23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_2434 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_2434  5'-nucleotidase/2' 3'-cyclic phosphodiesterase-like esterase  100 
 
 		 590 aa  1226    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.189389  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2482  hypothetical protein  22.39 
 
 		 561 aa  79  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.995863  normal  0.0219779 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1622  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  32.54 
 
 		 974 aa  79.3  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2950  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  31.4 
 
 		 821 aa  72.4  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0877418  normal  0.740521 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0894  cytochrome c-554 precursor  32.65 
 
 		 240 aa  67  0.0000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.308781  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2262  cytochrome c family protein  26.97 
 
 		 148 aa  61.2  0.00000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0249  cytochrome c family protein  29.86 
 
 		 155 aa  60.8  0.00000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00000623647  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2660  cytochrome c-554 precursor  27.07 
 
 		 235 aa  59.3  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.721726  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1084  cytochrome c-554 precursor  27.07 
 
 		 235 aa  59.3  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1384  hypothetical protein  28.29 
 
 		 192 aa  59.3  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0803  cytochrome c-554 precursor  27.07 
 
 		 235 aa  59.3  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2062  cytochrome c family protein  28.67 
 
 		 179 aa  58.2  0.0000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.198068 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2775  hypothetical protein  27.66 
 
 		 174 aa  52  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.148265  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5591  hypothetical protein  28.04 
 
 		 171 aa  51.6  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.465628  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2858  cytochrome c family protein  29.31 
 
 		 153 aa  50.8  0.00006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000201551  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2682  hypothetical protein  27.59 
 
 		 181 aa  50.4  0.00009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2711  cytochrome c family protein  25.45 
 
 		 156 aa  49.7  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.392635 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2868  hypothetical protein  27.66 
 
 		 178 aa  49.3  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3600  hypothetical protein  31.13 
 
 		 556 aa  47.8  0.0006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4154  5'-nucleotidase domain-containing protein  25.9 
 
 		 564 aa  47.8  0.0006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.958295 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2582  cytochrome c-554 precursor  25.17 
 
 		 236 aa  47.8  0.0006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.579805  normal  0.362535 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0870  phosphatase/nucleotidase  21.49 
 
 		 632 aa  46.6  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0599439  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2918  hypothetical protein  27.35 
 
 		 469 aa  43.5  0.01  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>