More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0996 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_0996  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  100 
 
 
189 aa  366  1e-101  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.643344  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0524  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  58.6 
 
 
192 aa  230  9e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5115  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  56.22 
 
 
189 aa  220  9e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.316218 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2056  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  54.84 
 
 
193 aa  219  3e-56  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2433  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  57.07 
 
 
191 aa  214  5.9999999999999996e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.382546 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1119  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  52.17 
 
 
188 aa  201  4e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.628866 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02065  putative transmembrane protein  55.61 
 
 
193 aa  180  1e-44  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.808084  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0224  hypothetical protein  46.2 
 
 
212 aa  171  9e-42  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1097  hypothetical protein  44.51 
 
 
197 aa  166  1e-40  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.177392 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0570  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  26.04 
 
 
217 aa  91.7  5e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3842  putative dITP- and XTP- hydrolase  31.25 
 
 
197 aa  90.5  1e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.784378 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0847  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  34.03 
 
 
196 aa  90.9  1e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0972669 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3913  putative dITP- and XTP- hydrolase  30.21 
 
 
197 aa  89.7  2e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03286  predicted antibiotic transporter  30.21 
 
 
197 aa  89.4  3e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.541107  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0280  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  30.21 
 
 
197 aa  89.4  3e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3634  putative dITP- and XTP- hydrolase  30.21 
 
 
197 aa  89.4  3e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0278  putative dITP- and XTP- hydrolase  30.21 
 
 
197 aa  89.4  3e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4746  putative dITP- and XTP- hydrolase  30.21 
 
 
197 aa  89.4  3e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.886657 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3716  putative dITP- and XTP- hydrolase  30.21 
 
 
197 aa  89.4  3e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03239  hypothetical protein  30.21 
 
 
197 aa  89.4  3e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.705152  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3890  putative dITP- and XTP- hydrolase  30.21 
 
 
197 aa  89.4  3e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0054  integral membrane protein, MarC family  31.19 
 
 
216 aa  87.4  1e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.207585  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0055  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  31.96 
 
 
218 aa  86.7  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0468967  normal  0.907646 
 
 
-
 
NC_002936  DET1449  MarC membrane protein  30.32 
 
 
203 aa  85.1  6e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000727679  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2303  hypothetical protein  28.43 
 
 
215 aa  84.7  7e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.45168  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3941  putative dITP- and XTP- hydrolase  29.69 
 
 
197 aa  83.6  0.000000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4140  putative dITP- and XTP- hydrolase  29.69 
 
 
197 aa  84  0.000000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1818  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  29.44 
 
 
205 aa  82.8  0.000000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.397202 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2164  hypothetical protein  28.96 
 
 
214 aa  81.3  0.000000000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.033055  normal  0.026113 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1323  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  28.86 
 
 
204 aa  80.5  0.00000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.199618 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2648  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  32.81 
 
 
197 aa  80.1  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1962  hypothetical protein  27.87 
 
 
214 aa  80.1  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2071  hypothetical protein  27.87 
 
 
214 aa  80.1  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0381177  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00283  antibiotic transporter  27.46 
 
 
194 aa  80.1  0.00000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2645  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  30.26 
 
 
201 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1278  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  26.83 
 
 
212 aa  80.1  0.00000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1391  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  30.73 
 
 
198 aa  80.1  0.00000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1098  hypothetical protein  27 
 
 
209 aa  79.3  0.00000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2703  hypothetical protein  28.35 
 
 
214 aa  79.3  0.00000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000872945  hitchhiker  0.000692167 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3058  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  31.25 
 
 
197 aa  79  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.429511  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0603  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  30.23 
 
 
201 aa  79  0.00000000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.708242  normal  0.450021 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0635  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  30.23 
 
 
201 aa  78.6  0.00000000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.586575 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3626  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  29.53 
 
 
198 aa  78.6  0.00000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.416857  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0428  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  30.37 
 
 
219 aa  78.2  0.00000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.157732  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1875  hypothetical protein  29.23 
 
 
215 aa  78.2  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.67019  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1397  hypothetical protein  29.23 
 
 
215 aa  78.2  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.126468  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1580  hypothetical protein  29.23 
 
 
215 aa  78.2  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.439502  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1938  hypothetical protein  29.23 
 
 
215 aa  78.2  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.476555 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1881  hypothetical protein  29.23 
 
 
215 aa  78.2  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.66407 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01216  predicted inner membrane protein  26.63 
 
