42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0459 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_0459  DNA repair protein RecO  100 
 
 		 241 aa  491  9.999999999999999e-139  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.336833  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3301  DNA replication and repair protein RecO  38.75 
 
 		 224 aa  167  1e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.729865 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4044  DNA repair protein RecO  38.93 
 
 		 231 aa  163  2.0000000000000002e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00013067 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0462  DNA repair protein RecO  36.36 
 
 		 243 aa  162  5.0000000000000005e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1197  DNA repair protein RecO  36.18 
 
 		 230 aa  153  2e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02500  possible DNA repair protein RecO  33.61 
 
 		 238 aa  140  1.9999999999999998e-32  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.231725  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1674  hypothetical protein  31.86 
 
 		 217 aa  119  3e-26  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.515163 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2156  DNA repair protein RecO  30.25 
 
 		 238 aa  113  3e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0706  DNA repair protein RecO  28.4 
 
 		 237 aa  103  2e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2009  DNA repair protein RecO, putative  27.8 
 
 		 245 aa  97.4  2e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1504  DNA repair protein RecO  27.87 
 
 		 248 aa  74.3  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0430427  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2556  DNA repair protein RecO  30.82 
 
 		 261 aa  65.1  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.105743  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0194  DNA repair protein RecO  32.05 
 
 		 264 aa  62.4  0.000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0406  DNA repair protein RecO  25.83 
 
 		 254 aa  60.1  0.00000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000965492  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1031  DNA repair protein RecO  22.32 
 
 		 262 aa  58.9  0.00000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2799  DNA repair protein RecO  26.67 
 
 		 261 aa  58.2  0.0000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.428956  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2393  DNA repair protein RecO  26.62 
 
 		 261 aa  56.2  0.0000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3024  DNA repair protein RecO  23.11 
 
 		 248 aa  54.7  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.42951  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0203  DNA repair protein RecO  24.34 
 
 		 261 aa  53.5  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0359781 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1969  recombination protein O, RecO  24.5 
 
 		 283 aa  53.1  0.000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4149  DNA repair protein RecO  22.95 
 
 		 248 aa  52.8  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0297878  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0821  DNA repair protein RecO  22.62 
 
 		 248 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000159175  decreased coverage  1.09268e-22 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1346  DNA repair protein RecO  23.33 
 
 		 248 aa  51.6  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000264775  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4320  DNA repair protein RecO  22.22 
 
 		 248 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.2531e-58 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4415  DNA repair protein RecO  22.62 
 
 		 248 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000274955  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4431  DNA repair protein RecO  22.22 
 
 		 248 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000532421  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4522  DNA repair protein RecO  22.22 
 
 		 248 aa  50.4  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000535932  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4198  DNA repair protein RecO  22.22 
 
 		 248 aa  50.4  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4036  DNA repair protein RecO  22.22 
 
 		 248 aa  50.4  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000824167  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4046  DNA repair protein RecO  22.22 
 
 		 248 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0418325  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0736  DNA repair protein RecO  31.37 
 
 		 246 aa  48.9  0.00007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.394466  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4378  DNA repair protein RecO  21.69 
 
 		 248 aa  48.5  0.00009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000495524  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2419  DNA repair protein RecO  20.59 
 
 		 263 aa  48.5  0.00009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01719  DNA repair protein RecO  22.73 
 
 		 240 aa  47  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.748158  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2037  recombination protein O, RecO  28.77 
 
 		 264 aa  46.2  0.0004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0117854  normal  0.79539 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0781  DNA replication and repair protein RecO  21.72 
 
 		 259 aa  45.8  0.0006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.672101  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0990  DNA replication and repair protein RecO  21.59 
 
 		 258 aa  45.8  0.0006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000715553  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1066  DNA replication and repair protein RecO  21.69 
 
 		 251 aa  43.9  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1558  DNA repair protein (recombination protein O)  23.31 
 
 		 250 aa  43.9  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4273  DNA repair protein RecO  18.92 
 
 		 273 aa  43.9  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0596  DNA repair protein RecO  26.21 
 
 		 256 aa  42.4  0.006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00201329 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2475  DNA repair protein RecO  21.49 
 
 		 256 aa  42.4  0.006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000834216  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>