26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_3414 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_3414  hypothetical protein  100 
 
 		 454 aa  910    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.951584 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3879  hypothetical protein  34.69 
 
 		 456 aa  194  2e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6042  methyl-accepting chemotaxis protein  31.75 
 
 		 708 aa  57  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4289  hypothetical protein  23.76 
 
 		 549 aa  54.7  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.910751  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5803  hypothetical protein  37.5 
 
 		 550 aa  55.1  0.000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.485501  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4824  hypothetical protein  37.5 
 
 		 550 aa  55.1  0.000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3888  hypothetical protein  37.5 
 
 		 550 aa  55.1  0.000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003239  hypothetical protein  25.48 
 
 		 706 aa  51.6  0.00003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1362  hypothetical protein  43.86 
 
 		 706 aa  51.6  0.00003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3785  hypothetical protein  33.04 
 
 		 696 aa  51.2  0.00004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.546108 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0451  hypothetical protein  42.19 
 
 		 589 aa  50.4  0.00006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.163567  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2936  hypothetical protein  22.17 
 
 		 677 aa  49.7  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.771094 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1849  hypothetical protein  23.53 
 
 		 524 aa  48.9  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.677137  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0516  hypothetical protein  22.4 
 
 		 441 aa  47.4  0.0006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1501  hypothetical protein  33.33 
 
 		 367 aa  47  0.0007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2209  hypothetical protein  26.29 
 
 		 391 aa  47  0.0008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0964  hypothetical protein  27.22 
 
 		 391 aa  45.8  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0530307  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0996  chromosome segregation ATPases-like protein  27.33 
 
 		 1787 aa  46.2  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.75117  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1706  hypothetical protein  34.21 
 
 		 563 aa  45.8  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1216  hypothetical protein  24.06 
 
 		 387 aa  45.1  0.002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0162569  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2288  hypothetical protein  27.22 
 
 		 391 aa  45.8  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.485616  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2737  hypothetical protein  33.33 
 
 		 495 aa  43.9  0.006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.414891  normal  0.112498 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0285  hypothetical protein  34.78 
 
 		 739 aa  43.5  0.007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0987  hypothetical protein  22.55 
 
 		 704 aa  43.1  0.009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0230  hypothetical protein  24.77 
 
 		 476 aa  43.1  0.009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.132063  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0504  hypothetical protein  25.97 
 
 		 723 aa  43.5  0.009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>