40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_1352 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_1352  membrane protein TctB, putative  100 
 
 		 152 aa  296  8e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.132061  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3967  membrane protein TctB, putative  80.26 
 
 		 152 aa  248  2e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.605379  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4233  membrane protein TctB, putative  79.61 
 
 		 152 aa  240  5e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4304  hypothetical protein  75 
 
 		 152 aa  206  1e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.836999  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4394  tricarboxylate transport protein TctB  76.97 
 
 		 152 aa  192  2e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.837927 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1417  tricarboxylate transport protein TctB, putative  75 
 
 		 161 aa  190  7e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.342625  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1057  tricarboxylate transport protein TctB  75 
 
 		 152 aa  186  7e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54550  hypothetical protein  62.42 
 
 		 156 aa  181  3e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000543729  normal  0.0724401 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4767  hypothetical protein  62.42 
 
 		 156 aa  181  3e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.433731  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49470  tripartite tricarboxylate transporter small hypothetical protein  53.64 
 
 		 152 aa  140  8e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0240129  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1826  membrane protein TctB, putative  39.19 
 
 		 167 aa  102  2e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2899  tricarboxylic transport  38.62 
 
 		 144 aa  82  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1456  hypothetical protein  40.32 
 
 		 147 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0155  TctB protein  38.46 
 
 		 147 aa  81.3  0.000000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3086  tricarboxylic transport  38.73 
 
 		 143 aa  80.9  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2966  tricarboxylic transport  38.73 
 
 		 143 aa  80.9  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00298616 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2983  tricarboxylic transport  38.73 
 
 		 143 aa  80.9  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.545092 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1362  tricarboxylic transport  35.21 
 
 		 142 aa  79.7  0.00000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4434  putative tricarboxylic transport membrane protein  31.29 
 
 		 146 aa  79.7  0.00000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2931  tricarboxylic transport  38.03 
 
 		 143 aa  79  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.331411  normal  0.167192 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2582  hypothetical protein  32.39 
 
 		 142 aa  75.9  0.0000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.909963  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3343  tricarboxylic transport  34.97 
 
 		 143 aa  67  0.00000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.363295  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0903  putative tricarboxylic transport membrane protein  26.49 
 
 		 147 aa  64.7  0.0000000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.530268  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1637  TctB protein  32.65 
 
 		 145 aa  62.8  0.000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0733  hypothetical protein  31.47 
 
 		 143 aa  62  0.000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.59707  decreased coverage  0.00107456 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0725  putative tricarboxylic transport membrane protein  34.51 
 
 		 149 aa  62  0.000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1454  putative tricarboxylic transport membrane protein  30.58 
 
 		 151 aa  57.8  0.00000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3855  putative tricarboxylic transport membrane protein  29.63 
 
 		 150 aa  47.4  0.00007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.760581  hitchhiker  0.000000201625 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1800  hypothetical protein  25.19 
 
 		 146 aa  46.6  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.490656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3298  integral membrane protein  26.32 
 
 		 168 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.172548  normal  0.0280313 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3236  integral membrane protein  26.32 
 
 		 168 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.687326  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2823  putative tricarboxylic transport membrane protein  30.83 
 
 		 143 aa  45.8  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0616705 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3247  integral membrane protein  26.32 
 
 		 168 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.461302  normal  0.795605 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1066  hypothetical protein  30.97 
 
 		 203 aa  44.7  0.0005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.294477  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3501  integral membrane protein  29.03 
 
 		 166 aa  43.5  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.543403  normal  0.33628 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8067  hypothetical protein  28.19 
 
 		 178 aa  42.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2074  hypothetical protein  25.81 
 
 		 169 aa  42.4  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5628  small permease component of tripartite tricarboxylate transporter (TctB)  25 
 
 		 179 aa  40.8  0.007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0795679  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3918  putative tricarboxylic transport membrane protein  30.33 
 
 		 165 aa  40.4  0.008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0635614  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0072  hypothetical protein  28.38 
 
 		 157 aa  40.4  0.008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0377393  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>