More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_0686 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_0686  hypothetical protein  100 
 
 		 260 aa  511  1e-144  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2936  hypothetical protein  88.8 
 
 		 260 aa  441  1e-123  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1155  protein of unknown function DUF140  80.31 
 
 		 260 aa  422  1e-117  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0794  hypothetical protein  77.19 
 
 		 264 aa  399  9.999999999999999e-111  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.213597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1014  hypothetical protein  75.68 
 
 		 260 aa  397  9.999999999999999e-111  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3100  hypothetical protein  74.13 
 
 		 260 aa  394  1e-109  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.496882 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0749  hypothetical protein  72.2 
 
 		 260 aa  379  1e-104  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0717  protein of unknown function DUF140  72.2 
 
 		 260 aa  379  1e-104  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5535  hypothetical protein  71.81 
 
 		 260 aa  367  1e-100  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3393  hypothetical protein  71.43 
 
 		 259 aa  360  1e-98  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2769  hypothetical protein  69.96 
 
 		 255 aa  360  1e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.686184  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0318  hypothetical protein  72.02 
 
 		 255 aa  354  6.999999999999999e-97  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.256439  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0342  hypothetical protein  71.6 
 
 		 255 aa  352  2e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.610119 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2692  hypothetical protein  71.6 
 
 		 255 aa  353  2e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.327255  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0333  hypothetical protein  71.6 
 
 		 255 aa  352  2e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0415  hypothetical protein  71.6 
 
 		 255 aa  353  2e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.177362  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3513  ABC transporter, inner membrane subunit  71.6 
 
 		 255 aa  352  2.9999999999999997e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.525641  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0394  hypothetical protein  71.6 
 
 		 255 aa  352  2.9999999999999997e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.138543  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2398  hypothetical protein  73.36 
 
 		 260 aa  351  5e-96  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3258  hypothetical protein  68.65 
 
 		 258 aa  349  2e-95  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3121  hypothetical protein  67.59 
 
 		 258 aa  344  7e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.605648  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0097  hypothetical protein  66.8 
 
 		 265 aa  343  2e-93  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.180124  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0096  protein of unknown function DUF140  64.82 
 
 		 262 aa  339  2.9999999999999998e-92  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  decreased coverage  0.0000150492  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2961  hypothetical protein  65.22 
 
 		 255 aa  335  5e-91  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.597784  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2725  ABC transporter, permease protein  71.19 
 
 		 255 aa  332  4e-90  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1778  ABC transporter, permease protein  71.19 
 
 		 255 aa  332  4e-90  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3703  ABC transporter, permease protein  71.19 
 
 		 255 aa  332  4e-90  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3734  toluene tolerance ABC transporter, permease protein  71.19 
 
 		 255 aa  332  4e-90  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3676  toluene tolerance ABC transporter, permease protein  71.19 
 
 		 255 aa  332  4e-90  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0296584  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3003  ABC transporter, permease protein  71.19 
 
 		 255 aa  332  4e-90  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2775  ABC transporter, permease protein  71.19 
 
 		 255 aa  332  4e-90  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3229  ABC transporter, permease protein  71.19 
 
 		 255 aa  332  4e-90  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.387894  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2892  protein of unknown function DUF140  66.67 
 
 		 255 aa  325  5e-88  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.581984  normal  0.391901 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3239  protein of unknown function DUF140  66.67 
 
 		 255 aa  325  6e-88  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.205423  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0388  ABC transporter inner membrane protein  75 
 
 		 255 aa  321  6e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3570  protein of unknown function DUF140  74.55 
 
 		 255 aa  320  9.999999999999999e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.392913  hitchhiker  0.0000192838 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1899  hypothetical protein  63.75 
 
 		 262 aa  308  8e-83  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2748  hypothetical protein  61.25 
 
 		 265 aa  296  2e-79  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3401  hypothetical protein  59.6 
 
 		 263 aa  295  4e-79  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0238  hypothetical protein  60.66 
 
 		 263 aa  291  6e-78  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.871926 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0385  protein of unknown function DUF140  59.92 
 
 		 260 aa  284  8e-76  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.231981 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0889  protein of unknown function DUF140  56.67 
 
 		 262 aa  281  6.000000000000001e-75  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.106766  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2119  hypothetical protein  59.6 
 
 		 258 aa  276  3e-73  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2785  hypothetical protein  63.93 
 
 		 260 aa  272  3e-72  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00892683  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2101  hypothetical protein  60.45 
 
 		 258 aa  269  2.9999999999999997e-71  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1968  hypothetical protein  57.44 
 
 		 263 aa  269  4e-71  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.901024  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0506  toluene tolerance protein Ttg2B  60.45 
 
 		 264 aa  269  4e-71  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.156357  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0738  protein of unknown function DUF140  59.5 
 
 		 260 aa  268  5.9999999999999995e-71  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0560  hypothetical protein  54.9 
 
