More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_1311 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_1311  glycosyl transferase family 2  100 
 
 
261 aa  539  9.999999999999999e-153  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2408  glycosyl transferase family 2  34.83 
 
 
293 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1821  glycosyl transferase family protein  35.32 
 
 
237 aa  112  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3051  glycosyl transferase family protein  36.28 
 
 
245 aa  113  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1061  glycosyl transferase family 2  33.99 
 
 
448 aa  112  4.0000000000000004e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0165  glycosyl transferase family protein  30.69 
 
 
321 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000128177 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14090  glycosyl transferase  30.65 
 
 
264 aa  110  3e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0593643  normal  0.606755 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3149  glycosyl transferase family 2  35.81 
 
 
245 aa  110  3e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.754874  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12000  glycosyl transferase  33.19 
 
 
243 aa  109  5e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.2509  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0087  glycosyl transferase family 2  37.64 
 
 
450 aa  109  6e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3250  glycosyl transferase family 2  35.35 
 
 
245 aa  109  6e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0680662  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2350  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  33.8 
 
 
248 aa  108  8.000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000669631  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2396  glycosyl transferase family protein  32.83 
 
 
313 aa  107  2e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2187  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  32.43 
 
 
246 aa  107  3e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.117888  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1930  glycosyl transferase family 2  31.98 
 
 
246 aa  105  5e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000462816 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2271  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  32.73 
 
 
305 aa  105  5e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00000405527  hitchhiker  0.00229126 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1807  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  30.18 
 
 
248 aa  103  3e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0245  glycosyl transferase, group 2 family protein  35.42 
 
 
220 aa  103  4e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1230  glycosyl transferase family 2  32.56 
 
 
340 aa  103  4e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4174  apolipoprotein N-acyltransferase  31.67 
 
 
883 aa  100  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0124093  normal  0.508891 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2933  glycosyl transferase family 2  31.58 
 
 
355 aa  100  2e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.175593 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0480  glycosyl transferase family 2  30.2 
 
 
377 aa  100  3e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0370888  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2389  glycosyl transferase family protein  33.03 
 
 
262 aa  100  3e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0758603  hitchhiker  0.000219352 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1872  glycosyl transferase family 2  30.92 
 
 
401 aa  99.8  4e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.803329  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5816  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  30.18 
 
 
247 aa  99.8  4e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.395639  normal  0.643607 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2270  glycosyl transferase family protein  33.03 
 
 
262 aa  99.4  5e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0541256  normal  0.0615323 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03835  dolichyl-phosphate mannose synthase-like protein  29.13 
 
 
397 aa  99.4  6e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.125771  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1211  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  31.72 
 
 
257 aa  98.6  8e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.13175  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1132  dolichol-phosphate mannosyltransferase  33.5 
 
 
299 aa  97.8  1e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5318  glycosyl transferase family 2  28.96 
 
 
246 aa  98.2  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.583889  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0903  hypothetical protein  32.32 
 
 
291 aa  98.2  1e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0767729 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3118  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  31.25 
 
 
262 aa  98.6  1e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00360955  normal 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5098  glycosyl transferase family protein  30.29 
 
 
336 aa  97.4  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2209  glycosyl transferase family 2  32.64 
 
 
220 aa  97.8  2e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2109  b-glycosyltransferase  30 
 
 
400 aa  97.1  2e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0591091  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2302  glycosyl transferase family protein  34.12 
 
 
287 aa  97.1  2e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3793  glycosyl transferase family protein  34.83 
 
 
237 aa  96.7  4e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1630  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  28.83 
 
 
253 aa  94.7  1e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2228  glycosyl transferase family protein  34.5 
 
 
229 aa  95.1  1e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000017115 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0328  glycosyl transferase family 2  30.8 
 
 
270 aa  95.1  1e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.127312 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1686  glycosyl transferase family protein  29.44 
 
 
220 aa  94.4  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000734571  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8172  glycosyl transferase family 2  31.48 
 
 
228 aa  94  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8176  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  28.51 
 
 
809 aa  94  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21780  glycosyl transferase  32.74 
 
 
261 aa  93.2  4e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.229815  normal  0.622988 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3402  glycosyl transferase family 2  29.96 
 
 
263 aa  92.8  5e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.181539  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0400  glycosyl transferase family protein  30.3 
 
 
344 aa  92.4  6e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.156434  normal  0.0492083 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2588  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  30.62 
 
 
245 aa  92.4  6e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0786175 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2413  glycosyl transferase family 2  33.91 
 
 
243 aa  92.4  7e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.367693 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2932  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  31.03 
 
 
264 aa  92  9e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000763611  hitchhiker  0.000488065 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0487  glycosyl transferase family 2  30.92 
 
