More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_1453 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010003  Pmob_1453  ribose-phosphate pyrophosphokinase  100 
 
 
316 aa  644    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1163  ribose-phosphate pyrophosphokinase  66.88 
 
 
315 aa  448  1e-125  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.285484  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1292  ribose-phosphate pyrophosphokinase  65.92 
 
 
315 aa  441  9.999999999999999e-123  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0161  ribose-phosphate pyrophosphokinase  64.56 
 
 
316 aa  431  1e-120  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0604  ribose-phosphate pyrophosphokinase  63.32 
 
 
315 aa  425  1e-118  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000767857  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0587  ribose-phosphate pyrophosphokinase  57.78 
 
 
316 aa  363  2e-99  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000361912  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0636  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.94 
 
 
325 aa  363  2e-99  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.532932  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21230  ribose-phosphate pyrophosphokinase  59.18 
 
 
314 aa  362  4e-99  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000002117  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1472  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.05 
 
 
316 aa  360  2e-98  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0157862 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0100  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.26 
 
 
316 aa  359  4e-98  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.100447  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2768  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.73 
 
 
316 aa  358  7e-98  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0630543  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0179  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.31 
 
 
314 aa  354  1e-96  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0044  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.97 
 
 
315 aa  353  2e-96  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0046  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.89 
 
 
315 aa  353  2.9999999999999997e-96  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2078  ribose-phosphate pyrophosphokinase  57.28 
 
 
317 aa  353  2.9999999999999997e-96  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3682  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.46 
 
 
316 aa  350  2e-95  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000078681  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0206  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.31 
 
 
315 aa  349  3e-95  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.981625  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0068  ribose-phosphate diphosphokinase  53.77 
 
 
317 aa  345  7e-94  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0045  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.13 
 
 
317 aa  344  1e-93  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.993888  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2812  ribose-phosphate pyrophosphokinase  52.83 
 
 
319 aa  344  1e-93  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0048  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.13 
 
 
317 aa  343  2e-93  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0049  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.13 
 
 
317 aa  343  2e-93  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0045  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.13 
 
 
317 aa  343  2e-93  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0045  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.13 
 
 
317 aa  343  2e-93  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0045  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.13 
 
 
317 aa  343  2e-93  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5261  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.13 
 
 
317 aa  343  2e-93  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0055  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.13 
 
 
317 aa  343  2e-93  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.822435  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0049  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.13 
 
 
317 aa  343  2e-93  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0059  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.13 
 
 
317 aa  343  2e-93  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0056  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.13 
 
 
317 aa  343  2e-93  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2498  ribose-phosphate pyrophosphokinase  52.83 
 
 
319 aa  343  2.9999999999999997e-93  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0092  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.02 
 
 
313 aa  342  4e-93  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1760  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.05 
 
 
314 aa  342  5e-93  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.0000000000000290937  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01246  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.73 
 
 
311 aa  342  5.999999999999999e-93  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004207  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.41 
 
 
314 aa  341  8e-93  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000977539  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0061  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.02 
 
 
322 aa  341  8e-93  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0325861  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0661  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.17 
 
 
314 aa  340  1e-92  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0743  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.46 
 
 
314 aa  340  2e-92  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.549423  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0069  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.46 
 
 
318 aa  339  2.9999999999999998e-92  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.829297  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0212  phosphoribosylpyrophosphate synthetase  53 
 
 
327 aa  339  2.9999999999999998e-92  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00571516 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1439  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.57 
 
 
325 aa  338  8e-92  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2848  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.29 
 
 
314 aa  338  8e-92  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000330674  hitchhiker  0.0000000000848542 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4345  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.56 
 
 
323 aa  338  9e-92  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2916  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.92 
 
 
324 aa  338  9.999999999999999e-92  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000010971  normal  0.440092 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0786  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.1 
 
 
332 aa  337  9.999999999999999e-92  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000113332  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3689  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.24 
 
 
324 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00564575  normal  0.505374 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2595  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.95 
 
 
314 aa  336  3.9999999999999995e-91  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00599255  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0985  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.63 
 
 
331 aa  336  3.9999999999999995e-91  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.107036  normal  0.0501032 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3610  Fis family transcriptional regulator  52.96 
 
 
319 aa  335  5.999999999999999e-91  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.493844 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2570  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.92 
 
 
315 aa  335  7e-91  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00338227  normal  0.11667 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3130  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.06 
 
 
324 aa  334  9e-91  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000268526  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3557  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.21 
 
