241 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_0856 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_0856  ribosomal protein S20  100 
 
 		 104 aa  201  3e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.819382  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12880  ribosomal protein S20  41.57 
 
 		 87 aa  63.9  0.0000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  4.40535e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4233  ribosomal protein S20  44.57 
 
 		 87 aa  63.9  0.0000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000543427  hitchhiker  0.000000915309 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1013  30S ribosomal protein S20  44.09 
 
 		 88 aa  60.8  0.000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000773203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1191  30S ribosomal protein S20  45.16 
 
 		 88 aa  60.1  0.000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000303326  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1056  30S ribosomal protein S20  45.16 
 
 		 88 aa  59.7  0.00000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.134446  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40720  30S ribosomal protein S20  41.76 
 
 		 91 aa  59.7  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0849  SSU ribosomal protein S20P  42.53 
 
 		 88 aa  60.1  0.00000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2446  30S ribosomal protein S20  40.86 
 
 		 89 aa  59.7  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000240091  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1005  30S ribosomal protein S20  42.05 
 
 		 89 aa  60.1  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2678  30S ribosomal protein S20  44.09 
 
 		 88 aa  59.3  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.855392  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2960  30S ribosomal protein S20  45.16 
 
 		 88 aa  58.9  0.00000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000020022  normal  0.711019 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3042  30S ribosomal protein S20  45.16 
 
 		 88 aa  58.9  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000000711095  normal  0.679659 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3140  30S ribosomal protein S20  45.16 
 
 		 88 aa  58.9  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000322066  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1179  ribosomal protein S20  43.96 
 
 		 86 aa  58.5  0.00000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1295  ribosomal protein S20  38.54 
 
 		 89 aa  58.5  0.00000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.312929  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0950  30S ribosomal protein S20  40.21 
 
 		 92 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.466719 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1039  ribosomal protein S20  39.56 
 
 		 115 aa  58.5  0.00000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000000562255  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0921  30S ribosomal protein S20  46.24 
 
 		 88 aa  58.2  0.00000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000253205  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0947  30S ribosomal protein S20  43.01 
 
 		 88 aa  58.2  0.00000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000396831  normal  0.19884 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1118  30S ribosomal protein S20  44.09 
 
 		 88 aa  57.8  0.00000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000000408096  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3238  30S ribosomal protein S20  44.09 
 
 		 88 aa  57.8  0.00000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000254037  normal  0.534831 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1152  30S ribosomal protein S20  44.09 
 
 		 88 aa  57.8  0.00000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000294185  normal  0.185993 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1037  ribosomal protein S20  41.49 
 
 		 87 aa  57.8  0.00000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2211  30S ribosomal protein S20  43.48 
 
 		 87 aa  57.8  0.00000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.829407  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1051  30S ribosomal protein S20  44.09 
 
 		 88 aa  57.8  0.00000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000000204572  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1096  30S ribosomal protein S20  44.09 
 
 		 88 aa  57.8  0.00000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000700681  normal  0.0325702 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0492  ribosomal protein S20  43.48 
 
 		 87 aa  57.4  0.00000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.131868  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3537  30S ribosomal protein S20  44.09 
 
 		 88 aa  56.6  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4855  30S ribosomal protein S20  39.29 
 
 		 90 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1176  SSU ribosomal protein S20P  36.36 
 
 		 88 aa  56.2  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.150472  hitchhiker  0.00109182 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2893  30S ribosomal protein S20  41.94 
 
 		 88 aa  55.8  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.204979  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60400  30S ribosomal protein S20  38.1 
 
 		 91 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000503412 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1979  ribosomal protein S20  40 
 
 		 85 aa  55.5  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000000176977  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4455  30S ribosomal protein S20  42.47 
 
 		 85 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000115322  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4403  30S ribosomal protein S20  42.47 
 
 		 85 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4221  30S ribosomal protein S20  42.47 
 
 		 85 aa  55.1  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000214767  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4059  30S ribosomal protein S20  42.47 
 
 		 85 aa  55.1  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.2501  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4069  30S ribosomal protein S20  42.47 
 
 		 85 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00157919  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4441  30S ribosomal protein S20  42.47 
 
 		 85 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000591712  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4547  30S ribosomal protein S20  42.47 
 
 		 85 aa  55.1  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4344  30S ribosomal protein S20  42.47 
 
 		 85 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000153456 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1843  ribosomal protein S20  44.05 
 
 		 88 aa  55.1  0.0000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3049  30S ribosomal protein S20  42.47 
 
 		 85 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0287118  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2250  30S ribosomal protein S20  42.27 
 
 		 92 aa  54.7  0.0000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.375022  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2181  30S ribosomal protein S20  45.65 
 
 		 97 aa  54.7  0.0000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.752642  normal  0.564535 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0947  ribosomal protein S20  44.71 
 
 		 97 aa  55.1  0.0000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.351712 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2575  30S ribosomal protein S20  39.08 
 
 		 90 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.931195 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0795  30S ribosomal protein S20  41.1 
 
