More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_3221 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_2994  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  75.93 
 
 
418 aa  637    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.135247  normal  0.163321 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3221  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  100 
 
 
411 aa  823    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.900431  normal  0.930845 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3994  putative FMN oxidoreductase  79.9 
 
 
411 aa  638    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.45053  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29030  putative FMN oxidoreductase  80.4 
 
 
411 aa  645    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000106505 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2699  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  75.43 
 
 
418 aa  630  1e-179  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1700  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  72.79 
 
 
411 aa  604  9.999999999999999e-173  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.167604  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2008  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  72.3 
 
 
411 aa  601  1.0000000000000001e-171  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.584547  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4065  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  73.11 
 
 
414 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3456  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  73.11 
 
 
414 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.387515  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2709  NADH-flavin oxidoreductase/NADH oxidase  72.55 
 
 
414 aa  598  1e-170  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4091  flavine mononucleotide (FMN) oxidoreductase  72.68 
 
 
420 aa  600  1e-170  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.60361  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02984  putative NADH oxidase-related oxidoreductase protein  73.37 
 
 
411 aa  593  1e-168  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.476298  normal  0.536357 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3405  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  71.64 
 
 
411 aa  593  1e-168  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2455  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  70.17 
 
 
412 aa  571  1.0000000000000001e-162  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.649211  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2822  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  69.76 
 
 
411 aa  565  1e-160  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.308069 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0206  NADH oxidase  67.89 
 
 
424 aa  556  1e-157  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.847587  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2441  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  55.47 
 
 
412 aa  461  9.999999999999999e-129  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0420903  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3476  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  56.05 
 
 
425 aa  438  9.999999999999999e-123  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.493989  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01808  oxidoreductase, FMN-binding protein  55.61 
 
 
389 aa  433  1e-120  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.396226  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2215  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  52.84 
 
 
407 aa  389  1e-107  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4732  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45.87 
 
 
416 aa  360  2e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.880422 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0803  oxidoreductase, FAD/FMN-binding  44.64 
 
 
441 aa  352  5e-96  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0912905  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0619  oxidoreductase, FAD/FMN-binding  44.31 
 
 
441 aa  351  2e-95  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0191896  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2131  oxidoreductase, FAD/FMN-binding  44.31 
 
 
441 aa  351  2e-95  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2218  oxidoreductase, FAD/FMN-binding  44.06 
 
 
454 aa  350  3e-95  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.202859  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2021  oxidoreductase, FAD/FMN-binding  44.31 
 
 
441 aa  349  5e-95  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0699  oxidoreductase, FAD/FMN-binding  44.31 
 
 
454 aa  349  5e-95  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0313  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  43.77 
 
 
414 aa  346  5e-94  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.139145  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1170  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.12 
 
 
423 aa  345  6e-94  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1578  oxidoreductase, FAD/FMN-binding  44.06 
 
 
441 aa  345  7e-94  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.568698  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2143  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.64 
 
 
421 aa  340  2e-92  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4518  FMN oxidoreductase  41.01 
 
 
401 aa  320  3.9999999999999996e-86  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3247  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  47.66 
 
 
435 aa  314  1.9999999999999998e-84  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4571  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45.01 
 
 
421 aa  308  9e-83  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.142978  normal  0.848458 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1739  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  43.8 
 
 
427 aa  286  5.999999999999999e-76  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.452166  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0580  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  46.53 
 
 
408 aa  281  2e-74  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.717621  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2507  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  37.01 
 
 
397 aa  246  6e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3978  oxidoreductase, FAD/FMN-binding  37.97 
 
 
399 aa  241  2e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0069  NADH:flavin oxidoreductase  37.13 
 
 
377 aa  196  5.000000000000001e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000720309  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3330  Oye family NADH-dependent flavin oxidoreductase  39.13 
 
 
374 aa  193  4e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1087  NADH:flavin oxidoreductase  35.67 
 
 
365 aa  193  5e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0980  NADH peroxidase  33.14 
 
 
360 aa  191  2.9999999999999997e-47  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0123  flavin oxidoreductase/NADH oxidase  40.54 
 
 
374 aa  190  4e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00317178  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1057  NADH oxidase  30.65 
 
 
370 aa  189  1e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.263172  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0113  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  32.16 
 
 
364 aa  187  2e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4072  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  31.78 
 
 
366 aa  188  2e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06167  FMN binding oxidoreductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G08260)  35.35 
 
