More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_3016 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_3016  CinA domain-containing protein  100 
 
 		 166 aa  330  7.000000000000001e-90  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.633216  hitchhiker  0.000000000145641 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38570  CinA-related protein  76.25 
 
 		 164 aa  244  4e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1628  CinA domain-containing protein  77.5 
 
 		 160 aa  243  8e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.122371  normal  0.187928 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1522  hypothetical protein  75 
 
 		 168 aa  240  5e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4089  CinA domain-containing protein  76.25 
 
 		 160 aa  240  7e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17520  hypothetical protein  76.88 
 
 		 168 aa  239  7.999999999999999e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4031  CinA domain-containing protein  75.62 
 
 		 160 aa  235  2e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.306417  unclonable  0.0000000000000327829 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1174  CinA-like  73.91 
 
 		 177 aa  233  7e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.348746 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1230  CinA domain-containing protein  73.75 
 
 		 160 aa  232  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000000125807 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4034  cinA domain protein  71.08 
 
 		 166 aa  224  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.344001  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1377  CinA, C-terminal  70.55 
 
 		 192 aa  214  4e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.368331  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1287  CinA-like  59.62 
 
 		 166 aa  176  1e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0385  competence/damage inducible protein CinA  62 
 
 		 159 aa  172  1.9999999999999998e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0903  CinA domain protein  53.37 
 
 		 218 aa  160  7e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00227133 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0922  CinA-like protein  53.05 
 
 		 162 aa  158  3e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0980  competence damage-inducible protein A  55.19 
 
 		 162 aa  156  1e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0622  CinA-like protein  55.35 
 
 		 174 aa  154  5.0000000000000005e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.550403  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3382  competence-damaged protein CinA  53.85 
 
 		 165 aa  154  6e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00000695427  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1704  CinA domain protein  50.62 
 
 		 200 aa  153  1e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.28377  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0995  competence damage-inducible protein A  52.32 
 
 		 172 aa  149  1e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.108193  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0840  competence damage-inducible protein A  52.98 
 
 		 162 aa  149  2e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0987514  hitchhiker  0.00000024761 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3947  competence damage-inducible protein A  54.9 
 
 		 165 aa  149  2e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.388392  normal  0.701681 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1767  hypothetical protein  50.97 
 
 		 164 aa  148  3e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0067  competence/damage inducible protein CinA  53.85 
 
 		 162 aa  148  3e-35  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03080  CinA-like protein  48.12 
 
 		 179 aa  148  4e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.25785  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0055  CinA domain-containing protein  53.85 
 
 		 162 aa  147  5e-35  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3049  CinA-like protein  48.1 
 
 		 165 aa  147  6e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3139  competence damage-inducible protein A  54.9 
 
 		 165 aa  147  8e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000242069 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2850  CinA, C-terminal  48.1 
 
 		 165 aa  147  8e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2981  competence damage-inducible protein A  54.9 
 
 		 165 aa  147  8e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.355767  decreased coverage  0.0000723064 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2949  competence damage-inducible protein A  54.9 
 
 		 165 aa  147  8e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02550  competence damage-inducible protein A  54.9 
 
 		 165 aa  147  9e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0187741  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0989  CinA domain protein  54.9 
 
 		 165 aa  147  9e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00650499  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2480  competence/damage-inducible protein CinA  50.62 
 
 		 166 aa  147  9e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0447623  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3477  competence/damage-inducible protein CinA  50.62 
 
 		 166 aa  147  9e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.813884  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1012  competence damage-inducible protein A  54.9 
 
 		 165 aa  147  9e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000218203 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02515  hypothetical protein  54.9 
 
 		 165 aa  147  9e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0457216  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1186  competence/damage-inducible protein CinA  50.62 
 
 		 166 aa  147  9e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1259  cinA family protein  50.62 
 
 		 166 aa  147  9e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3479  cinA family protein  50.62 
 
 		 166 aa  147  9e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.292867  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2984  competence damage-inducible protein A  54.9 
 
 		 165 aa  147  9e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0375437  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2836  competence damage-inducible protein A  54.9 
 
 		 165 aa  147  9e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.193332  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3306  cinA family protein  50.62 
 
 		 166 aa  147  9e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3442  cinA family protein  50.62 
 
 		 166 aa  147  9e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.983742  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2823  competence damage-inducible protein A  54.9 
 
 		 165 aa  147  9e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0804324  hitchhiker  0.00000514203 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0399  cinA family protein  50.62 
 
 		 166 aa  147  9e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.433149  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1767  hypothetical protein  49.69 
 
 		 164 aa  146  1.0000000000000001e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3177  competence damage-inducible protein A  54.9 
 
 		 165 aa  146  1.0000000000000001e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.266216  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3032  competence damage-inducible protein A  54.25 
 
 		 165 aa  146  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.162361  hitchhiker  0.00262793 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3016  competence damage-inducible protein A  54.25 
 