 		 259 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03657  hypothetical protein  54.37 
 
 		 263 aa  265  4e-70  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002410  uncharacterized ABC transporter permease component YrbE  54.37 
 
 		 263 aa  264  1e-69  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3369  hypothetical protein  60.19 
 
 		 261 aa  264  1e-69  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.512056  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0282  hypothetical protein  60.45 
 
 		 260 aa  263  3e-69  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0289  protein of unknown function DUF140  60.91 
 
 		 260 aa  263  3e-69  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.16381  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3080  hypothetical protein  59.55 
 
 		 260 aa  262  4e-69  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.200966 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03185  putative transport protein (ABC superfamily, membrane)  58.64 
 
 		 258 aa  261  6e-69  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4535  hypothetical protein  53.17 
 
 		 258 aa  260  2e-68  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2222  hypothetical protein  54.98 
 
 		 259 aa  259  2e-68  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.12831  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12860  organic solvent tolerance ABC efflux transporter, permease component  59.15 
 
 		 265 aa  260  2e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4232  hypothetical protein  53.31 
 
 		 260 aa  259  3e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.212693  hitchhiker  0.000290444 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3661  hypothetical protein  59.01 
 
 		 261 aa  259  3e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0857577  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0734  hypothetical protein  58.56 
 
 		 260 aa  259  3e-68  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.336602 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0723  hypothetical protein  59.01 
 
 		 261 aa  259  3e-68  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.164477 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3807  protein of unknown function DUF140  59.01 
 
 		 260 aa  259  3e-68  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0042632  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0693  hypothetical protein  59.01 
 
 		 261 aa  259  3e-68  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0714  protein of unknown function DUF140  59.01 
 
 		 261 aa  259  3e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00504036 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0722  hypothetical protein  59.55 
 
 		 261 aa  259  4e-68  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3953  hypothetical protein  59.01 
 
 		 261 aa  258  6e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1172  ABC transporter permease  59.09 
 
 		 261 aa  258  6e-68  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0497  hypothetical protein  58.8 
 
 		 265 aa  258  9e-68  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000163083  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4359  hypothetical protein  59.09 
 
 		 260 aa  258  9e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.775319  normal  0.0567326 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3303  hypothetical protein  58.26 
 
 		 261 aa  257  1e-67  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.236895 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0877  hypothetical protein  58.95 
 
 		 265 aa  257  1e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.544199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0449  putative ABC transporter, permease protein YrbE  59.28 
 
 		 260 aa  256  2e-67  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.487258  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0513  hypothetical protein  59.28 
 
 		 260 aa  256  2e-67  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1145  hypothetical protein  59.28 
 
 		 260 aa  256  2e-67  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5027  ABC transporter permease  60.65 
 
 		 265 aa  256  2e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4256  hypothetical protein  55.37 
 
 		 265 aa  256  2e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57870  ABC transporter permease  60.65 
 
 		 265 aa  256  2e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3608  hypothetical protein  58.8 
 
 		 261 aa  256  3e-67  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2708  hypothetical protein  55.37 
 
 		 260 aa  256  3e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0680  hypothetical protein  58.56 
 
 		 261 aa  256  3e-67  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.75671 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3342  hypothetical protein  58.56 
 
 		 261 aa  256  3e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.279252 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0679  hypothetical protein  58.56 
 
 		 261 aa  256  3e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.876279  normal  0.100522 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0760  protein of unknown function DUF140  57.69 
 
 		 266 aa  256  4e-67  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0966  hypothetical protein  54.96 
 
 		 265 aa  255  5e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0959  hypothetical protein  54.96 
 
 		 266 aa  254  7e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0998  hypothetical protein  54.96 
 
 		 265 aa  254  8e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3649  protein of unknown function DUF140  58.56 
 
 		 260 aa  254  9e-67  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0904  hypothetical protein  58.14 
 
 		 260 aa  253  2.0000000000000002e-66  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0873  hypothetical protein  58.14 
 
 		 260 aa  253  2.0000000000000002e-66  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3630  hypothetical protein  57.73 
 
 		 260 aa  253  3e-66  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.485791  normal  0.147017 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2219  hypothetical protein  58.88 
 
 		 260 aa  252  4.0000000000000004e-66  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4140  hypothetical protein  58.48 
 
 		 265 aa  251  6e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4446  hypothetical protein  56.7 
 
 		 265 aa  249  4e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0980  hypothetical protein  51.59 
 
 		 261 aa  248  6e-65  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0864  hypothetical protein  59.15 
 
 		 265 aa  248  8e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3573  toluene ABC transporter permease protein  57.47 
 
 		 260 aa  248  9e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3504  toluene ABC transporter permease  57.47 
 
 		 260 aa  248  9e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.266874  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3502  toluene ABC transporter, permease protein  57.47 
 
 		 260 aa  248  9e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0158208  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>