43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_0935 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008781  Pnap_0935  hypothetical protein  100 
 
 
98 aa  196  1.0000000000000001e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2741  hypothetical protein  51.56 
 
 
78 aa  67  0.00000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.389873  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2159  hypothetical protein  42.86 
 
 
85 aa  62.4  0.000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.518894  normal  0.0709956 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0430  hypothetical protein  41.86 
 
 
121 aa  60.5  0.000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2438  hypothetical protein  42.22 
 
 
94 aa  57.8  0.00000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.386115  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2065  hypothetical protein  43.18 
 
 
87 aa  57.8  0.00000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.66458  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1408  hypothetical protein  47.44 
 
 
114 aa  55.8  0.0000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1384  hypothetical protein  42.86 
 
 
106 aa  55.5  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.958099  normal  0.904414 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0602  membrane protein-like protein  40 
 
 
82 aa  52.8  0.000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000788004  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2278  hypothetical protein  42.86 
 
 
122 aa  52  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.529766  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1280  hypothetical protein  40.48 
 
 
121 aa  52  0.000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.381602  normal  0.240196 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0168  hypothetical protein  40 
 
 
87 aa  51.2  0.000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0274  hypothetical protein  43.75 
 
 
87 aa  49.7  0.00001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.744422  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0211  hypothetical protein  45.9 
 
 
79 aa  48.5  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.334507  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0616  membrane protein-like protein  37.66 
 
 
85 aa  48.1  0.00004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000019753  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2561  hypothetical protein  38.36 
 
 
109 aa  47  0.00008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0036  hypothetical protein  56.82 
 
 
86 aa  47  0.00009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_823  hypothetical protein  51.35 
 
 
84 aa  46.6  0.0001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0952  hypothetical protein  34.94 
 
 
80 aa  46.6  0.0001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3636  hypothetical protein  38.1 
 
 
94 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1115  hypothetical protein  43.08 
 
 
81 aa  45.8  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00160  predicted membrane protein  41.38 
 
 
85 aa  45.4  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000356401  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0297  hypothetical protein  56.41 
 
 
77 aa  44.3  0.0005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1804  hypothetical protein  63.33 
 
 
96 aa  43.9  0.0007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1380  hypothetical protein  35.38 
 
 
76 aa  43.9  0.0007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.480252  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1579  hypothetical protein  30.95 
 
 
74 aa  42.7  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2969  hypothetical protein  44.62 
 
 
89 aa  42.4  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0137  Protein of unknown function DUF2078, membrane  68.97 
 
 
78 aa  42.7  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1949  hypothetical protein  38.71 
 
 
74 aa  42.7  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2871  hypothetical protein  34.25 
 
 
88 aa  42.4  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2725  hypothetical protein  40.32 
 
 
127 aa  41.2  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.057147  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0836  hypothetical protein  43.9 
 
 
84 aa  41.2  0.005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5393  hypothetical protein  34.92 
 
 
87 aa  41.2  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5413  hypothetical protein  34.92 
 
 
87 aa  41.2  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0710032 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0507  hypothetical protein  34.92 
 
 
87 aa  41.2  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0426979  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2112  hypothetical protein  50 
 
 
74 aa  40.8  0.006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1577  hypothetical protein  50 
 
 
74 aa  40.8  0.006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3542  hypothetical protein  42.86 
 
 
137 aa  40.8  0.006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1463  hypothetical protein  28.95 
 
 
89 aa  40.4  0.008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1486  hypothetical protein  28.95 
 
 
89 aa  40.4  0.008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0475203  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3781  hypothetical protein  36.71 
 
 
96 aa  40.4  0.008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2926  hypothetical protein  32.53 
 
 
99 aa  40.4  0.008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0713  hypothetical protein  35.37 
 
 
76 aa  40.4  0.009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000015115  normal  0.0462479 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>