More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_1365 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010003  Pmob_1365  adenylosuccinate synthetase  100 
 
 
420 aa  858    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1647  adenylosuccinate synthetase  48.77 
 
 
397 aa  350  3e-95  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1720  adenylosuccinate synthetase  47.77 
 
 
397 aa  348  9e-95  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1284  adenylosuccinate synthetase  46.08 
 
 
402 aa  335  9e-91  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0313  adenylosuccinate synthetase  44.12 
 
 
399 aa  328  1.0000000000000001e-88  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.241475  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3138  adenylosuccinate synthetase  40.88 
 
 
430 aa  316  6e-85  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.32892  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2963  adenylosuccinate synthetase  39.12 
 
 
428 aa  313  2.9999999999999996e-84  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.17225  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0397  Adenylosuccinate synthase  43.14 
 
 
398 aa  313  4.999999999999999e-84  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3635  adenylosuccinate synthetase  40.93 
 
 
429 aa  311  1e-83  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.336244 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1134  adenylosuccinate synthetase  42.65 
 
 
414 aa  311  2e-83  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2536  adenylosuccinate synthetase  42.69 
 
 
427 aa  309  5e-83  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0017  adenylosuccinate synthetase  43.09 
 
 
427 aa  309  5e-83  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0017  adenylosuccinate synthetase  43.09 
 
 
427 aa  309  5e-83  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.000177457  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3093  adenylosuccinate synthetase  42.46 
 
 
424 aa  308  8e-83  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000909449  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35160  Adenylosuccinate synthetase  40.37 
 
 
429 aa  305  9.000000000000001e-82  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2354  adenylosuccinate synthetase  42.76 
 
 
426 aa  304  2.0000000000000002e-81  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0316685  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1452  adenylosuccinate synthetase  40.86 
 
 
433 aa  304  2.0000000000000002e-81  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.719728  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2270  adenylosuccinate synthetase  41.89 
 
 
418 aa  303  3.0000000000000004e-81  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1282  adenylosuccinate synthetase  41.19 
 
 
431 aa  303  4.0000000000000003e-81  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.705282  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0966  Adenylosuccinate synthase  42.36 
 
 
432 aa  303  4.0000000000000003e-81  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0518  adenylosuccinate synthetase  41.13 
 
 
430 aa  303  5.000000000000001e-81  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.289891  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1818  adenylosuccinate synthetase  41.08 
 
 
430 aa  302  6.000000000000001e-81  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0200825  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0903  Adenylosuccinate synthase  40.38 
 
 
430 aa  302  8.000000000000001e-81  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.546302  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0552  adenylosuccinate synthetase  41.51 
 
 
432 aa  301  1e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000130749  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2007  adenylosuccinate synthetase  39.29 
 
 
431 aa  301  1e-80  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00017376  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0213  adenylosuccinate synthetase  39.42 
 
 
434 aa  301  1e-80  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.816026  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2309  adenylosuccinate synthetase  41.57 
 
 
427 aa  301  1e-80  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0139427  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0565  adenylosuccinate synthetase  41.65 
 
 
432 aa  301  1e-80  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.22549e-25 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0025  adenylosuccinate synthetase  40.98 
 
 
426 aa  301  2e-80  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.993316  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2031  adenylosuccinate synthetase  39.9 
 
 
435 aa  300  4e-80  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0290835 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2416  adenylosuccinate synthetase  39.21 
 
 
428 aa  300  4e-80  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0322  adenylosuccinate synthetase  38.94 
 
 
434 aa  298  9e-80  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1347  adenylosuccinate synthetase  39.44 
 
 
428 aa  298  9e-80  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4469  adenylosuccinate synthetase  39.68 
 
 
429 aa  298  1e-79  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1913  adenylosuccinate synthetase  40.42 
 
 
430 aa  298  1e-79  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1939  adenylosuccinate synthetase  39.76 
 
 
431 aa  298  1e-79  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5320  adenylosuccinate synthetase  40.81 
 
 
429 aa  297  2e-79  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000159422  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5148  adenylosuccinate synthetase  40.81 
 
 
429 aa  297  2e-79  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  1.87247e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1816  adenylosuccinate synthetase  39.66 
 
 
434 aa  297  2e-79  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5716  adenylosuccinate synthetase  40.81 
 
 
429 aa  297  2e-79  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000188586  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0767  adenylosuccinate synthetase  42.08 
 
 
432 aa  298  2e-79  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5577  adenylosuccinate synthetase  40.81 
 
 
429 aa  297  2e-79  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.85689e-26 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3251  adenylosuccinate synthetase  41.97 
 
 
430 aa  297  3e-79  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.220385  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1271  adenylosuccinate synthetase  39.95 
 
 
429 aa  297  3e-79  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.231459  normal  0.288086 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0330  adenylosuccinate synthetase  41.01 
 
 
428 aa  296  4e-79  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3260  adenylosuccinate synthetase  40.24 
 
 
430 aa  296  4e-79  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0574684  hitchhiker  0.00000000000114461 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1985  adenylosuccinate synthetase  39.24 
 
 
444 aa  296  4e-79  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.133256  normal  0.151418 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3868  adenylosuccinate synthetase  39.19 
 
 
442 aa  296  5e-79  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.838486  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2149  adenylosuccinate synthetase  40.87 
 
 
425 aa  296  6e-79  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.755328  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3410  adenylosuccinate synthetase  40.86 
 
