79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_2673 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_2673  phosphopantetheine-binding  100 
 
 		 102 aa  199  7e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.37551  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0954  phosphopantetheine-binding  37.5 
 
 		 78 aa  58.9  0.00000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.311548  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1320  acyl carrier protein  40.68 
 
 		 94 aa  51.2  0.000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0459  acyl carrier protein  33.78 
 
 		 78 aa  49.7  0.00001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.997029  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0464  acyl carrier protein  33.78 
 
 		 78 aa  49.7  0.00001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0572  acyl carrier protein  33.78 
 
 		 78 aa  49.7  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.000726263  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1291  acyl carrier protein  35.62 
 
 		 77 aa  48.5  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1316  acyl carrier protein  35.62 
 
 		 77 aa  48.5  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1157  acyl carrier protein  31.51 
 
 		 78 aa  48.1  0.00004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000000567099  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1847  phosphopantetheine-binding  29.87 
 
 		 80 aa  47.4  0.00006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0798  acyl carrier protein  34.25 
 
 		 77 aa  47.8  0.00006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1220  phosphopantetheine-binding  38.16 
 
 		 85 aa  47.4  0.00007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.493344  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1096  acyl carrier protein  32.1 
 
 		 83 aa  47  0.00008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.000000000417281  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0034  phosphopantetheine-binding  38.18 
 
 		 100 aa  47  0.00008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3353  acyl carrier protein  32.97 
 
 		 93 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.53669  normal  0.0790473 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2090  acyl carrier protein  32.97 
 
 		 93 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2029  acyl carrier protein  37.29 
 
 		 92 aa  45.8  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2111  acyl carrier protein  40.68 
 
 		 93 aa  45.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.144779  normal  0.165327 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1641  acyl carrier protein  35.21 
 
 		 82 aa  45.8  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1246  acyl carrier protein  31.52 
 
 		 93 aa  45.8  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.15129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1339  acyl carrier protein  31.08 
 
 		 78 aa  45.4  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.52176  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1367  amino acid adenylation domain protein  38 
 
 		 6403 aa  45.1  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2233  acyl carrier protein  31.87 
 
 		 93 aa  44.7  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2071  acyl carrier protein  34.78 
 
 		 74 aa  44.7  0.0004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000431599  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0498  acyl carrier protein  31.08 
 
 		 78 aa  44.7  0.0004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4854  acyl carrier protein  32.58 
 
 		 95 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.62131  normal  0.144839 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2117  acyl carrier protein  37.29 
 
 		 92 aa  44.7  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.307838  hitchhiker  0.00250783 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1530  acyl carrier protein  31.08 
 
 		 78 aa  45.1  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.129893  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1617  acyl carrier protein  30.23 
 
 		 89 aa  44.7  0.0005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.250547 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0510  acyl carrier protein  33.33 
 
 		 77 aa  44.7  0.0005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2371  acyl carrier protein  36.21 
 
 		 93 aa  44.3  0.0005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.131392  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0933  acyl carrier protein  31.88 
 
 		 74 aa  44.7  0.0005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000201436  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1515  phosphopantetheine-binding  37.18 
 
 		 81 aa  44.3  0.0006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.159664  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0847  acyl carrier protein  36.21 
 
 		 93 aa  44.3  0.0006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0855  acyl carrier protein  36.21 
 
 		 93 aa  44.3  0.0006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5061  acyl carrier protein  42.11 
 
 		 98 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4548  acyl carrier protein  42.11 
 
 		 98 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00748175 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5008  acyl carrier protein  42.11 
 
 		 98 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.312305  normal  0.300589 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1506  acyl carrier protein  38.98 
 
 		 93 aa  44.3  0.0006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.41568  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1741  acyl carrier protein  35.59 
 
 		 95 aa  43.9  0.0007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.463216  normal  0.237762 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1767  acyl carrier protein  29.49 
 
 		 78 aa  43.9  0.0007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0300385  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0752  acyl carrier protein  32.88 
 
 		 79 aa  43.9  0.0007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0103187  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1416  acyl carrier protein  38.33 
 
 		 76 aa  43.5  0.0009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.28944  normal  0.571191 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1868  acyl carrier protein  39.66 
 
 		 95 aa  43.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0944  acyl carrier protein  31.58 
 
 		 79 aa  42.4  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000174331  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2565  acyl carrier protein  29.17 
 
 		 78 aa  42.7  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2359  acyl carrier protein  34.29 
 
 		 105 aa  42.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.701799  normal  0.0109662 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1173  phosphopantetheine-binding  29.17 
 
 		 79 aa  42.7  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3522  acyl carrier protein  37.29 
 
 		 93 aa  42.4  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3760  hypothetical protein  37.29 
 
 		 97 aa  42  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0280787 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6195  NodF acyl carrier protein  35.48 
 
 		 93 aa  42  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_29828  predicted protein  39.06 
 
 		 4962 aa  42  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1990  phosphopantetheine-binding  34.67 
 
 		 72 aa  42  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.596379  normal  0.457201 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0616  acyl carrier protein  35.82 
 
 		 74 aa  42  0.003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000175358  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4914  phosphopantetheine-binding  37.29 
 
 		 92 aa  41.6  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0397  phosphopantetheine-binding  33.33 
 
 		 91 aa  42  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.823663  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2147  phosphopantetheine-binding  38.89 
 
 		 92 aa  41.2  0.004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.108837  normal  0.507258 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09300  acyl carrier protein  33.8 
 
 		 81 aa  41.6  0.004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.421361  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1361  acyl carrier protein  32.39 
 
 		 76 aa  41.2  0.005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000207547  normal  0.0506091 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4169  phosphopantetheine-binding  32.86 
 
 		 79 aa  41.2  0.005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0061  phosphopantetheine-binding protein  37.68 
 
 		 82 aa  41.2  0.005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0746  acyl carrier protein  29.73 
 
 		 78 aa  41.2  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.746533  normal  0.50277 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18011  acyl carrier protein  27.14 
 
 		 79 aa  41.2  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1201  acyl carrier protein  29.73 
 
 		 78 aa  41.2  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.576937  hitchhiker  0.00368899 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1701  acyl carrier protein  27.14 
 
 		 79 aa  41.2  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0425  hypothetical protein  31.88 
 
 		 92 aa  41.2  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18181  acyl carrier protein  27.14 
 
 		 79 aa  41.2  0.005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.180905  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1058  acyl carrier protein  29.73 
 
 		 78 aa  41.2  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0713713 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1052  acyl carrier protein  30.14 
 
 		 77 aa  41.2  0.005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.784582  normal  0.0871909 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5019  acyl carrier protein  38.6 
 
 		 102 aa  41.2  0.005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.256894  normal  0.657506 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1263  acyl carrier protein  37.93 
 
 		 93 aa  40.8  0.006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.321822 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23640  phosphopantetheine-containing protein  35.21 
 
 		 72 aa  40.4  0.007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.309349 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04530  phosphopantetheine-containing protein  33.8 
 
 		 73 aa  40.8  0.007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.832197  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0949  acyl carrier protein  30.88 
 
 		 79 aa  40.4  0.008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000253013  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0685  acyl carrier protein  29.17 
 
 		 75 aa  40.4  0.009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00698969  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2083  acyl carrier protein  36.76 
 
 		 76 aa  40.4  0.009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000417197  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1345  acyl carrier protein  30.99 
 
 		 79 aa  40.4  0.009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.095592  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1722  acyl carrier protein  30.56 
 
 		 75 aa  40.4  0.009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000662355  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1037  phosphopantetheine-binding  38 
 
 		 88 aa  40  0.01  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>