40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_4071 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_4071  Spermine synthase  100 
 
 		 1244 aa  2509    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0773201  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2502  spermine/spermidine synthase family protein  30.21 
 
 		 1017 aa  72  0.00000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2836  spermidine synthase  30.67 
 
 		 287 aa  58.5  0.0000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1016  spermidine synthase  31.1 
 
 		 287 aa  57.8  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1296  putative spermine/spermidine synthase family protein  26.58 
 
 		 875 aa  55.8  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3129  spermidine synthase  27.8 
 
 		 287 aa  55.1  0.000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4001  spermidine synthase  27.54 
 
 		 287 aa  55.1  0.000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3482  spermidine synthase  29.45 
 
 		 296 aa  53.9  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00378102  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3354  spermidine synthase  29.45 
 
 		 296 aa  53.9  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000276507  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1023  spermidine synthase  29.45 
 
 		 296 aa  53.9  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1825  spermine synthase  25.13 
 
 		 991 aa  52.4  0.00005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3054  spermidine synthase  27.61 
 
 		 283 aa  52.4  0.00005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0114  spermidine synthase  30.49 
 
 		 288 aa  51.6  0.00009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000001847  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1180  methyltransferase small  32.54 
 
 		 252 aa  51.6  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3602  hypothetical protein  32.54 
 
 		 248 aa  51.6  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.924537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0488  spermidine synthase  25.57 
 
 		 277 aa  51.6  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000641505  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1127  methyltransferase family protein  32.54 
 
 		 248 aa  51.6  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0669  spermidine synthase  29.88 
 
 		 289 aa  49.7  0.0003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000146027  normal  0.395519 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0125  spermidine synthase  29.88 
 
 		 288 aa  49.3  0.0005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000567912  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3481  spermidine synthase  29.88 
 
 		 288 aa  49.3  0.0005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00013489  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00119  hypothetical protein  29.88 
 
 		 288 aa  49.3  0.0005  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00179737  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0128  spermidine synthase  29.88 
 
 		 288 aa  49.3  0.0005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000545109  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0131  spermidine synthase  29.88 
 
 		 288 aa  49.3  0.0005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.316229  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3538  spermidine synthase  29.88 
 
 		 288 aa  49.3  0.0005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00580941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0123  spermidine synthase  29.88 
 
 		 288 aa  49.3  0.0005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.705101  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00120  spermidine synthase  29.88 
 
 		 288 aa  49.3  0.0005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00387054  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3160  Spermine synthase  26.32 
 
 		 982 aa  48.9  0.0007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.687582  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0517  spermine synthase  27.33 
 
 		 836 aa  48.5  0.0008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3618  spermine synthase  23.72 
 
 		 835 aa  48.5  0.0009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0277  spermidine synthase  26.7 
 
 		 296 aa  48.1  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.173175  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1326  spermidine synthase  24 
 
 		 295 aa  48.1  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0182  spermidine synthase  31.52 
 
 		 286 aa  47  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0190  spermidine synthase  31.52 
 
 		 286 aa  47  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.241142  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0185  spermidine synthase  31.52 
 
 		 286 aa  47  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.506874 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0198  spermidine synthase  31.52 
 
 		 286 aa  47  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0181  spermidine synthase  31.52 
 
 		 286 aa  47  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0275  spermidine synthase  27.68 
 
 		 293 aa  47.4  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0154876  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_55177  spermine/spermidine synthase  25.7 
 
 		 299 aa  46.6  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0570  spermidine synthase  26.7 
 
 		 302 aa  45.8  0.005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.758892  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23820  spermidine synthase  31.5 
 
 		 286 aa  45.1  0.008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>