 
314 aa  334  1e-90  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00334731  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0076  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.14 
 
 
322 aa  334  1e-90  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3092  ribose-phosphate pyrophosphokinase  52.68 
 
 
319 aa  334  1e-90  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3463  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.75 
 
 
315 aa  333  3e-90  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.281933  normal  0.770216 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0719  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.92 
 
 
315 aa  332  5e-90  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0196966  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0692  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.06 
 
 
315 aa  332  6e-90  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3550  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.06 
 
 
315 aa  332  6e-90  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000537383 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3741  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.06 
 
 
315 aa  332  6e-90  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.473037 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3618  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.06 
 
 
315 aa  332  6e-90  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.294091  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2341  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.29 
 
 
315 aa  332  6e-90  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1293  ribose-phosphate pyrophosphokinase  50.78 
 
 
324 aa  332  6e-90  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.891091 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2862  ribose-phosphate pyrophosphokinase  52.24 
 
 
320 aa  332  7.000000000000001e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.0000366656  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0221  ribose-phosphate pyrophosphokinase  49.84 
 
 
329 aa  331  8e-90  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000000000342806  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2720  ribose-phosphate pyrophosphokinase  52.55 
 
 
320 aa  330  1e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000418106  normal  0.234705 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2188  ribose-phosphate pyrophosphokinase  51.58 
 
 
320 aa  330  1e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0141666  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2068  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.75 
 
 
315 aa  330  1e-89  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0476582  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3173  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.46 
 
 
315 aa  331  1e-89  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.283101  normal  0.911812 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0793  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.46 
 
 
315 aa  331  1e-89  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000256168  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0765  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.46 
 
 
315 aa  331  1e-89  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.675099  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01182  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.97 
 
 
315 aa  330  2e-89  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.472694  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3837  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.46 
 
 
315 aa  330  2e-89  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0797  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.46 
 
 
315 aa  330  2e-89  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.97766  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2813  ribose-phosphate pyrophosphokinase  51.58 
 
 
320 aa  330  2e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.223011  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1355  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.97 
 
 
315 aa  330  2e-89  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000522341  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1660  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.18 
 
 
325 aa  330  2e-89  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1688  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.97 
 
 
315 aa  330  2e-89  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000327484  normal  0.706483 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2419  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.97 
 
 
315 aa  330  2e-89  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0172206  hitchhiker  0.00439854 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1986  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.4 
 
 
315 aa  330  2e-89  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.675824  normal  0.0111954 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0951  ribose-phosphate pyrophosphokinase  52.16 
 
 
324 aa  330  2e-89  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2802  ribose-phosphate pyrophosphokinase  51.58 
 
 
320 aa  330  2e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0348969  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1312  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.97 
 
 
315 aa  330  2e-89  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000147835  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01192  hypothetical protein  53.97 
 
 
315 aa  330  2e-89  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.332422  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2440  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.97 
 
 
337 aa  330  3e-89  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.019928  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1357  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.97 
 
 
315 aa  329  3e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000430302  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0824  ribose-phosphate pyrophosphokinase  52.65 
 
 
321 aa  329  3e-89  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.37249  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1977  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.97 
 
 
315 aa  329  3e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.607656  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1541  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.97 
 
 
315 aa  329  3e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.049338  normal  0.157535 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1935  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.97 
 
 
337 aa  330  3e-89  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000351672  normal  0.350342 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1919  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.97 
 
 
315 aa  329  3e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.167319  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0895  Fis family transcriptional regulator  52.65 
 
 
321 aa  329  3e-89  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.944384  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0873  ribose-phosphate pyrophosphokinase  51.75 
 
 
324 aa  329  3e-89  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1913  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.97 
 
 
315 aa  329  3e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.282698  normal  0.8749 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0820  ribose-phosphate pyrophosphokinase  52.38 
 
 
315 aa  329  4e-89  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0240183  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0899  ribose-phosphate pyrophosphokinase  52.72 
 
 
324 aa  328  5.0000000000000004e-89  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.941259  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2411  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.75 
 
 
315 aa  328  5.0000000000000004e-89  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.516491  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1371  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.65 
 
 
315 aa  328  5.0000000000000004e-89  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000127042  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2118  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.75 
 
 
315 aa  329  5.0000000000000004e-89  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.092676  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0513  ribose-phosphate pyrophosphokinase  51.41 
 
 
318 aa  328  6e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.127422  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4133  ribose-phosphate pyrophosphokinase  51.57 
 
 
318 aa  328  7e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.266741  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>