66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_2678 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_2678  hypothetical protein  100 
 
 		 321 aa  617  1e-176  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1897  hypothetical protein  78.95 
 
 		 310 aa  431  1e-120  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.325254 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3016  putative transmembrane protein  65.15 
 
 		 303 aa  353  2.9999999999999997e-96  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1460  hypothetical protein  34.38 
 
 		 319 aa  145  1e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.424115 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5306  hypothetical protein  36.39 
 
 		 327 aa  143  5e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.146478 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1271  hypothetical protein  36.53 
 
 		 327 aa  142  9.999999999999999e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2016  hypothetical protein  35.16 
 
 		 321 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.558153  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1315  hypothetical protein  39.3 
 
 		 324 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.158959  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6081  hypothetical protein  35.16 
 
 		 321 aa  139  7e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1996  hypothetical protein  35.16 
 
 		 321 aa  139  7e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.269533  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0727  hypothetical protein  34.25 
 
 		 325 aa  138  1e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.563319  normal  0.0319705 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4210  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.59 
 
 		 329 aa  138  1e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.633325  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0510  hypothetical protein  35.24 
 
 		 322 aa  137  2e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00686238 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1898  hypothetical protein  35.56 
 
 		 324 aa  138  2e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1300  hypothetical protein  36.19 
 
 		 322 aa  135  8e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3283  hypothetical protein  36.19 
 
 		 322 aa  135  8e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.793801  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2556  integral membrane protein  35.87 
 
 		 322 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2463  integral membrane protein  35.87 
 
 		 322 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.126131  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1529  hypothetical protein  35.87 
 
 		 322 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.326947  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2409  integral membrane protein  35.87 
 
 		 322 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.246175  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2029  hypothetical protein  35.87 
 
 		 322 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.827093  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1748  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.85 
 
 		 316 aa  133  3.9999999999999996e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0355136 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2029  hypothetical protein  34.63 
 
 		 323 aa  133  5e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0982031  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2052  hypothetical protein  35.51 
 
 		 322 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0439765  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0082  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.26 
 
 		 326 aa  132  6.999999999999999e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0090  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.38 
 
 		 326 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1280  hypothetical protein  34.58 
 
 		 327 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.162856  normal  0.301034 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1857  transmembrane protein  33.65 
 
 		 319 aa  130  3e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0233  putative integral membrane transmembrane protein  34.25 
 
 		 326 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1790  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.7 
 
 		 325 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2508  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.75 
 
 		 320 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3880  hypothetical protein  35.44 
 
 		 313 aa  126  6e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3644  hypothetical protein  33.97 
 
 		 347 aa  124  2e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.379203  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1369  hypothetical protein  33.65 
 
 		 314 aa  124  2e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4798  inner membrane protein YtfF  30.35 
 
 		 321 aa  123  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4678  inner membrane protein YtfF  30.03 
 
 		 321 aa  123  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.121802  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4668  inner membrane protein YtfF  30.03 
 
 		 321 aa  123  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4818  hypothetical protein  30.03 
 
 		 321 aa  122  7e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.451451  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4763  inner membrane protein YtfF  30.03 
 
 		 321 aa  121  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1305  putative transmembrane protein  33.23 
 
 		 314 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.508017  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0952  hypothetical protein  35.09 
 
 		 328 aa  119  4.9999999999999996e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.330098  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2432  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.05 
 
 		 325 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.532838  normal  0.11306 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1392  hypothetical protein  33.65 
 
 		 323 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1705  DMT family permease  33.87 
 
 		 325 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4751  hypothetical protein  30.67 
 
 		 321 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.289249  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04045  hypothetical protein  31.11 
 
 		 324 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0254567  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04082  predicted inner membrane protein  31.11 
 
 		 324 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0217591  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4464  hypothetical protein  31.11 
 
 		 321 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0577375  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4779  hypothetical protein  31.11 
 
 		 321 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00613349  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4689  hypothetical protein  31.11 
 
 		 321 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.16874  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5727  hypothetical protein  30.35 
 
 		 321 aa  114  3e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.229908  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3796  hypothetical protein  31.11 
 
 		 321 aa  114  3e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0293258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2538  hypothetical protein  30.79 
 
 		 321 aa  113  4.0000000000000004e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.975656  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3783  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.35 
 
 		 321 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.242799  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1428  hypothetical protein  32.91 
 
 		 313 aa  109  5e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0113552  hitchhiker  0.00361312 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0381  hypothetical protein  30.99 
 
 		 321 aa  109  8.000000000000001e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.822543  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1288  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.52 
 
 		 327 aa  101  2e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0911  hypothetical protein  28.08 
 
 		 314 aa  96.7  5e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.565858  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3714  putative transmembrane protein  28.77 
 
 		 322 aa  85.5  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.543491  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1941  hypothetical protein  25 
 
 		 315 aa  82  0.00000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.205515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5570  putative transmembrane protein  27.05 
 
 		 317 aa  75.5  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0431678 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04617  integral membrane protein  37.11 
 
 		 400 aa  72.4  0.000000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.938571  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3565  hypothetical protein  24.76 
 
 		 324 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.28529  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0303  hypothetical protein  22.74 
 
 		 341 aa  65.1  0.000000002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.277394  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2038  hypothetical protein  27.78 
 
 		 301 aa  44.3  0.003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.174012  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1702  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.1 
 
 		 302 aa  43.5  0.005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.352845  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>