More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1979 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_1979  propionyl-CoA carboxylase  100 
 
 		 518 aa  1045    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.660708  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3097  propionyl-CoA carboxylase  49.12 
 
 		 518 aa  462  1e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.079837 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3945  Propionyl-CoA carboxylase  47.14 
 
 		 519 aa  443  1e-123  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3891  propionyl-CoA carboxylase  44.29 
 
 		 533 aa  433  1e-120  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3573  putative methylmalonyl-CoA decarboxylase alpha chain  46.74 
 
 		 519 aa  432  1e-120  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.784997 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3419  Propionyl-CoA carboxylase  44.44 
 
 		 515 aa  424  1e-117  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1099  propionyl-CoA carboxylase  45.49 
 
 		 515 aa  419  1e-116  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2593  propionyl-CoA carboxylase  43.39 
 
 		 505 aa  408  1.0000000000000001e-112  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0831  propionyl-CoA carboxylase  44.36 
 
 		 514 aa  406  1.0000000000000001e-112  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.566084  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1854  propionyl-CoA carboxylase  43.31 
 
 		 505 aa  401  9.999999999999999e-111  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.587297 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2536  carboxyl transferase  34.94 
 
 		 531 aa  292  1e-77  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.449472 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1593  Propionyl-CoA carboxylase  35.24 
 
 		 525 aa  291  3e-77  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1363  carboxyl transferase  34.39 
 
 		 508 aa  282  1e-74  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00300636  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2281  carboxyl transferase  35.11 
 
 		 531 aa  280  4e-74  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0966059  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1735  carboxyl transferase  33.72 
 
 		 516 aa  279  7e-74  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1612  methylmalonyl-CoA decarboxylase, alpha subunit  32.44 
 
 		 517 aa  276  4e-73  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0699  carboxyl transferase  31.81 
 
 		 516 aa  274  2.0000000000000002e-72  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1489  carboxyl transferase  32.54 
 
 		 518 aa  272  8.000000000000001e-72  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.810044  normal  0.0441726 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1738  carboxyl transferase  31.84 
 
 		 516 aa  271  2e-71  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5659  carboxyl transferase  33.47 
 
 		 510 aa  270  5.9999999999999995e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0272  carboxyl transferase  31.2 
 
 		 515 aa  269  1e-70  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00889461 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2573  carboxyl transferase  33.59 
 
 		 516 aa  269  1e-70  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.455501 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4697  carboxyl transferase  31.85 
 
 		 528 aa  268  1e-70  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.584075 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0797  carboxyl transferase  31.9 
 
 		 516 aa  268  2e-70  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000527493  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4130  carboxyl transferase  33.27 
 
 		 530 aa  267  4e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3811  carboxyl transferase  33.53 
 
 		 510 aa  266  5.999999999999999e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1156  carboxyl transferase  34.89 
 
 		 517 aa  265  1e-69  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000234749  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5528  carboxyl transferase  32.94 
 
 		 522 aa  265  1e-69  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2466  carboxyl transferase  34.39 
 
 		 550 aa  265  2e-69  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2974  carboxyl transferase  33.47 
 
 		 515 aa  264  3e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0553  carboxyl transferase  31.76 
 
 		 518 aa  263  4e-69  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.965666  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0326  carboxyl transferase  33.6 
 
 		 510 aa  263  4e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.274906  normal  0.0697048 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2835  carboxyl transferase  33.14 
 
 		 510 aa  263  4e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.497575  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0282  carboxyl transferase  33.6 
 
 		 510 aa  263  4.999999999999999e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3092  carboxyl transferase  33.53 
 
 		 516 aa  263  4.999999999999999e-69  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.391297  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1431  propionyl-CoA carboxylase beta chain  32.16 
 
 		 513 aa  263  6e-69  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1759  carboxyl transferase  31.4 
 
 		 514 aa  263  6e-69  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0358  carboxyl transferase  33.4 
 
 		 510 aa  263  6.999999999999999e-69  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4725  carboxyl transferase  32.94 
 
 		 510 aa  263  8e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.48705  normal  0.0648736 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0944  propionyl-CoA carboxylase  32.62 
 
 		 516 aa  262  8.999999999999999e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5510  carboxyl transferase  34.2 
 
 		 510 aa  262  1e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0268  carboxyl transferase  32.36 
 
 		 523 aa  261  2e-68  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0379  carboxyl transferase  33.27 
 
 		 514 aa  261  2e-68  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.184287  normal  0.887348 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2019  propionyl-CoA carboxylase  35.38 
 
 		 498 aa  261  3e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.818563 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0231  carboxyl transferase  33.94 
 
 		 518 aa  260  4e-68  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.810852  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0585  carboxyl transferase  32.4 
 
 		 512 aa  260  4e-68  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4102  carboxyl transferase  33.54 
 
 		 516 aa  259  6e-68  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.09097  normal  0.079173 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0802  carboxyl transferase  33.59 
 
 		 527 aa  258  2e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000659561 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3166  carboxyl transferase  33.27 
 
 		 521 aa  258  2e-67  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0567033  normal  0.702037 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3941  carboxyl transferase  34.7 
 
