57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_1901 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_1901  hypothetical protein  100 
 
 		 106 aa  216  1e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00121592  normal  0.870164 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4583  hypothetical protein  55.24 
 
 		 115 aa  118  3e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.165656 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1194  hypothetical protein  53.33 
 
 		 107 aa  117  6e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.707621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2715  hypothetical protein  50.48 
 
 		 106 aa  110  7.000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5163  hypothetical protein  52.38 
 
 		 106 aa  110  8.000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.934572 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3454  hypothetical protein  50.48 
 
 		 106 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.516869  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4067  hypothetical protein  49.52 
 
 		 106 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3403  hypothetical protein  50.48 
 
 		 106 aa  107  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5237  hypothetical protein  49.52 
 
 		 133 aa  106  9.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4644  protein of unknown function DUF1330  51.43 
 
 		 106 aa  104  3e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0263146  normal  0.598238 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0176  protein of unknown function DUF1330  42 
 
 		 112 aa  95.1  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3722  hypothetical protein  54.02 
 
 		 89 aa  93.2  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.104061  normal  0.935166 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5022  protein of unknown function DUF1330  48.54 
 
 		 112 aa  91.7  3e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0320092  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4630  protein of unknown function DUF1330  47.37 
 
 		 109 aa  91.3  4e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3354  hypothetical protein  52.05 
 
 		 73 aa  77.4  0.00000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.10898  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2076  hypothetical protein  35.05 
 
 		 95 aa  55.1  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.501523 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1042  hypothetical protein  41.03 
 
 		 97 aa  53.1  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.797208  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3229  hypothetical protein  34.02 
 
 		 95 aa  52.8  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1110  hypothetical protein  44.64 
 
 		 96 aa  51.6  0.000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0345  hypothetical protein  36.84 
 
 		 96 aa  50.8  0.000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0272597  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2337  protein of unknown function DUF1330  32.99 
 
 		 100 aa  50.1  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3539  hypothetical protein  33.77 
 
 		 95 aa  49.7  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0684  hypothetical protein  31.58 
 
 		 97 aa  48.5  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4587  protein of unknown function DUF1330  32.47 
 
 		 95 aa  47.4  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.226521 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4324  protein of unknown function DUF1330  33.77 
 
 		 95 aa  47.4  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1336  hypothetical protein  35.92 
 
 		 96 aa  46.6  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000449884 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3183  hypothetical protein  35.42 
 
 		 96 aa  46.2  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.614337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6612  hypothetical protein  35.29 
 
 		 104 aa  45.8  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1844  hypothetical protein  35.37 
 
 		 101 aa  45.8  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0722  protein of unknown function DUF1330  33.68 
 
 		 102 aa  45.8  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5042  hypothetical protein  39.44 
 
 		 88 aa  45.1  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.662041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7348  hypothetical protein  32.63 
 
 		 95 aa  45.1  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.310793  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0785  hypothetical protein  31.17 
 
 		 95 aa  44.7  0.0004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.560924  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1707  hypothetical protein  33.33 
 
 		 97 aa  44.7  0.0005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1325  hypothetical protein  33.33 
 
 		 96 aa  44.3  0.0006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0939  hypothetical protein  33.73 
 
 		 91 aa  44.3  0.0006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0008  hypothetical protein  26.67 
 
 		 94 aa  44.3  0.0006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.00922624  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3743  hypothetical protein  28.42 
 
 		 98 aa  44.3  0.0006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.679918 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4211  protein of unknown function DUF1330  30.53 
 
 		 95 aa  43.9  0.0007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.365151 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2045  hypothetical protein  31.17 
 
 		 95 aa  43.5  0.0009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0164673  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2129  hypothetical protein  31.17 
 
 		 95 aa  43.5  0.0009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.140278  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3966  protein of unknown function DUF1330  31.25 
 
 		 95 aa  43.1  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1090  hypothetical protein  36.67 
 
 		 97 aa  43.5  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6638  hypothetical protein  32.63 
 
 		 95 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0196  hypothetical protein  26.32 
 
 		 100 aa  42.4  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6158  hypothetical protein  32.63 
 
 		 95 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5793  hypothetical protein  32.63 
 
 		 95 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0105  hypothetical protein  29.47 
 
 		 110 aa  42.4  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.771179 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2807  protein of unknown function DUF1330  35.38 
 
 		 95 aa  42  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3239  hypothetical protein  32.91 
 
 		 97 aa  42  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0371902  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4004  protein of unknown function DUF1330  46.15 
 
 		 157 aa  42  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0341  protein of unknown function DUF1330  31.58 
 
 		 102 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00521106  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2285  hypothetical protein  26.97 
 
 		 96 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0613201  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0668  protein of unknown function DUF1330  28.72 
 
 		 95 aa  40.8  0.006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0495537  normal  0.0136421 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6118  hypothetical protein  29.17 
 
 		 96 aa  40.8  0.006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.133615  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1859  hypothetical protein  35.38 
 
 		 96 aa  40.8  0.006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000278867  normal  0.769812 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3703  hypothetical protein  32.58 
 
 		 96 aa  40  0.01  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.12428 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>