48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1467 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_1467  hypothetical protein  100 
 
 		 274 aa  564  1e-160  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3399  hypothetical protein  48.53 
 
 		 274 aa  265  8e-70  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.402196  normal  0.952996 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1228  hypothetical protein  49.45 
 
 		 269 aa  251  7e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1425  hypothetical protein  39.52 
 
 		 279 aa  120  3e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00131203  normal  0.0265706 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3313  hypothetical protein  39.51 
 
 		 275 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.244966  normal  0.831581 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0646  hypothetical protein  39.51 
 
 		 275 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.27253 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0733  hypothetical protein  38.89 
 
 		 277 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2377  hypothetical protein  38.89 
 
 		 277 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0746  hypothetical protein  38.89 
 
 		 277 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.306684  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2700  hypothetical protein  38.89 
 
 		 277 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2458  hypothetical protein  38.89 
 
 		 277 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.503105  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0912  hypothetical protein  38.89 
 
 		 277 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.342604  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0246  hypothetical protein  38.89 
 
 		 277 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0605  hypothetical protein  38.27 
 
 		 277 aa  110  3e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0424  hypothetical protein  38.27 
 
 		 275 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.482421  normal  0.804892 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3135  hypothetical protein  35.35 
 
 		 284 aa  109  6e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.900855  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3409  hypothetical protein  35.93 
 
 		 270 aa  107  2e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.603479 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3177  hypothetical protein  35.86 
 
 		 273 aa  107  2e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1463  hypothetical protein  33.72 
 
 		 274 aa  107  3e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1786  hypothetical protein  33.72 
 
 		 274 aa  107  3e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3063  hypothetical protein  35.93 
 
 		 270 aa  105  1e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1889  hypothetical protein  34.07 
 
 		 275 aa  104  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.864929  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0625  hypothetical protein  37.25 
 
 		 275 aa  101  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6000  hypothetical protein  36.6 
 
 		 275 aa  99  7e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.117243 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2701  hypothetical protein  36.6 
 
 		 275 aa  99  8e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2672  hypothetical protein  36.6 
 
 		 275 aa  99  8e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.328222  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2061  hypothetical protein  36.6 
 
 		 275 aa  99  8e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0461998  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2725  hypothetical protein  35.95 
 
 		 275 aa  97.4  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.906624  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2597  hypothetical protein  35.95 
 
 		 275 aa  97.4  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.489348  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3966  hypothetical protein  29.01 
 
 		 262 aa  53.1  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0575992  normal  0.14161 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1925  hypothetical protein  27.27 
 
 		 308 aa  51.2  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1924  hypothetical protein  25.16 
 
 		 271 aa  49.7  0.00005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.364642  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4170  hypothetical protein  25.57 
 
 		 312 aa  47.4  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4658  hypothetical protein  26.28 
 
 		 289 aa  46.6  0.0004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6491  hypothetical protein  26.32 
 
 		 283 aa  46.6  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.725464  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0239  hypothetical protein  27.95 
 
 		 295 aa  45.4  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0479  hypothetical protein  27.85 
 
 		 287 aa  44.7  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.323829  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0484  hypothetical protein  27.85 
 
 		 287 aa  44.3  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02215  hypothetical protein  24.05 
 
 		 273 aa  43.9  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.427933  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6000  hypothetical protein  25.79 
 
 		 283 aa  43.9  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5635  hypothetical protein  25.79 
 
 		 283 aa  43.9  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3970  putative acyl-(acyl-carrier protein) desaturase  25.99 
 
 		 309 aa  43.5  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.16555  normal  0.404957 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0121  fatty acid desaturase, type 2  21.29 
 
 		 364 aa  43.5  0.004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00366287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0451  hypothetical protein  27.22 
 
 		 287 aa  42.4  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0378  Conserved hypothetical protein. putative conserved domain  26.85 
 
 		 285 aa  42.4  0.009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00161389  normal  0.0389324 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0199  hypothetical protein  26.85 
 
 		 285 aa  42.4  0.009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19440  hypothetical protein  26.51 
 
 		 271 aa  42.4  0.009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.577003  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0247  hypothetical protein  27.22 
 
 		 287 aa  42  0.01  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.104382 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>