33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_0831 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008781  Pnap_0831  hypothetical protein  100 
 
 
237 aa  474  1e-133  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0933  hypothetical protein  55.19 
 
 
238 aa  224  1e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3265  hypothetical protein  41.43 
 
 
227 aa  144  9e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2795  hypothetical protein  40.16 
 
 
227 aa  129  3e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3468  hypothetical protein  39.34 
 
 
227 aa  128  9.000000000000001e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0852278  normal  0.35486 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3731  proline rich protein  47.71 
 
 
209 aa  124  1e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.655053 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0678  proline rich protein  47.3 
 
 
185 aa  118  7e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2590  proline rich protein  46.31 
 
 
186 aa  116  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.13102 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1165  proline rich protein  49.3 
 
 
230 aa  110  3e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0221177  normal  0.558987 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2765  proline rich protein  42.86 
 
 
202 aa  108  5e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2186  proline rich protein  43.62 
 
 
186 aa  105  5e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.242882  normal  0.201232 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1401  hypothetical protein  43.06 
 
 
184 aa  99.4  4e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2377  proline rich protein  51.49 
 
 
189 aa  96.3  4e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00333429 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3713  hypothetical protein  36.97 
 
 
209 aa  80.5  0.00000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.619192  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0563  hypothetical protein  73.53 
 
 
50 aa  62.4  0.000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0341  hypothetical protein  31.25 
 
 
218 aa  57.4  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.299338  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1282  hypothetical protein  28.47 
 
 
221 aa  55.5  0.0000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.467166  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0454  hypothetical protein  31.33 
 
 
243 aa  52.4  0.000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0055  hypothetical protein  27.67 
 
 
196 aa  52  0.000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3912  hypothetical protein  26.83 
 
 
222 aa  51.6  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0237  hypothetical protein  31.79 
 
 
222 aa  51.6  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00190081 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4102  hypothetical protein  31.79 
 
 
222 aa  51.6  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.111108  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4505  hypothetical protein  29.55 
 
 
218 aa  50.1  0.00003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1449  hypothetical protein  29.09 
 
 
335 aa  50.1  0.00003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4220  hypothetical protein  31.47 
 
 
222 aa  49.7  0.00004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.405924  normal  0.13608 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3787  hypothetical protein  25.79 
 
 
218 aa  49.3  0.00005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.803135 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4132  hypothetical protein  31.13 
 
 
222 aa  48.5  0.00008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.382734  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3617  hypothetical protein  30.15 
 
 
214 aa  47  0.0003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3716  hypothetical protein  24.68 
 
 
218 aa  46.6  0.0004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.801315 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4817  hypothetical protein  26.76 
 
 
197 aa  46.2  0.0005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3084  hypothetical protein  29.41 
 
 
233 aa  44.7  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0138701 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0501  hypothetical protein  30.58 
 
 
203 aa  44.3  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5494  hypothetical protein  31.54 
 
 
242 aa  44.3  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.327919  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>