 		 536 aa  258  2e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0385716  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0156  carboxyl transferase  32.03 
 
 		 513 aa  257  4e-67  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.344953  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0856  carboxyl transferase  33.4 
 
 		 527 aa  257  4e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0690985  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2974  carboxyl transferase  32.09 
 
 		 519 aa  257  4e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3618  carboxyl transferase  32.87 
 
 		 510 aa  256  5e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.207692  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1223  carboxyl transferase  31.84 
 
 		 517 aa  256  6e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00883657  normal  0.269344 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1317  carboxyl transferase  33.2 
 
 		 512 aa  256  6e-67  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2082  carboxyl transferase  32.86 
 
 		 510 aa  256  7e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.122916  normal  0.0739179 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0212  carboxyl transferase  32.95 
 
 		 515 aa  256  8e-67  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1877  propionyl-CoA carboxylase  32.19 
 
 		 510 aa  256  8e-67  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3397  carboxyl transferase  31.84 
 
 		 510 aa  256  9e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.14611 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0214  carboxyl transferase  32.76 
 
 		 515 aa  256  9e-67  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11343  propionlyl-CoA carboxylase  30.83 
 
 		 513 aa  256  1.0000000000000001e-66  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2999  carboxyl transferase  33.67 
 
 		 510 aa  256  1.0000000000000001e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1632  carboxyl transferase  31.89 
 
 		 522 aa  255  2.0000000000000002e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.605341 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1880  carboxyl transferase  32.86 
 
 		 510 aa  255  2.0000000000000002e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0295366 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3541  carboxyl transferase  34.26 
 
 		 514 aa  255  2.0000000000000002e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6937  propionyl-CoA carboxylase beta subunit  34.51 
 
 		 559 aa  255  2.0000000000000002e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.100753  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3787  Propionyl-CoA carboxylase  32.68 
 
 		 510 aa  254  3e-66  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.274179 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1215  methylmalonyl-CoA decarboxylase alpha chain  34.04 
 
 		 519 aa  253  6e-66  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.336846  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2342  carboxyl transferase  32.73 
 
 		 510 aa  253  7e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.150986  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0260  carboxyl transferase  34.24 
 
 		 519 aa  252  9.000000000000001e-66  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3755  carboxyl transferase  32.28 
 
 		 510 aa  252  1e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0296123  normal  0.253409 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0792  carboxyl transferase  33.4 
 
 		 524 aa  252  1e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.224802  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5680  propionyl-CoA carboxylase  32.54 
 
 		 510 aa  252  1e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3122  carboxyl transferase  33.13 
 
 		 510 aa  252  1e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.629263  normal  0.624995 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3025  carboxyl transferase  31.97 
 
 		 532 aa  252  1e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.432014 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1621  Propionyl-CoA carboxylase  31.91 
 
 		 513 aa  252  1e-65  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0889  carboxyl transferase  31.37 
 
 		 564 aa  251  2e-65  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1401  carboxyl transferase  32.73 
 
 		 510 aa  251  2e-65  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0947587  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2907  propionyl-CoA carboxylase  31.7 
 
 		 514 aa  251  2e-65  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0700  carboxyl transferase  32.56 
 
 		 529 aa  251  2e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3291  carboxyl transferase  34.22 
 
 		 516 aa  251  2e-65  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0262589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0271  carboxyl transferase  33.53 
 
 		 520 aa  251  2e-65  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.435103  normal  0.1429 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5024  putative propionyl-CoA carboxylase beta chain  31.57 
 
 		 510 aa  251  2e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.541202 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0271  Propionyl-CoA carboxylase  34.24 
 
 		 519 aa  250  3e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.846145  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1016  propionyl-CoA carboxylase beta subunit  31.56 
 
 		 510 aa  251  3e-65  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0250  carboxyl transferase  33.73 
 
 		 519 aa  250  4e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.135558  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1316  carboxyl transferase  31.23 
 
 		 514 aa  250  4e-65  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0447  acyl CoA biotin-dependant carboxyltransferase  30.99 
 
 		 516 aa  250  5e-65  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_389  acyl-CoA biotin-dependant carboxyltransferase  30.99 
 
 		 516 aa  250  5e-65  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.839187  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1579  carboxyl transferase  31.92 
 
 		 523 aa  249  8e-65  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0377813  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4004  carboxyl transferase  31.23 
 
 		 511 aa  249  9e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.680854 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2513  carboxyl transferase  30.97 
 
 		 510 aa  249  9e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.152871  normal  0.332227 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1248  carboxyl transferase  32.11 
 
 		 522 aa  249  1e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0947  carboxyl transferase  31.15 
 
 		 513 aa  249  1e-64  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.592853  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0424  carboxyl transferase  30.41 
 
 		 516 aa  248  2e-64  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2555  propionyl-CoA carboxylase complex B subunit  33.01 
 
 		 534 aa  247  3e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.117382  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0053  carboxyl transferase  33.53 
 
 		 510 aa  247  3e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3484  carboxyl transferase  32.19 
 
 		 510 aa  247  3e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0291  carboxyl transferase  31.55 
 
 		 519 aa  247  3e-64  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>