More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_0864 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007512  Plut_0864  xanthine/uracil permease-like protein  100 
 
 
566 aa  1133    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.219482 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2628  xanthine/uracil/vitamin C permease  33.8 
 
 
598 aa  306  6e-82  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.749845 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1664  xanthine/uracil permease family protein  28.72 
 
 
580 aa  237  4e-61  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.139365  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0106  Xanthine/uracil/vitamin C permease  32.36 
 
 
450 aa  219  1e-55  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1399  Xanthine/uracil/vitamin C permease  30.73 
 
 
450 aa  214  2.9999999999999995e-54  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000106582 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3234  xanthine/uracil/vitamin C permease  28.57 
 
 
577 aa  214  2.9999999999999995e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.627871  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0466  Xanthine/uracil/vitamin C permease  31.6 
 
 
549 aa  199  7.999999999999999e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.304923  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1726  uracil-xanthine permease  29.07 
 
 
452 aa  179  2e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0182  aminoacyl-tRNA synthetase, class Ia  30.63 
 
 
529 aa  177  4e-43  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3698  uracil-xanthine permease  27.56 
 
 
458 aa  156  1e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0384  xanthine permease  28.04 
 
 
452 aa  155  2e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0034  xanthine permease  28.29 
 
 
461 aa  154  2.9999999999999998e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.830973  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4182  uracil-xanthine permease  28.29 
 
 
472 aa  154  5e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0385  uracil-xanthine permease  27.8 
 
 
452 aa  154  5e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001868  xanthine/uracil permease family protein  27.48 
 
 
462 aa  152  1e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0772  xanthine/uracil permease family protein  25.76 
 
 
465 aa  151  3e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0676  xanthine/uracil permease family protein  25.61 
 
 
465 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0039  xanthine permease  27.95 
 
 
461 aa  149  1.0000000000000001e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4073  uracil-xanthine permease  26.97 
 
 
463 aa  149  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.853642 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3954  uracil-xanthine permease  26.97 
 
 
463 aa  149  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.33905 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4027  uracil-xanthine permease  26.97 
 
 
463 aa  149  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4133  uracil-xanthine permease  26.97 
 
 
463 aa  149  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.297531  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3964  uracil-xanthine permease  26.97 
 
 
463 aa  149  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00623  hypothetical protein  26.82 
 
 
463 aa  147  7.0000000000000006e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4105  xanthine permease  27.19 
 
 
463 aa  146  8.000000000000001e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03512  predicted transporter  27.19 
 
 
463 aa  146  1e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.508451  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0051  uracil-xanthine permease  27.19 
 
 
463 aa  146  1e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4158  xanthine permease  27.19 
 
 
463 aa  146  1e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0057  uracil-xanthine permease  27.19 
 
 
463 aa  146  1e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0676705 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03464  hypothetical protein  27.19 
 
 
463 aa  146  1e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.514946  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5027  xanthine permease  27.19 
 
 
463 aa  146  1e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3865  xanthine permease  27.19 
 
 
463 aa  146  1e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3953  uracil-xanthine permease  27.01 
 
 
462 aa  144  3e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4873  uracil-xanthine permease  27.93 
 
 
466 aa  144  4e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.952171  normal  0.0111954 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3989  xanthine permease  27.19 
 
 
463 aa  144  4e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2284  xanthine/uracil permease family protein  26.08 
 
 
466 aa  143  9.999999999999999e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02070  putative transporter  26.26 
 
 
468 aa  143  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.450253 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0161  xanthine permease  26.41 
 
 
451 aa  140  4.999999999999999e-32  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2223  uracil-xanthine permease  23.82 
 
 
486 aa  140  4.999999999999999e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.9529  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4214  uracil-xanthine permease  27.42 
 
 
462 aa  140  7e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0073  uracil-xanthine permease  26.13 
 
 
464 aa  138  2e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.134664  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2573  xanthine/uracil permease  28.02 
 
 
488 aa  138  2e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.837533 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4497  uracil-xanthine permease  27.64 
 
 
462 aa  139  2e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2762  uracil-xanthine permease  26.1 
 
 
500 aa  139  2e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.648328  normal  0.727682 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4150  uracil-xanthine permease  26.82 
 
 
462 aa  135  3e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29700  Xanthine/uracil permease family  26 
 
 
434 aa  132  1.0000000000000001e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.440339  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2148  xanthine/uracil permease family protein  26.32 
 
 
445 aa  128  2.0000000000000002e-28  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02501  xanthine/uracil permease family protein  24.49 
 
 
517 aa  128  2.0000000000000002e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0228  xanthine/uracil permease  26.7 
 
 
442 aa  129  2.0000000000000002e-28  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000515312  decreased coverage  6.186300000000001e-25 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3597  xanthine permease  26.58 
 
