  69.7  0.00000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3366  SmpA/OmlA domain-containing protein  39.51 
 
 		 110 aa  69.3  0.00000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.0061494  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0966  outer membrane lipoprotein  34.65 
 
 		 117 aa  68.2  0.00000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1523  SmpA/OmlA domain-containing protein  30.43 
 
 		 167 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.512522  hitchhiker  0.00464967 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2051  SmpA/OmlA domain protein  39.05 
 
 		 120 aa  65.9  0.0000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1097  SmpA/OmlA domain-containing protein  31.9 
 
 		 167 aa  63.5  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1285  SmpA/OmlA domain-containing protein  30.91 
 
 		 164 aa  62  0.000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.522478  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2385  small protein A  29.32 
 
 		 163 aa  60.8  0.00000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.750326  normal  0.621044 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1310  SmpA/OmlA domain-containing protein  31.73 
 
 		 192 aa  61.2  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1301  SmpA/OmlA domain-containing protein  31.73 
 
 		 192 aa  61.2  0.00000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.84513  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3049  SmpA/OmlA domain protein  31.73 
 
 		 177 aa  60.8  0.00000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.331273  normal  0.468309 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1337  SmpA/OmlA domain-containing protein  31.73 
 
 		 192 aa  61.2  0.00000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1476  small protein A  30.3 
 
 		 163 aa  59.7  0.00000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0377  small protein A  34.09 
 
 		 136 aa  59.7  0.00000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.861991  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0279  lipoprotein, SmpA/OmlA family  32.95 
 
 		 115 aa  59.3  0.00000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0457  SmpA/OmlA domain protein  32.95 
 
 		 115 aa  59.3  0.00000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000469056 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0290  SmpA/OmlA  29.06 
 
 		 138 aa  58.9  0.00000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0676323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2773  SmpA/OmlA domain-containing protein  30.77 
 
 		 174 aa  58.9  0.00000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.664934  normal  0.104565 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2851  SmpA/OmlA domain-containing protein  30.77 
 
 		 174 aa  58.9  0.00000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0986  SmpA/OmlA domain protein  33.63 
 
 		 190 aa  58.5  0.00000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1713  SmpA/OmlA  31.53 
 
 		 118 aa  58.5  0.00000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2949  SmpA/OmlA domain-containing protein  30.77 
 
 		 174 aa  58.9  0.00000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1232  SmpA/OmlA domain-containing protein  35.06 
 
 		 174 aa  58.5  0.00000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1605  Outer membrane lipoprotein OmlA  38.36 
 
 		 148 aa  57.4  0.0000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.730668  normal  0.548797 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1271  SmpA/OmlA domain-containing protein  36.47 
 
 		 182 aa  57.4  0.0000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.175523  normal  0.212441 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1410  SmpA/OmlA domain-containing protein  31.68 
 
 		 171 aa  57.8  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0264  outer membrane lipoprotein OmlA  29.81 
 
 		 138 aa  57  0.0000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.28381  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1406  SmpA/OmlA  37.14 
 
 		 117 aa  57  0.0000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0227  small protein A  39.71 
 
 		 128 aa  57  0.0000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0437  hypothetical protein  43.75 
 
 		 104 aa  55.1  0.0000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0413  hypothetical protein  43.75 
 
 		 104 aa  55.1  0.0000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1886  SmpA/OmlA domain-containing protein  31.82 
 
 		 124 aa  54.3  0.000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1058  SmpA/OmlA domain protein  37.31 
 
 		 113 aa  53.1  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.276511  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2901  hypothetical protein  37.31 
 
 		 113 aa  53.1  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.301484  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3857  hypothetical protein  37.31 
 
 		 113 aa  53.1  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00570631  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1067  hypothetical protein  37.31 
 
 		 113 aa  53.1  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.261293  normal  0.540177 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>