29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_4226 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_4226  AIG2 family protein  100 
 
 
324 aa  671    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.745683  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4235  AIG2 family protein  32.21 
 
 
152 aa  63.5  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.729154  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0615  AIG2 family protein  32.91 
 
 
156 aa  60.8  0.00000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000000404906  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1201  AIG2 family protein  32.74 
 
 
156 aa  56.2  0.0000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000000220206  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4209  AIG2 family protein  31.43 
 
 
195 aa  56.6  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1701  AIG2 family protein  34.88 
 
 
371 aa  56.2  0.0000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1254  hypothetical protein  26.57 
 
 
133 aa  56.2  0.0000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00409915  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1231  hypothetical protein  24.48 
 
 
133 aa  50.8  0.00003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0164276  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3818  AIG2 family protein  30.2 
 
 
151 aa  50.8  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.165251 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0424  hypothetical protein  30.71 
 
 
149 aa  50.4  0.00004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.196987  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1452  hypothetical protein  24.48 
 
 
133 aa  49.7  0.00006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.194252  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3843  hypothetical protein  30.37 
 
 
174 aa  48.1  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.173317 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1325  AIG2 family protein  36.67 
 
 
140 aa  47.8  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3911  AIG2 family protein  26.85 
 
 
152 aa  47.8  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.195524  normal  0.21706 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4571  AIG2 family protein  56.25 
 
 
124 aa  47.8  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0717618 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1863  hypothetical protein  31.11 
 
 
174 aa  47.8  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.378526  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2442  hypothetical protein  31.9 
 
 
163 aa  47  0.0004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.170561  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1390  hypothetical protein  32.08 
 
 
185 aa  46.6  0.0006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.174418  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1259  hypothetical protein  31.21 
 
 
177 aa  46.2  0.0007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.345549  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0180  hypothetical protein  31.03 
 
 
130 aa  46.2  0.0007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0195719  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48950  Fe-only nitrogenase accessory protein AnfR  29.82 
 
 
183 aa  45.4  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.281704  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0302  hypothetical protein  34.48 
 
 
132 aa  44.3  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.285091  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2410  hypothetical protein  30.71 
 
 
175 aa  43.9  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2771  AIG2 family protein  29.86 
 
 
494 aa  43.5  0.004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1208  hypothetical protein  30.71 
 
 
188 aa  43.9  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.492004  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3977  hypothetical protein  27.82 
 
 
135 aa  43.9  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.814433  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1249  hypothetical protein  34.44 
 
 
153 aa  43.1  0.007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4442  hypothetical protein  28.78 
 
 
197 aa  43.1  0.007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0834958  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1133  hypothetical protein  30.22 
 
 
156 aa  42.7  0.009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>