39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_2001 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008701  Pisl_2001  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 
387 aa  744    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1224  AMP-dependent synthetase and ligase  32.3 
 
 
699 aa  81.6  0.00000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1134  regulatory protein, ArsR  32.14 
 
 
250 aa  51.6  0.00003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.92477  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0824  ArsR family transcriptional regulator  34.94 
 
 
251 aa  49.3  0.0001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0741  response regulator receiver protein  40.28 
 
 
210 aa  48.5  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.289134 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2919  ArsR family transcriptional regulator  39.06 
 
 
93 aa  48.1  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.808168  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0769  hypothetical protein  38.24 
 
 
280 aa  47.8  0.0003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05158  transcriptional regulatory protein CpxR  37.84 
 
 
209 aa  47.8  0.0004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4676  ArsR family transcriptional regulator  34.38 
 
 
90 aa  47.8  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0873  ArsR family transcriptional regulator  36.36 
 
 
134 aa  47.4  0.0005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.107087  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3742  ArsR family transcriptional regulator  35.06 
 
 
116 aa  47  0.0006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.102941  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1062  transcriptional regulator, ArsR family  41.27 
 
 
103 aa  47  0.0006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.736924 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1073  regulatory protein, ArsR  33.33 
 
 
252 aa  46.6  0.0007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.866945  normal  0.280253 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1482  hypothetical protein  37.97 
 
 
263 aa  46.6  0.0008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1557  ArsR family transcriptional regulator  35 
 
 
114 aa  45.4  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0493281  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0065  ArsR family transcriptional regulator  38.33 
 
 
99 aa  45.8  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.487326 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3601  response regulator receiver protein  36.49 
 
 
224 aa  45.8  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4960  transcriptional regulator, ArsR family  32.81 
 
 
90 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.850958  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1576  regulatory protein, ArsR  37.14 
 
 
246 aa  45.8  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.041451  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4586  ArsR family transcriptional regulator  32.81 
 
 
90 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0976523  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0274  transcriptional regulator, ArsR family  32.81 
 
 
90 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4975  transcriptional regulator, ArsR family  32.81 
 
 
90 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2811  transcriptional regulator, ArsR family  41.67 
 
 
330 aa  45.1  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.377915  normal  0.0677625 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4024  transcriptional regulator, ArsR family  37.29 
 
 
93 aa  45.1  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0486243  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3384  transcriptional regulator, ArsR family  40.91 
 
 
105 aa  45.1  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.508828  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0018  ArsR family transcriptional regulator  40.68 
 
 
108 aa  45.1  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2041  transcriptional regulator, ArsR family  43.86 
 
 
115 aa  45.1  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.965187  normal  0.400743 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4988  ArsR family transcriptional regulator  31.25 
 
 
96 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4613  ArsR family transcriptional regulator  38.71 
 
 
120 aa  44.7  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.296682 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1697  ArsR family transcriptional regulator  35 
 
 
86 aa  44.7  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000623406  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0562  ArsR family transcriptional regulator  38.33 
 
 
115 aa  44.7  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1060  ArsR family transcriptional regulator  40.98 
 
 
96 aa  44.3  0.004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0466  regulatory protein, ArsR  34.44 
 
 
108 aa  44.3  0.004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1247  ArsR family transcriptional regulator  35.9 
 
 
98 aa  44.3  0.004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0264  ArsR family transcriptional regulator  39.34 
 
 
114 aa  43.5  0.006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.88486  normal  0.727225 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0038  transcriptional regulator, ArsR family  36.51 
 
 
89 aa  43.1  0.007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1047  transcriptional regulator, ArsR family  48.94 
 
 
194 aa  43.5  0.007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0265584 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3443  response regulator receiver protein  32.93 
 
 
223 aa  43.1  0.009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4142  regulatory protein ArsR  32.1 
 
 
114 aa  42.7  0.01  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.668124  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>