 
459 aa  128  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.243938 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3992  xanthine/uracil permease family protein  26.35 
 
 
459 aa  126  1e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.92577  hitchhiker  0.00216246 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1913  uracil-xanthine permease  25.86 
 
 
468 aa  126  1e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00677424  normal  0.0587093 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1841  uracil-xanthine permease  26.35 
 
 
459 aa  125  2e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000895635 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0538  purine/xanthine transport protein  24.94 
 
 
453 aa  125  2e-27  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2644  Xanthine/uracil/vitamin C permease  25.47 
 
 
571 aa  124  4e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0445  putative transporter  26.41 
 
 
461 aa  123  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3396  xanthine permease  26.52 
 
 
459 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.559771 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2003  uracil-xanthine permease  25 
 
 
466 aa  122  1.9999999999999998e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04610  putative transporter  26.58 
 
 
461 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3408  uracil-xanthine permease  27.59 
 
 
462 aa  121  3e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.604039  normal  0.0616677 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3915  xanthine permease  27.52 
 
 
462 aa  121  3.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.53056 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0261  xanthine permease  26.38 
 
 
825 aa  120  6e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3521  xanthine permease  27.54 
 
 
462 aa  120  7.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.964115  normal  0.563042 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4364  uracil-xanthine permease  27.54 
 
 
462 aa  120  7.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1426  Xanthine/uracil/vitamin C permease  25.06 
 
 
459 aa  120  7.999999999999999e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000668836  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4002  uracil-xanthine permease  27.54 
 
 
462 aa  120  7.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1007  xanthine/uracil permease family protein subfamily  27.29 
 
 
462 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1376  xanthine/uracil permease family protein  27.29 
 
 
509 aa  118  3e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.108395  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1798  Xanthine/uracil/vitamin C permease  25.11 
 
 
580 aa  118  3e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000426029 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1231  xanthine permease  27.13 
 
 
462 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1511  uracil-xanthine permease  25.87 
 
 
413 aa  117  5e-25  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0982636  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2088  xanthine/uracil transporter  27.09 
 
 
462 aa  117  6.9999999999999995e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.365471  normal  0.212155 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0246  putative transporter  24.5 
 
 
468 aa  116  7.999999999999999e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1066  xanthine/uracil permease family protein  27.13 
 
 
462 aa  117  7.999999999999999e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.175912  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1892  xanthine/uracil permease family protein  27.13 
 
 
462 aa  117  7.999999999999999e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0349  xanthine/uracil permease family protein  27.13 
 
 
462 aa  117  7.999999999999999e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0801  xanthine/uracil permease family protein  27.13 
 
 
462 aa  117  7.999999999999999e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1222  xanthine permease  26.91 
 
 
462 aa  116  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.622756  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3928  xanthine permease  26.34 
 
 
461 aa  116  1.0000000000000001e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.570861  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1667  xanthine permease  24.27 
 
 
450 aa  113  7.000000000000001e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3109  uracil-xanthine permease  26.15 
 
 
470 aa  113  8.000000000000001e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.74503  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1668  uracil-xanthine permease  24.77 
 
 
465 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1592  xanthine permease  25.47 
 
 
438 aa  112  1.0000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0629  Xanthine/uracil permease  26.94 
 
 
454 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.0040794  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4581  xanthine permease  27.17 
 
 
462 aa  111  4.0000000000000004e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5275  uracil-xanthine permease  23.05 
 
 
633 aa  110  7.000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2645  uracil-xanthine permease  24.13 
 
 
460 aa  109  1e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0234  uracil-xanthine permease  25.24 
 
 
487 aa  107  7e-22  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.72868  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1705  uracil-xanthine permease  25.72 
 
 
413 aa  106  1e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.297144  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4531  xanthine/uracil/vitamin C permease  27.53 
 
 
443 aa  105  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.720055  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0206  uracil-xanthine permease  25.42 
 
 
413 aa  105  3e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.202114  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2388  xanthine permease  27.67 
 
 
435 aa  104  5e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2599  uracil-xanthine permease  25.97 
 
 
459 aa  104  5e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.765117  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3202  uracil permease  24.89 
 
 
474 aa  103  6e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.324856  normal  0.729539 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3015  xanthine/uracil permease family protein  24.04 
 
 
466 aa  103  7e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0810  uracil-xanthine permease  23.83 
 
 
466 aa  102  2e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3208  xanthine/uracil permease family protein  23.83 
 
 
466 aa  102  2e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4172  xanthine/uracil permease family protein  23.83 
 
 
466 aa  102  2e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1785  uracil-xanthine permease  24.35 
 
 
484 aa  102  2e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3042  xanthine/uracil permease family protein  23.83 
 
 
466 aa  102  2e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>