 		 85 aa  53.9  0.0000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.111102  hitchhiker  0.0000000000117943 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1939  30S ribosomal protein S20  39.08 
 
 		 90 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2470  30S ribosomal protein S20  39.08 
 
 		 90 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0125567 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2600  30S ribosomal protein S20  39.08 
 
 		 90 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2972  30S ribosomal protein S20  39.76 
 
 		 94 aa  53.9  0.0000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000017573 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2551  30S ribosomal protein S20  39.08 
 
 		 90 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2005  ribosomal protein S20  39.47 
 
 		 95 aa  53.5  0.0000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.894621  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1667  30S ribosomal protein S20  38.04 
 
 		 88 aa  53.1  0.000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00940932  normal  0.076211 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0416  30S ribosomal protein S20  41.76 
 
 		 87 aa  52.8  0.000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000443906  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4173  30S ribosomal protein S20  41.1 
 
 		 85 aa  53.1  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0124088  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0745  30S ribosomal protein S20  39.08 
 
 		 90 aa  53.1  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.426088 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0600  30S ribosomal protein S20  37.11 
 
 		 92 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.218047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0641  30S ribosomal protein S20  37.11 
 
 		 92 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.647122  normal  0.196215 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0802  ribosomal protein S20  37.11 
 
 		 92 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0377  30S ribosomal protein S20  38.54 
 
 		 92 aa  52.4  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0707  30S ribosomal protein S20  37.11 
 
 		 92 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1487  30S ribosomal protein S20  37.93 
 
 		 88 aa  52.4  0.000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.422821  normal  0.27879 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1075  30S ribosomal protein S20  38.54 
 
 		 92 aa  52.4  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5883  30S ribosomal protein S20  39.08 
 
 		 90 aa  52.8  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.666229 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0735  30S ribosomal protein S20  38.54 
 
 		 92 aa  52.4  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0646  30S ribosomal protein S20  37.11 
 
 		 92 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0571699 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2726  30S ribosomal protein S20  45.16 
 
 		 88 aa  52.8  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000316732  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1576  ribosomal protein S20  41.25 
 
 		 89 aa  52.4  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4562  30S ribosomal protein S20  37.11 
 
 		 92 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.251807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0696  ribosomal protein S20  41.11 
 
 		 86 aa  52.4  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000000207001  normal  0.0299142 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0677  30S ribosomal protein S20  38.54 
 
 		 92 aa  52.4  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3027  30S ribosomal protein S20  45.35 
 
 		 97 aa  52.4  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.865381  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2512  30S ribosomal protein S20  38.54 
 
 		 92 aa  52.4  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0919  30S ribosomal protein S20  38.54 
 
 		 92 aa  52.4  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.459642  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0923  30S ribosomal protein S20  38.54 
 
 		 92 aa  52.4  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0126  30S ribosomal protein S20  38.54 
 
 		 92 aa  52.4  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0211  30S ribosomal protein S20  40.91 
 
 		 86 aa  52.4  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000112504  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0577  30S ribosomal protein S20  42.86 
 
 		 86 aa  51.6  0.000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.00000729927  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004422  SSU ribosomal protein S20p  43.37 
 
 		 86 aa  51.6  0.000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000816133  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2090  30S ribosomal protein S20  32.32 
 
 		 94 aa  51.6  0.000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000134662  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3510  30S ribosomal protein S20  35.96 
 
 		 86 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3582  30S ribosomal protein S20  35.96 
 
 		 86 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.179695  normal  0.0144899 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3009  30S ribosomal protein S20  40.2 
 
 		 106 aa  51.6  0.000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3522  30S ribosomal protein S20  35.96 
 
 		 86 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.824464  normal  0.131692 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2556  30S ribosomal protein S20  39.78 
 
 		 88 aa  51.2  0.000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0548445  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2122  30S ribosomal protein S20  44.68 
 
 		 100 aa  51.2  0.000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00639471  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5467  30S ribosomal protein S20  37.04 
 
 		 88 aa  50.8  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0531  30S ribosomal protein S20  37.5 
 
 		 92 aa  50.8  0.000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1288  30S ribosomal protein S20  44.09 
 
 		 88 aa  50.8  0.000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000000699661  normal  0.326601 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1581  30S ribosomal protein S20  40.23 
 
 		 109 aa  50.4  0.000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1524  30S ribosomal protein S20  40.23 
 
 		 109 aa  50.4  0.000009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2105  30S ribosomal protein S20  42.65 
 
 		 107 aa  50.1  0.000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1777  30S ribosomal protein S20  40.96 
 
 		 99 aa  50.4  0.000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2765  30S ribosomal protein S20  39.78 
 
 		 88 aa  49.7  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1854  SSU ribosomal protein S20P  39.08 
 
 		 87 aa  49.7  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.997447 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5203  30S ribosomal protein S20  38.1 
 
 		 91 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.614694  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0546  30S ribosomal protein S20  38.64 
 
 		 87 aa  50.1  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>