27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_3735 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_3735  hypothetical protein  100 
 
 		 412 aa  845    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.756384  normal  0.0338258 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3133  hypothetical protein  55.86 
 
 		 314 aa  358  7e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1498  hypothetical protein  48.47 
 
 		 391 aa  271  1e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2968  hypothetical protein  46.8 
 
 		 395 aa  271  2e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2532  TM1410 hypothetical-related protein  29.46 
 
 		 262 aa  69.7  0.00000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0653448  normal  0.537266 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2446  TM1410 hypothetical-related protein  27.8 
 
 		 369 aa  65.9  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22100  hypothetical protein  34 
 
 		 258 aa  62  0.00000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00255841 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2053  TM1410 hypothetical-related protein  27.2 
 
 		 368 aa  61.2  0.00000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.514202  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1609  hypothetical protein  37.17 
 
 		 273 aa  59.3  0.0000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0672  hypothetical protein  28.49 
 
 		 322 aa  58.2  0.0000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.11675  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1621  putative signal peptide protein  25.86 
 
 		 286 aa  55.8  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.174255  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2241  hypothetical protein  25.75 
 
 		 299 aa  52.4  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.22813  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3466  SH3 type 3 domain-containing protein  38.38 
 
 		 1281 aa  50.8  0.00004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.180669  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1608  hypothetical protein  36.78 
 
 		 1279 aa  48.9  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1420  cysteinyl-tRNA synthetase  23.5 
 
 		 323 aa  48.9  0.0002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0810  laminin G  38.64 
 
 		 433 aa  47  0.0006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.478954  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1598  hypothetical protein  51.85 
 
 		 675 aa  45.8  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000695683  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1612  Pectate lyase/Amb allergen  57.5 
 
 		 1409 aa  46.2  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2288  serine/threonine protein kinase  50.88 
 
 		 771 aa  45.8  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000513908 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0528  hypothetical protein  61.54 
 
 		 431 aa  45.8  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.617097  normal  0.16882 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0830  redoxin domain-containing protein  59.52 
 
 		 329 aa  44.7  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4236  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  30.08 
 
 		 570 aa  44.7  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.00000155192  unclonable  0.0000114399 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6484  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.32 
 
 		 1257 aa  44.3  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0296  glycoside hydrolase family protein  44.44 
 
 		 846 aa  43.9  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2810  serine/threonine kinase protein  66.67 
 
 		 1034 aa  43.9  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.855533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4805  glycoside hydrolase family protein  61.54 
 
 		 628 aa  43.5  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1281  hypothetical protein  57.5 
 
 		 430 aa  43.1  0.01  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.197658 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>