47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_1397 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_1397  hypothetical protein  100 
 
 		 253 aa  517  1e-146  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3606  hypothetical protein  28.28 
 
 		 206 aa  66.6  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.20256  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1483  TPR repeat-containing protein  28.44 
 
 		 221 aa  50.8  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0494  lipoprotein NlpI  27.27 
 
 		 294 aa  50.1  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0212481  normal  0.630766 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_38662  predicted protein  24.73 
 
 		 248 aa  49.3  0.00005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_86822  predicted protein  28.95 
 
 		 202 aa  49.3  0.00006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.836197 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3725  lipoprotein NlpI  26.7 
 
 		 294 aa  48.5  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.38632  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4000  lipoprotein NlpI  26.7 
 
 		 294 aa  48.5  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.825215  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3591  lipoprotein NlpI  26.7 
 
 		 294 aa  48.5  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1811  TPR repeat-containing protein  30.77 
 
 		 523 aa  47  0.0003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1517  hypothetical protein  37.14 
 
 		 382 aa  47  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0196221  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2106  hypothetical protein  22.22 
 
 		 206 aa  47  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.415163  normal  0.123582 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0813  lipoprotein NlpI  27.12 
 
 		 294 aa  46.6  0.0004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.119731  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1552  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  26.51 
 
 		 707 aa  45.8  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0225548 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2135  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34 
 
 		 373 aa  46.2  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.204203  normal  0.945333 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3468  lipoprotein NlpI  26.23 
 
 		 294 aa  45.4  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3636  lipoprotein NlpI  26.23 
 
 		 294 aa  45.4  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3468  lipoprotein NlpI  26.23 
 
 		 294 aa  45.4  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  24.51 
 
 		 1421 aa  45.1  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3574  lipoprotein NlpI  26.23 
 
 		 294 aa  45.4  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3537  lipoprotein NlpI  26.23 
 
 		 294 aa  45.4  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0299  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 458 aa  44.7  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4726  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  27.5 
 
 		 730 aa  44.3  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4508  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.11 
 
 		 836 aa  43.9  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.885776 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2752  TPR repeat-containing protein  34.88 
 
 		 556 aa  43.5  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0761228  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3460  lipoprotein NlpI  26.26 
 
 		 294 aa  43.5  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.820056  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28641  hypothetical protein  38.6 
 
 		 581 aa  43.5  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0590  lipoprotein NlpI  26.55 
 
 		 294 aa  43.1  0.004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.573815  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1000  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.5 
 
 		 219 aa  43.5  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.810235  normal  0.0608831 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02981  hypothetical protein  26.67 
 
 		 294 aa  42.7  0.005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2953  TPR repeat-containing protein  22.7 
 
 		 270 aa  43.1  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.162734 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 465 aa  42.7  0.005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0542  TPR repeat-containing protein  26.67 
 
 		 294 aa  42.7  0.005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.622793  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4482  lipoprotein NlpI  26.67 
 
 		 294 aa  42.7  0.005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3459  lipoprotein NlpI  26.67 
 
 		 294 aa  42.7  0.005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.354036 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0535  lipoprotein NlpI  26.67 
 
 		 294 aa  42.7  0.005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00317241 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3645  lipoprotein NlpI  26.67 
 
 		 294 aa  42.7  0.005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3355  lipoprotein NlpI  26.67 
 
 		 294 aa  42.7  0.005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  32.84 
 
 		 4079 aa  42.7  0.005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0464  TPR repeat-containing protein  24.71 
 
 		 205 aa  42.7  0.005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03030  hypothetical protein  26.67 
 
 		 294 aa  42.7  0.005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3608  lipoprotein NlpI  26.67 
 
 		 294 aa  42.7  0.006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3165  TPR repeat-containing protein  22.7 
 
 		 270 aa  42.4  0.007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2034  TPR repeat-containing protein  34.72 
 
 		 416 aa  42.4  0.007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4554  TPR repeat-containing protein  32.43 
 
 		 547 aa  42.4  0.008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.196541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00051  TPR-repeat pilus assembly protein TadD  29.41 
 
 		 276 aa  42  0.009  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_36889  predicted protein  29.58 
 
 		 209 aa  42  0.01  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00688126  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>