74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_4212 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_4212  hypothetical protein  100 
 
 
101 aa  196  1.0000000000000001e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0831  hypothetical protein  40 
 
 
103 aa  68.9  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08096  hypothetical protein  33.67 
 
 
107 aa  63.9  0.0000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2555  hypothetical protein  33.67 
 
 
106 aa  61.6  0.000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0243  hypothetical protein  37.36 
 
 
115 aa  58.2  0.00000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000366291  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2609  hypothetical protein  32.61 
 
 
114 aa  58.5  0.00000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2675  hypothetical protein  34.82 
 
 
112 aa  53.1  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2143  hypothetical protein  34.78 
 
 
113 aa  52.4  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000000242142  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0032  hypothetical protein  33.66 
 
 
102 aa  51.6  0.000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000102998  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0034  hypothetical protein  38.14 
 
 
111 aa  51.2  0.000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00230988  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6386  hypothetical protein  25.51 
 
 
109 aa  50.8  0.000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.171625  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4242  hypothetical protein  33.73 
 
 
107 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.744813  hitchhiker  0.0034155 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4751  hypothetical protein  33.73 
 
 
107 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.10637  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3648  hypothetical protein  37 
 
 
113 aa  48.9  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.801413  normal  0.616396 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0116  hypothetical protein  33.66 
 
 
112 aa  48.1  0.00004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000133344  normal  0.143871 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1227  hypothetical protein  33.73 
 
 
104 aa  47.8  0.00005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.0431183 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3877  hypothetical protein  35.56 
 
 
114 aa  47  0.00009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.598756  normal  0.10934 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0520  hypothetical protein  34.44 
 
 
114 aa  47  0.00009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.149206  normal  0.329373 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0043  hypothetical protein  32.26 
 
 
105 aa  46.2  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00471711  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0797  hypothetical protein  39.44 
 
 
111 aa  46.6  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.891602  normal  0.0353657 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2366  hypothetical protein  31.33 
 
 
114 aa  45.1  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.242324  normal  0.408866 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0056  hypothetical protein  34.94 
 
 
112 aa  45.4  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0233417  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0542  hypothetical protein  34.52 
 
 
111 aa  45.1  0.0003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0025  hypothetical protein  41.43 
 
 
109 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000165828  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5293  hypothetical protein  41.43 
 
 
109 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00134592  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0711  hypothetical protein  31.33 
 
 
114 aa  45.1  0.0003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4005  hypothetical protein  29.29 
 
 
115 aa  45.1  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0541  hypothetical protein  38.71 
 
 
103 aa  45.1  0.0004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000849008  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0093  hypothetical protein  31.73 
 
 
104 aa  44.7  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.790212  hitchhiker  0.0000035436 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0027  hypothetical protein  40 
 
 
109 aa  44.7  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000699023  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0024  hypothetical protein  40 
 
 
109 aa  44.7  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0021  hypothetical protein  40 
 
 
109 aa  44.7  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2269  hypothetical protein  34.04 
 
 
110 aa  44.3  0.0005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.710501  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0020  hypothetical protein  40 
 
 
109 aa  44.7  0.0005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.113689  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0020  hypothetical protein  40 
 
 
109 aa  44.7  0.0005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0020  hypothetical protein  40 
 
 
109 aa  44.7  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00124742  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0022  hypothetical protein  40 
 
 
109 aa  44.7  0.0005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0507  hypothetical protein  27.47 
 
 
100 aa  44.3  0.0006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.845644  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3200  hypothetical protein  34.29 
 
 
100 aa  44.3  0.0006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000000349451  normal  0.470148 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0019  hypothetical protein  39.71 
 
 
109 aa  43.9  0.0007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0215941  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0244  hypothetical protein  33.33 
 
 
118 aa  43.9  0.0007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00191  hypothetical protein  29.47 
 
 
116 aa  43.9  0.0008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0234  hypothetical protein  31.43 
 
 
118 aa  43.5  0.0009  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0255  hypothetical protein  32.94 
 
 
101 aa  43.1  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.287955  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0019  hypothetical protein  37.14 
 
 
109 aa  43.5  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00658876  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0165  hypothetical protein  31.25 
 
 
114 aa  43.1  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1920  hypothetical protein  30.12 
 
 
107 aa  43.1  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1592  hypothetical protein  30.12 
 
 
107 aa  43.1  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.107966  normal  0.0589589 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1179  hypothetical protein  26.6 
 
 
111 aa  42.4  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000863207  normal  0.0112424 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1459  hypothetical protein  31.33 
 
 
108 aa  42.7  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1671  hypothetical protein  32.98 
 
 
110 aa  42.4  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.445968 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0016  hypothetical protein  31.51 
 
 
105 aa  42.4  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1154  hypothetical protein  37.63 
 
 
104 aa  42.7  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.307192 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2349  hypothetical protein  34.74 
 
 
110 aa  42  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.625657  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0066  hypothetical protein  35.42 
 
 
103 aa  42  0.003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0510  hypothetical protein  33.68 
 
 
110 aa  42  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1508  hypothetical protein  34.74 
 
 
110 aa  42  0.003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0500  hypothetical protein  29.73 
 
 
105 aa  41.6  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00615814  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0513  hypothetical protein  29.73 
 
 
105 aa  41.6  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3143  hypothetical protein  31.33 
 
 
107 aa  41.2  0.005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0020  hypothetical protein  35.71 
 
 
108 aa  41.2  0.005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000261671  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0115  hypothetical protein  32.26 
 
 
105 aa  40.8  0.006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1379  hypothetical protein  38.3 
 
 
103 aa  40.8  0.006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.370164  normal  0.0209968 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0111  hypothetical protein  29.47 
 
 
107 aa  40.8  0.006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.452353  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00191  hypothetical protein  29 
 
 
116 aa  40.8  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4056  hypothetical protein  34.85 
 
 
107 aa  40.8  0.007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0251815  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1086  hypothetical protein  28.74 
 
 
111 aa  40.4  0.007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0649  conserved hypothetical protein DUF149  33.75 
 
 
114 aa  40.8  0.007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0145182  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2594  hypothetical protein  29.76 
 
 
106 aa  40.4  0.008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0325916  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1633  hypothetical protein  31.91 
 
 
103 aa  40.4  0.008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1814  hypothetical protein  31.91 
 
 
103 aa  40.4  0.008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.888955  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4902  hypothetical protein  32.98 
 
 
110 aa  40.4  0.008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03086  hypothetical protein  33.33 
 
 
109 aa  40.4  0.008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2270  hypothetical protein  34.72 
 
 
103 aa  40.4  0.009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>