 
284 aa  90.9  2e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2785  glycosyl transferase family 2  31.82 
 
 
272 aa  90.9  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.115772 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0535  glycosyl transferase family protein  27.73 
 
 
321 aa  90.9  2e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2503  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  30.7 
 
 
265 aa  90.9  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.149147  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2548  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  30.7 
 
 
265 aa  90.9  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.436299  normal  0.822465 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2540  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  30.7 
 
 
265 aa  90.9  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.178137  normal  0.648342 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0602  glycosyl transferase family 2  30 
 
 
233 aa  90.5  3e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2355  glycosyl transferase family 2  36.42 
 
 
250 aa  90.5  3e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.024577  hitchhiker  0.0000348766 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2240  glycosyl transferase family 2  33.17 
 
 
226 aa  89.4  6e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0220  glycosyl transferase family 2  30.23 
 
 
353 aa  89  8e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0922  glycosyl transferase family protein  32.84 
 
 
284 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2065  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  29.87 
 
 
262 aa  87.8  1e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0342924 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2653  glycosyltransferase  31.05 
 
 
389 aa  88.6  1e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08600  glycosyl transferase  32.08 
 
 
225 aa  88.2  1e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.36917 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1077  glycosyl transferase family protein  30.5 
 
 
298 aa  88.6  1e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.273313  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1604  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  30.29 
 
 
281 aa  88.6  1e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.623354  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1366  glycosyl transferase family protein  24.62 
 
 
228 aa  87  2e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000927738 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8187  glycosyl transferase family 2  38.27 
 
 
233 aa  87.4  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0488  glycosyl transferase family protein  32.14 
 
 
362 aa  87.4  2e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.814661  hitchhiker  0.0000013139 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2592  glycosyl transferase family 2  30.7 
 
 
235 aa  87.4  2e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1079  glycosyl transferase family protein  25.84 
 
 
395 aa  87  3e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0581  glycosyl transferase family protein  24.62 
 
 
228 aa  87  3e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.529493  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0921  glycosyl transferase family protein  28.46 
 
 
399 aa  87  3e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3099  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
232 aa  86.7  4e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000071788  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1789  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.33 
 
 
239 aa  86.3  5e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1142  dolichyl-phosphate mannose synthase related protein  28.92 
 
 
321 aa  86.3  5e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2200  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  29.28 
 
 
252 aa  85.9  7e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.562364  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2667  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  31.75 
 
 
257 aa  85.5  8e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.454423  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1984  glycosyl transferase family 2  30.58 
 
 
386 aa  85.1  9e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2133  glycosyl transferase family 2  32.73 
 
 
340 aa  85.5  9e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0441778  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18470  glycosyl transferase  32 
 
 
257 aa  84.7  0.000000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.41459 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0221  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  27.62 
 
 
260 aa  84.7  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.746242  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1276  glycosyl transferase family 2  28.91 
 
 
246 aa  84.3  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0381743  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3616  glycosyl transferase family protein  29.41 
 
 
222 aa  84.3  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00297369  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20890  glycosyl transferase  30.66 
 
 
239 aa  83.2  0.000000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0571  glycosyltransferase ycbB  28.84 
 
 
234 aa  83.2  0.000000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.50645  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0396  glycosyl transferase family protein  26.29 
 
 
229 aa  83.2  0.000000000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.54121  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1562  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  29.96 
 
 
258 aa  83.2  0.000000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13662  glycosyltransferase  29.36 
 
 
237 aa  82.8  0.000000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0122731 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3007  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  28.91 
 
 
246 aa  82.4  0.000000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0582425 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0734  glycosyl transferase family protein  27.62 
 
 
230 aa  82  0.000000000000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0939265  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0307  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  25.52 
 
 
248 aa  82  0.000000000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000766431 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1870  glycosyl transferase family protein  28.44 
 
 
246 aa  82  0.000000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00880451  normal  0.0336485 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2422  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  26.54 
 
 
244 aa  82  0.000000000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000393147  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1850  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  29.24 
 
 
258 aa  81.3  0.00000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.492055  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1007  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  29.17 
 
 
238 aa  81.3  0.00000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000779145  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4051  glycosyl transferase family 2  32.08 
 
 
251 aa  81.3  0.00000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1305  glycosyl transferase family protein  25.98 
 
 
229 aa  81.3  0.00000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0985  cell wall biogenesis glycosyltransferase  26.25 
 
 
247 aa  81.3  0.00000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1295  glycosyl transferase family 2  26.17 
 
 
269 aa  80.9  0.00000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0483  hypothetical protein  26.82 
 
 
247 aa  80.9  0.00000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>