 
428 aa  296  6e-79  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0133  adenylosuccinate synthase  40.75 
 
 
807 aa  295  8e-79  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.279104  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4635  adenylosuccinate synthetase  40.18 
 
 
427 aa  295  9e-79  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.595604  normal  0.413258 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1701  adenylosuccinate synthetase  39.72 
 
 
431 aa  295  9e-79  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.401877  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0524  adenylosuccinate synthetase  40.43 
 
 
432 aa  295  9e-79  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2262  adenylosuccinate synthetase  38.7 
 
 
429 aa  295  1e-78  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0914846 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0390  adenylosuccinate synthetase  40.14 
 
 
429 aa  295  1e-78  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000168216  decreased coverage  0.00000000000000193534 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2126  adenylosuccinate synthetase  38.28 
 
 
428 aa  295  1e-78  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4344  adenylosuccinate synthetase  38.25 
 
 
432 aa  295  1e-78  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3308  adenylosuccinate synthetase  40.19 
 
 
433 aa  294  2e-78  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00120298  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0211  adenylosuccinate synthetase  37.93 
 
 
427 aa  294  2e-78  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.398163 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3012  adenylosuccinate synthetase  39.49 
 
 
427 aa  294  2e-78  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0951897  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2661  adenylosuccinate synthetase  40.1 
 
 
431 aa  294  2e-78  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2196  adenylosuccinate synthetase  38.94 
 
 
434 aa  294  2e-78  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05720  adenylosuccinate synthetase  38.48 
 
 
445 aa  294  2e-78  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.196579  normal  0.310447 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0203  adenylosuccinate synthetase  41.51 
 
 
431 aa  293  3e-78  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  8.773480000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11510  Adenylosuccinate synthetase  38.8 
 
 
434 aa  293  3e-78  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.616964  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0139  adenylosuccinate synthetase  40.52 
 
 
429 aa  293  3e-78  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000561019 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4119  adenylosuccinate synthetase  38.8 
 
 
428 aa  293  4e-78  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0180773  normal  0.366242 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2641  adenylosuccinate synthetase  41.27 
 
 
428 aa  293  4e-78  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.536345  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3539  adenylosuccinate synthetase  40.8 
 
 
428 aa  293  5e-78  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4007  adenylosuccinate synthetase  39.31 
 
 
429 aa  293  6e-78  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000037837  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2691  adenylosuccinate synthetase  40.76 
 
 
432 aa  292  6e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.321196  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2958  adenylosuccinate synthetase  41.27 
 
 
428 aa  292  6e-78  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08920  adenylosuccinate synthetase  37.82 
 
 
432 aa  292  7e-78  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2857  adenylosuccinate synthetase  38 
 
 
445 aa  292  8e-78  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2207  adenylosuccinate synthetase  41 
 
 
430 aa  292  8e-78  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4368  adenylosuccinate synthetase  37.79 
 
 
427 aa  292  9e-78  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.335736  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2598  adenylosuccinate synthetase  40.76 
 
 
432 aa  292  9e-78  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.0051551  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0035  adenylosuccinate synthetase  40.6 
 
 
438 aa  291  1e-77  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1265  adenylosuccinate synthetase  40.52 
 
 
432 aa  291  1e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0163864  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0389  Adenylosuccinate synthase  40.14 
 
 
427 aa  291  1e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.899335  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5617  adenylosuccinate synthetase  40.43 
 
 
429 aa  291  2e-77  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000421439  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5164  adenylosuccinate synthetase  40.43 
 
 
429 aa  291  2e-77  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000038286  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27840  Adenylosuccinate synthetase  39.27 
 
 
438 aa  291  2e-77  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2909  Adenylosuccinate synthetase  40.47 
 
 
429 aa  290  2e-77  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000270112  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0271  adenylosuccinate synthetase  39.76 
 
 
427 aa  291  2e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5260  adenylosuccinate synthetase  40.19 
 
 
429 aa  291  2e-77  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000740199  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0176  adenylosuccinate synthetase  38.84 
 
 
427 aa  290  3e-77  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5655  adenylosuccinate synthetase  40.43 
 
 
429 aa  290  3e-77  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000753015  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1409  adenylosuccinate synthetase  37.96 
 
 
448 aa  290  3e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000087591 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3357  adenylosuccinate synthetase  39.95 
 
 
431 aa  290  3e-77  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0113184  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0607  adenylosuccinate synthetase  38.33 
 
 
432 aa  290  4e-77  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.272974 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2180  adenylosuccinate synthetase  39.43 
 
 
432 aa  290  4e-77  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000134883  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2390  adenylosuccinate synthetase  38.22 
 
 
434 aa  290  4e-77  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2974  adenylosuccinate synthetase  38.14 
 
 
435 aa  289  5.0000000000000004e-77  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.823957 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5594  adenylosuccinate synthetase  40.43 
 
 
429 aa  289  5.0000000000000004e-77  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000767866  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3234  adenylosuccinate synthase  39.63 
 
 
437 aa  289  6e-77  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.000199193  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0203  adenylosuccinate synthetase  39.49 
 
 
427 aa  289  7e-77  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2626  adenylosuccinate synthase  40.23 
 
 
437 aa  289  7e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  unclonable  0.00000000000737689 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2764  adenylosuccinate synthase  39.38 
 
 
431 aa  288  9e-77  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>