 		 165 aa  145  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.047861  decreased coverage  0.0000000741829 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002518  hypothetical protein  51.57 
 
 		 160 aa  145  3e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0429  CinA domain-containing protein  54 
 
 		 156 aa  145  3e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.962415  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3262  CinA-like  50.93 
 
 		 170 aa  144  6e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2770  hypothetical protein  49.36 
 
 		 166 aa  144  7.0000000000000006e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.335276  normal  0.296125 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3667  CinA domain-containing protein  54.97 
 
 		 173 aa  144  8.000000000000001e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0902  competence damage-inducible protein A  51.97 
 
 		 184 aa  143  1e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0145  CinA-like  50.31 
 
 		 166 aa  143  1e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.774466  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0628  CinA domain-containing protein  50.31 
 
 		 166 aa  143  1e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0354  CinA domain-containing protein  54.23 
 
 		 179 aa  143  1e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2757  CinA domain-containing protein  50.31 
 
 		 166 aa  142  2e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.439876  normal  0.642955 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2477  CinA domain protein  47.68 
 
 		 156 aa  142  2e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3376  competence damage-inducible protein A  51.97 
 
 		 162 aa  142  2e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1473  CinA domain protein  53.38 
 
 		 166 aa  142  2e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3241  competence damage-inducible protein A  51.97 
 
 		 162 aa  142  2e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.450801  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3921  CinA domain-containing protein  56.2 
 
 		 169 aa  142  2e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0596  CinA domain-containing protein  49.69 
 
 		 166 aa  142  3e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.774081  normal  0.307484 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3682  competence/damage-inducible protein CinA  57.48 
 
 		 432 aa  141  4e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00153  competence/damage-inducible protein CinA domain protein  52.56 
 
 		 164 aa  141  4e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0553  CinA domain-containing protein  49.04 
 
 		 166 aa  141  5e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4476  CinA-like  56.12 
 
 		 168 aa  141  5e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.184507 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03514  hypothetical protein  49.69 
 
 		 160 aa  141  5e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0529  CinA domain-containing protein  49.04 
 
 		 184 aa  140  6e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1617  CinA domain protein  49.06 
 
 		 176 aa  139  9.999999999999999e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.895217 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1593  CinA-like  46.88 
 
 		 166 aa  139  1.9999999999999998e-32  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2607  CinA domain-containing protein  49.06 
 
 		 166 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.095939 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1285  CinA domain protein  56.49 
 
 		 165 aa  139  1.9999999999999998e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.982148  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3710  CinA-like  49.06 
 
 		 166 aa  138  3.9999999999999997e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.909582  normal  0.123523 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0554  putative competence-damaged protein, CinA-like  48.43 
 
 		 166 aa  137  4.999999999999999e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.43558 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3874  CinA, C-terminal  49.68 
 
 		 166 aa  137  6e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2606  CinA domain protein  47.44 
 
 		 166 aa  137  6e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.590584  normal  0.640743 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1113  competence damage-inducible protein A  50.66 
 
 		 164 aa  137  6e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.383683  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3175  competence damage-inducible protein A  50 
 
 		 166 aa  136  1e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.618843  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3402  CinA domain protein  47.8 
 
 		 166 aa  136  1e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.109005  normal  0.0764099 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0571  CinA-like protein  47.06 
 
 		 160 aa  136  1e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.230075 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3016  CinA domain protein  46.79 
 
 		 166 aa  136  1e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.850522 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2195  CinA protein  45.28 
 
 		 165 aa  135  2e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000000407296  hitchhiker  0.00000443632 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0221  CinA domain-containing protein  47.2 
 
 		 164 aa  135  2e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3733  CinA domain-containing protein  48.43 
 
 		 166 aa  134  4e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000115453 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1484  CinA domain-containing protein  49.04 
 
 		 168 aa  134  4e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.414314  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0633  putative competence-damaged protein  45.45 
 
 		 165 aa  134  6.0000000000000005e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.236595  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2330  competence/damage-inducible protein CinA  46.98 
 
 		 418 aa  134  7.000000000000001e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.261185 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0581  CinA domain-containing protein  50 
 
 		 175 aa  133  9.999999999999999e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3214  competence damage-inducible protein A  48.68 
 
 		 164 aa  133  9.999999999999999e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5905  competence/damage-inducible protein CinA  48.1 
 
 		 437 aa  133  9.999999999999999e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.940854  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1960  CinA domain-containing protein  50.67 
 
 		 164 aa  133  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3628  competence/damage-inducible protein CinA  47.83 
 
 		 414 aa  132  1.9999999999999998e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0712  CinA domain protein  54.25 
 
 		 162 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0880  competence/damage-inducible protein CinA  47.65 
 
 		 166 aa  132  1.9999999999999998e-30  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.630467  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0987  putative competence-damage protein  47.65 
 
 		 166 aa  132  1.9999999999999998e-30  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0708  CinA domain-containing protein  50.31 
 
 		 163 aa  132  1.9999999999999998e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>