 
215 aa  77.8  0.00000000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2408  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  26.63 
 
 
215 aa  77.8  0.00000000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000022238  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1407  hypothetical protein  26.63 
 
 
215 aa  77.8  0.00000000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.090251  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2386  hypothetical protein  26.63 
 
 
215 aa  77.8  0.00000000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.377039  hitchhiker  0.00000152892 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1900  hypothetical protein  26.63 
 
 
215 aa  77.8  0.00000000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.382554  normal  0.103806 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01226  hypothetical protein  26.63 
 
 
215 aa  77.8  0.00000000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1390  hypothetical protein  26.63 
 
 
215 aa  77.8  0.00000000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.718233  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1351  hypothetical protein  26.63 
 
 
215 aa  77.8  0.00000000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000939425  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1726  hypothetical protein  26.63 
 
 
215 aa  77.8  0.00000000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.345038  normal  0.523448 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2196  hypothetical protein  28.87 
 
 
214 aa  77.8  0.0000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.522591  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1961  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  33.55 
 
 
213 aa  77.4  0.0000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1498  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  30.64 
 
 
219 aa  77.4  0.0000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2843  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  30.73 
 
 
212 aa  76.6  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1059  hypothetical protein  26.5 
 
 
209 aa  77  0.0000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.728304  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03019  hypothetical protein  29.32 
 
 
212 aa  76.6  0.0000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0451  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  27.89 
 
 
219 aa  77  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2476  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  27.6 
 
 
242 aa  75.9  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1228  membrane transporter, MarC family  30.85 
 
 
203 aa  75.9  0.0000000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.000000000000452598  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2813  hypothetical protein  29.69 
 
 
197 aa  75.5  0.0000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.864599  normal  0.0801179 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2036  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  27.6 
 
 
226 aa  75.5  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0819991  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2011  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  27.6 
 
 
226 aa  75.5  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0268  putative dITP- and XTP- hydrolase  29.32 
 
 
197 aa  75.5  0.0000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.116501  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0561  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  27.91 
 
 
207 aa  75.5  0.0000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.143657 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1251  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  29.73 
 
 
203 aa  75.1  0.0000000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000866197  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0587  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  29.55 
 
 
235 aa  75.1  0.0000000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0123495 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1929  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  26.94 
 
 
215 aa  73.6  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.604403  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0686  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  32.93 
 
 
216 aa  74.3  0.000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.666037 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2045  hypothetical protein  27.17 
 
 
207 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00255531  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3498  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  29.17 
 
 
202 aa  73.9  0.000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000046015  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2873  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  36.09 
 
 
213 aa  73.9  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0453774 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1880  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  27.92 
 
 
209 aa  73.6  0.000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2242  hypothetical protein  25.76 
 
 
212 aa  73.2  0.000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.177472  normal  0.0116098 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4435  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  28.5 
 
 
201 aa  73.2  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000587545  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1556  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  30.11 
 
 
216 aa  73.2  0.000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0953  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  27.75 
 
 
207 aa  73.2  0.000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.838216  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0218  putative dITP- and XTP- hydrolase  28.21 
 
 
197 aa  73.6  0.000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0906  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  29.38 
 
 
203 aa  73.2  0.000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.201578  normal  0.0510602 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3746  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  27.69 
 
 
197 aa  73.2  0.000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000432224 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002930  multiple antibiotic transporter  27.75 
 
 
212 aa  72.4  0.000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000449619  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0693  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  25.76 
 
 
209 aa  72.8  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1240  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  25.38 
 
 
209 aa  72.4  0.000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.185324  normal  0.313526 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0124  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  27.98 
 
 
197 aa  72.4  0.000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0309852  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0614  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  29.38 
 
 
200 aa  72  0.000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1406  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  26.21 
 
 
213 aa  72  0.000000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0118  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  28.5 
 
 
197 aa  72.4  0.000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000568388  normal  0.0497188 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1694  hypothetical protein  26.09 
 
 
210 aa  72  0.000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0657108 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0123  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  28.5 
 
 
197 aa  72  0.000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0129  hypothetical protein  27.98 
 
 
197 aa  71.6  0.000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4828  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  28.42 
 
 
200 aa  71.6  0.000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1410  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  29.12 
 
 
231 aa  71.6  0.000000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2143  hypothetical protein  25.82 
 
 
203 aa  71.2  0.000000000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0929738  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>