 
369 aa  186  6e-46  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.69332  normal  0.461703 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0697  oxidoreductase, FAD/FMN-binding  30.56 
 
 
368 aa  186  9e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00245869  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4410  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  36.49 
 
 
374 aa  184  3e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00186263  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2977  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  38.08 
 
 
372 aa  181  2.9999999999999997e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.675627 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05496  NADH-dependent flavin oxidoreductase  31.3 
 
 
376 aa  180  4.999999999999999e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2818  NADH peroxidase  32.57 
 
 
365 aa  177  4e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.609535  normal  0.162723 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2707  NADH:flavin oxidoreductase  29.36 
 
 
409 aa  170  3e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0771  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  30.06 
 
 
330 aa  169  1e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0157719 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2429  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  27.78 
 
 
646 aa  167  4e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0778  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  34.35 
 
 
386 aa  167  4e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000175995  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1595  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  34.9 
 
 
667 aa  166  8e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1150  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  32 
 
 
402 aa  160  3e-38  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1456  FMN oxidoreductase  34.78 
 
 
354 aa  160  5e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0196412  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1479  NADH:flavin oxidoreductase  32.09 
 
 
650 aa  159  7e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3973  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  35.04 
 
 
671 aa  159  9e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0868  oxidoreductase, FAD/FMN-binding  31.43 
 
 
335 aa  159  1e-37  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.730901  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1021  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  29.74 
 
 
407 aa  157  2e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3616  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  29.63 
 
 
711 aa  155  9e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.667421  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0148  flavin oxidoreductase/NADH oxidase  32.22 
 
 
357 aa  154  2e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0361  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  35.17 
 
 
355 aa  152  8.999999999999999e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000624901 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1398  putative FMN oxidoreductase  33.33 
 
 
368 aa  152  1e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16260  putative FMN oxidoreductase  32.76 
 
 
368 aa  150  3e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0765  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  28.79 
 
 
646 aa  150  3e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.564446  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1977  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  30.56 
 
 
411 aa  150  4e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1442  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  28.73 
 
 
357 aa  150  5e-35  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00181939  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4435  flavin oxidoreductase/NADH oxidase  32.75 
 
 
355 aa  149  6e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2193  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  32.11 
 
 
645 aa  150  6e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000298441  normal  0.0270911 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0369  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  32.47 
 
 
662 aa  150  6e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.550194 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1496  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  29.05 
 
 
399 aa  149  7e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4243  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  33.24 
 
 
368 aa  149  8e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3558  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  31.87 
 
 
653 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.102726  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3719  NADH-flavin oxidoreductase/NADH oxidase  35.73 
 
 
354 aa  148  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.717818  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0146  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  30.62 
 
 
654 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1489  xenobiotic reductase, putative  32.53 
 
 
368 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.803856  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1107  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  28.48 
 
 
329 aa  148  2.0000000000000003e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3290  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  32.58 
 
 
413 aa  147  3e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.207789 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1299  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  32.23 
 
 
368 aa  146  6e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.203644 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3776  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  34.87 
 
 
352 aa  146  7.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.21839  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1086  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  32.37 
 
 
368 aa  145  1e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.607736 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2016  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  29.79 
 
 
687 aa  145  1e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.061853  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39430  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  33.53 
 
 
368 aa  145  1e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2881  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  31.9 
 
 
364 aa  145  1e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.438588  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1304  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  31.52 
 
 
334 aa  145  1e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33410  NADH:flavin oxidoreductase  34.58 
 
 
359 aa  144  2e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.374092  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0472  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  30.91 
 
 
344 aa  145  2e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1573  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  30.3 
 
 
365 aa  144  2e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0319  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  36.63 
 
 
351 aa  144  2e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.254324  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0435  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  32.54 
 
 
353 aa  145  2e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1624  NADH-flavin oxidoreductase/NADH oxidase  30.47 
 
 
423 aa  144  3e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0238661  normal  0.359073 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1919  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  27.55 
 
 
387 aa  144  4e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.522905 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1289  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  30.81 
 
 
377 aa  143  6e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.306648  normal  0.411333 
 
 
-
 
NC_006685  CNC03800  conserved hypothetical protein  29.33 
 
 
450 aa  143  6e-33  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3859  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  34.29 
 
 
352 aa  142  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0966  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  33.7 
 
 
369 aa  142  9.999999999999999e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.104436  normal  0.525672 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>