21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0971 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_0971  hypothetical protein  100 
 
 		 242 aa  490  1e-137  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.694676 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1061  hypothetical protein  75.21 
 
 		 243 aa  305  3e-82  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.354212  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3142  hypothetical protein  66.12 
 
 		 231 aa  283  2.0000000000000002e-75  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1430  putative lipoprotein  65.02 
 
 		 227 aa  282  3.0000000000000004e-75  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0047  hypothetical protein  60.16 
 
 		 234 aa  282  4.0000000000000003e-75  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000487124  normal  0.972099 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0020  hypothetical protein  64.46 
 
 		 239 aa  270  1e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.199965 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5375  hypothetical protein  60.08 
 
 		 233 aa  250  2e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000000248774  hitchhiker  0.0000712008 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3704  putative lipoprotein  60.49 
 
 		 233 aa  244  6e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3546  hypothetical protein  72.52 
 
 		 131 aa  196  3e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.222814  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1263  TIR protein  32.09 
 
 		 255 aa  79.7  0.00000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0901664  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1496  TIR protein  32.31 
 
 		 283 aa  78.6  0.00000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.539335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1472  Toll-interleukin receptor  32.31 
 
 		 283 aa  78.6  0.00000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2310  TIR protein  28.15 
 
 		 293 aa  69.7  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000002638 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2269  hypothetical protein  32.23 
 
 		 541 aa  66.2  0.0000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0213435  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0263  hypothetical protein  26.28 
 
 		 275 aa  64.3  0.000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.425608  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0113  TIR protein  27.61 
 
 		 299 aa  63.9  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0221539  hitchhiker  0.00922586 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0804  TIR protein  24.09 
 
 		 265 aa  60.5  0.00000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.859929  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4184  sensor protein  28.44 
 
 		 1048 aa  50.4  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00072831 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5434  TIR protein  36.92 
 
 		 413 aa  48.9  0.00008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.363832  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  24.11 
 
 		 1363 aa  48.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1508  WD-40 repeat protein  23.73 
 
 		 1373 aa  43.9  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000517344 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>